Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0028900
Sequence Length
411 nt
GC Content
0.5596
ACAGGGUCUCACUCUGCCACCCAGGCUGGAGUACAGUGACAGAGUCUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCAGGCUCAAGUGAUCUUCCCACCUCAGCCUCCCAAGGAGCUGGGAUUACAGACGUACUCUGGCCUCUUCUGCGUGGUGGUCAACCCCUAUAAACACCUGCCCAUCUACUCGGAGAAGAUCGUCGACAUGUACAAGGGCAAGAAGAGGCACGAGAUGCCGCCUCACAUCUACGCCAUCGCAGACACGGCCUACCGGAGCAUGCUUCAAGGCUGAAGUGCAGUGGUGCCAUCUCGGCUCCCUGCAACCUCCGCCUCCUGGGCUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUAUAGGUGUGGACUGUCAUGUCAAGCUAAUUUUAAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-133.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -140.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 92.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((........)))....((((((((((((.((.....(((((((((((.(((((.....))).....(((((...(((.......)))...)))))....)))))))))))))....))))))))))))))..(((((((((((...................(((((...(((((((.((...)).))))...)))...)))))(((.(((((..........)))))...))).))))).))))))..((((((...((((....)))).))))))...(((((.((.(((.....))).)))))))...(((((..((((((((...(((.......)))...))))(((((......)))))...)))).)))))))))(.....................)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((((..,|||}|},.,,,,((((((((((((.((.....(((((((((((.(((((.....))).....(((((...(((.......))).,.)))))....)))))))))))))....))))))))))))))..,,{(((((({({,,.,|.|,,,,.......(((((...(((((((.((...}).))))...)))...))))).|..(((((,.,,,,,{,.}}}}}...|||.||||,.,|||},..(((,,..}}|,{{..}})|,,.((((,((.((((((.((.(((.....))).))))))}.}.}}.)}}}..,||||,...|||...,,,.))),}}}}}}{((((......))))}.,,}))),))}))})})},})}|................)
Back