Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0030500
Sequence Length
1274 nt
GC Content
0.3948
GAGAAUCGCUUGAACCCAGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGCACCACUGCCCUCCAGCAUAGACAACAGAGCAAGACUCCAUCUCAAACAACAACAACAAAAAUCAUUUUGAACAAAUGCAUUUAAAUAUAUUUGUCUUUCCACCCUUUUUGGGGUGUUAGGGUGAUGGACAUAUAAUUAUUUUUCUUAUUGAUAUUCACACUGUCUCGUAUUUGACCAGAUAGAACCCUAGUAUAAUAUUUUGGUAUGCAGUUUUCUAGACUUUUAGAAAUGUACACACAAACAUAUAAAAUGAAGACAAAUACUUUAUGACAAAUAUUUUAAUCAGCUUUAUUGAGGUAUAAUCUAUAUAAAGUAAAACUCACCGAUUUAAAACAAAUUCAAGUUUUUUUAAGUGUACAGCUUGAGUGAGUUUUUUCAACUUAAAAAAUUUAUUUCUUAAUUGACAAAUAAUCAUACAUGUUCAUGGGGUCCAUAAUGAUUUUUUUAGUUGUUUGGUUGGAUGGUUUUGAGACAGGGUCUCGCUCUGUGGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCAUGAUUACAACUCACUGCAGCCUUGACCUCCUGGGCUCUAGCCAUCUUCCCGUCUUAGCCUCCUGAGUAGCUGGAACCGUAGGCAUGCACCACCGUGCCAGGCUAAUUUUUAAUUUUUUUACAGAGACAGGGGCUUCUUAUGUUGCCCAGGUUGGUCUUGAACUCCUGGCCUCAAGGGAUCCUCCUGUCUCAGCUUCCCACAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGAGUCCAGCUCUUAGUAAUGUUUUGAUAUUAAUACAUAUAAUGUGUGGGGAGAUAAGAUCAGGAUAAUUAGCAUAUCCAUCAUCUCAAGCAUUUGCCAUUACUUUUAUUUUGCUACUUCCUAUAUAAUGACAUUUAUCAUCUCUUUGUGUUGGGAACAUUCAAUGUCCUUCUUCUAGCUCUUGGAAACGAUGUAAUAUUUUAUUGUUCACUUUACUCAUCCUAUAGUGGAUAGAACAUUCUUAAUGAGUUUUGACAAAUGUAUACAGUCUUGUAAGCACCACCAUGACCACAGGGAAUACUUUUAUCACCCCGAAAGGUGGUGCCUCUUACCUCUUAUGUACCUCUUCUGUGCCUCUUACUAAUCCAUUCCUUUCCUUGCCACUGGCAACUCUUUUUUUUAAUUUUUUUGAGACAGCGUCUCACUCUGUCACUCAGGCUGGAGUGCAAUGGUGCAGUCUCGGCUCACUGCAGCCUCUGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-377.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -404.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 261.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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