Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0030900
Sequence Length
1260 nt
GC Content
0.4786
GCUGGUCUCGAACCGCUGACCUCAAGUGAUUCGCCUGGCUUGGUCUCCCAAAGUGCUCAGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCUGGCUUAUUUAGGGUCUUGAUGGCAUACUUUAAGGGAUGGCCUUUUUGCUCUCUAGGUCUUCUCCUUCCACUCCUGACCUUUCAACUUUUAACCCUGGCCACACAAUGGAGGAAAGACUGAAUUUAGAGAAAGGCAGGCAAGAAUUUGAAAGAAACCUUGUAUGUGAUCCAAGGACAGAGGAAGAAGCUGCUCACAGUGGCUGAAAGGGGAGGUCGGACAUCUGUGACUUGUAUCAGGGUUUCAGGGGCUAAGGAGGAACAACCUCAUCAAAGUUGCUAGGAAAGGGCCAUAGAGGCCAGGUAUGGCAGGUCAUACCUGUAAUCCCAGCAAUUUGGGAGGCUGAGGUGGGGGGAUGGCUUGAAGUCAGGAGUUUGAGACCAGAGUGGGCAACAUAGCGAGGCACCAUCUCUACAAAAAAAUUUUUAAAAUGAGCUGGGCAUGGUGGCAUGCAUCUGUAGUCCUAGUUAUUCAGGAGGUUGAGUGAGGCAGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGGCUGCCGUGGGCCCUGAUUGCAUCACUGUUCUCUAGCCUGGGCAACAGAGUGAGACUCUGUCUCAAAAAAAAGGUGAGGGGCAUAGAACUUUACUGUACCAGGCUGAAAAAUACAAGGCCCAGAGAGGGCAAGUGACUUGCCUAGCAUCACCCAGCGAGUUUUGGGCAGAGCUGAGACUUGUAACUCGAAGACCUAAGGAUCUUCCACAGGCUAAUGAAUAGCUUGUUUGUGCUCAAGGGAUGAAGCAGUGAGUUGUUAGGACAGGACUGUGAAUAGGGCUGACAUAUUCAGAUGUGUCAAACAUCGCUAAUGCCAUCUCUGAGUAAAUUAGGCUUCAAACAGAUCGGGAUUCUAAUCCUGGUUCCCCAACUUUUGCAAGGGAGGGCCUUGCAUUUACCUUUCAAGACCCCGAUAGGCUUAGCAGGAAAAUGGGAAUAAUAGAUAAUGCCACUCUUUCAUCCUUGGACUUUUUGUCUAAUUAUAUGAAUUUAUCUGUAGGAUAAAUUCCCAGAAAUGCGCUUGCUGAGUUAAAGGGCAUGCGUAUCUAAAAUUAAUAGAUAUUGCAAAUGACUGGCUAAAGACAUUGCAGACCAGGUGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGCAGCAGGUGGGUCACCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-471.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -495.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 285.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.....))))..).)((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((((((..(((((((((.((........((((.....))))...((.(((((((((((.((((......((((.((((((..........(((..(((.....)))))).....(((....))).))))))))))(((....)))...(((((((......((((.((((.((((((...((..((.(((.(((...)))...))).)).))...).)))))..)))).)))))))))))((.((((...((((.....)))).....)))).)))))).)))))).)))))))((((((((......))))))))...((((((....))))))....(((((.((((..(((((...)))))(((((((((.(((((((..((((...((((((....(((.(((....................))).))).(((((((((........((((((((..((((((((....))))))))......))))))))((((((......)))))).)))))))))(((((((.(((((((.(((((((.((((((((((((((((((...)))))))............((((((..(...)..))))))))).))))))))...........((((.....))))....(((((((...((.((((((.(((((((((((......))))))))))).....(((((((...)).))))).((((((((.....))))))))(((....)))))).))).)).)))))))...))))))))).))))).)))))))(((((((....))))))).....)))))).))))..))))).))...))))))))).....(((((((((....))))))))))))).)))))(((((((.....)))))))....))..))))))))).))))))(((((((((....(((((((.((((((((.........(((((..((((((.....))))))....))))).)))))))).......)))))))........))))))))).............(((((((.......)))))))(((((.((.((......)).)))))))..)))))))).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{(((.....,}}),,).)((((.((((((((((({,(((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((((((..(((((((((.((....,,...{{{,,.{{{||,...{{,{{{{|||{{(({(((({...((((((,{((((({,.{(({...(((,,((......|||{|,.....||,..}}},..,,,,))))))..|}},.}}},,,|{((((({{..,,{{,{.((((.(((((,...{,,.((.(((.(((...)))...))).)).))...,.)))))..)))),))))))))))))))}|..,}}||||,....||||.,,,,||||{||,|||.,,||||.,,,,)))|((((((({....})))))))}...|||{||,,,,))))))}}..{((((,((((,.(((((...)))))(((((((((.(((((((..((((...((((((,,{.(((.(((.....,,.....,,,.....))).)))|(((({{{{|.,||.,,.{(((((((..((((((((....)))))))).,,,,.)))))))|((((((......)))))},))))))})}{((((((.(((((((.(((((((.((((((((({,(((((((...}))))))...........{((((((..{...}..)))))))}}.))))))))...........((((.....))))..,,(((((((.,.((.((((((.(((((((((((......))))))))))).....(((((((...)).))))).((((((((.....)))))))){{{....}}}))).))).)),))))))),,,))))))))).))))).))))))|(((((((....))))))),..,.)))))).))))..))))).))...))))))))).....{((((((((....))))))))))))).}))),(((((((.....)))))))....))..))))))))).))))||(((((((((....(((((((..,,{{,,..........{{{{{..((((((.....))))))....}}}}|,{(((({...}))))})))))))........))))))))),,....,,,,.||(((((((.......))))))}{((|{{((.((......)).))))))),.)))))))).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))))))))))).))))
Back