Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0031000
Sequence Length
1246 nt
GC Content
0.4767
GCUGGUCUCGAACCGCUGACCUCAAGUGAUUCGCCUGGCUUGGUCUCCCAAAGUGCUCAGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCUGGCUUAUUUAGGGUCUUGAUGGCAUACUUUAAGGGAUGGCCUUUUUGCUCUCUAGGUCUUCUCCUUCCACUCCUGACCUUUCAACUUUUAACCCUGGCCACACAAUGGAGGAAAGACUGAAUUUAGAGAAAGGCAGGCAAGAAUUUGAAAGAAACCUUGUAUGUGAUCCAAGGACAGAGGAAGAAGCUGCUCACAGUGGCUGAAAGGGGAGGUCGGACAUCUGUGACUUGUAUCAGGGUUUCAGGGGCUAAGGAGGAACAACCUCAUCAAAGUUGCUAGGAAAGGGCCAUAGAGGCCAGGUAUGGCAGGUCAUACCUGUAAUCCCAGCAAUUUGGGAGGCUGAGGUGGGGGGAUGGCUUGAAGUCAGGAGUUUGAGACCAGAGUGGGCAACAUAGCGAGGCACCAUCUCUACAAAAAAAUUUUUAAAAUGAGCUGGGCAUGGUGGCAUGCAUCUGUAGUCCUAGUUAUUCAGGAGGUUGAGUGAGGCAGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGGCUGCCGUGGGCCCUGAUUGCAUCACUGUUCUCUAGCCUGGGCAACAGAGUGAGACUCUGUCUCAAAAAAAAGGUGAGGGGCAUAGAACUUUACUGUACCAGGCUGAAAAAUACAAGGCCCAGAGAGGGCAAGUGACUUGCCUAGCAUCACCCAGCGAGUUUUGGGCAGAGCUGAGACUUGUAACUCGAAGACCUAAGGAUCUUCCACAGGCUAAUGAAUAGCUUGUUUGUGCUCAAGGGAUGAAGCAGUGAGUUGUUAGGACAGGACUGUGAAUAGGGCUGACAUAUUCAGAUGUGUCAAACAUCGCUAAUGCCAUCUCUGAGUAAAUUAGGCUUCAAACAGAUCGGGAUUCUAAUCCUGGUUCCCCAACUUUUGCAAGGGAGGGCCUUGCAUUUACCUUUCAAGACCCCGAUAGGCUUAGCAGGAAAAUGGGAAUAAUAGAUAAUGCCACUCUUUCAUCCUUGGACUUUUUGUCUAAUUAUAUGAAUUUAUCUGUAGGAUAAAUUCCCAGAAAUGCGCUUGCUGAGUUAAAGGGCAUGCGUAUCUAAAAUUAAUAGAUAUUGCAAAUGACUGGCUAAAGACAUUGCAGACCAGGUGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGCAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-453.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -477.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 290.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.......(((.((((.......)))).)))))(((.(((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((((((..(((((((((.((........((((.....))))...((.(((((((((((.((((......((((.((((((..........(((..(((.....)))))).....(((....))).))))))))))(((....)))...(((((((......((((.((((.((((((...((..((.(((.(((...)))...))).)).))...).)))))..)))).)))))))))))((.((((...((((.....)))).....)))).)))))).)))))).)))))))((((((((......))))))))...((((((....))))))....(((((.((((..(((((...)))))(((((((((.(((((((..((((...((((((....(((.(((....................))).))).(((((((((........((((((((..((((((((....))))))))......))))))))((((((......)))))).)))))))))(((((((.(((((((.(((((((.((((((((((((((((((...)))))))............((((((..(...)..))))))))).))))))))...........((((.....))))....(((((((...((.((((((.(((((((((((......))))))))))).....(((((((...)).))))).((((((((.....))))))))(((....)))))).))).)).)))))))...))))))))).))))).)))))))(((((((....))))))).....)))))).))))..))))).))...))))))))).....(((((((((....))))))))))))).)))))(((((((.....)))))))....))..))))))))).))))))(((((((((....(((((((.((((((((.........(((((..((((((.....))))))....))))).)))))))).......)))))))........))))))))).............(((((((.......)))))))(((((.((.((......)).)))))))..)))))))).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.{{{{.,{,,.{{{{,......})}),)),))(({,(((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((((((..(((((((((.((....,,...{{{,,.{{{||,...{{,{{{{|||{{(({(((({...((((((,{((((({,.{(({...(((,,((......|||{|,.....||,..}}},..,,,,))))))..|}},.}}},,,|{((((({{..,,{{,{.((((.(((((,...{,,.((.(((.(((...)))...))).)).))...,.)))))..)))),))))))))))))))}|..,}}||||,....||||.,,,,||||{||,|||.,,||||.,,,,)))|((((((({....})))))))}...|||{||,,,,))))))}}..{((((,((((,.(((((...)))))(((((((((.(((((((..((((...((((((,,{.(((.(((.....,,.....,,,.....))).)))|(((({{{{|.,||.,,.{(((((((..((((((((....)))))))).,,,,.)))))))|((((((......)))))},))))))})}{((((((.(((((((.(((((((.((((((((({,(((((((...}))))))...........{((((((..{...}..)))))))}}.))))))))...........((((.....))))..,,(((((((.,.((.((((((.(((((((((((......))))))))))).....(((((((...)).))))).((((((((.....)))))))){{{....}}}))).))).)),))))))),,,))))))))).))))).))))))|(((((((....))))))),..,.)))))).))))..))))).))...))))))))).....{((((((((....))))))))))))).}))),(((((((.....)))))))....))..))))))))).))))||(((((((((....(((((((..,,{{,,..........{{{{{..((((((.....))))))....}}}}|,{(((({...}))))})))))))........))))))))),,....,,,,.||(((((((.......))))))}{((|{{((.((......)).))))))),.)))))))).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))
Back