Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NAPEPLD_0001200
Sequence Length
1421 nt
GC Content
0.4272
UUCUUCACCAAAGGACAUGGAUGAAAAUGAAAGCAACCAGUCUCUGAUGACAAGCAGCCAAUAUCCUAAAGAAGCAGUAAGAAAACGUCAAAAUUCAGCACGGAAUUCCGGAGCAAGUGAUUCUUCUAGGUUUUCUAGGAAAAGCUUCAAACUGGAUUAUAGACUAGAAGAAGAUGUAACUAAAUCCAAGAAAGGAAAAGAUGGGAGAUUUGUGAAUCCGUGGCCAACAUGGAAAAACCCCUCUAUUCCAAAUGUUCUCAGAUGGCUGAUAAUGGAGAAAGAUCACAGCAGUGUUCCAAGUUCUAAAGAGGAACUAGACAAAGAACUCCCAGUGCUUAAGCCAUAUUUUAUCACUAACCCUGAAGAAGCUGGAGUGAGGGAAGCUGGCUUAAGAGUCACAUGGCUGGGACAUGCCACGGUAAUGGUGGAAAUGGAUGAGCUCAUAUUUCUCACGGAUCCCAUCUUUAGCUCUCGUGCUUCACCAUCGCAGUACAUGGGUCCAAAGCGAUUUCGUCGUUCCCCGUGCACAAUAAGUGAACUCCCUCCAAUAGAUGCGGUCCUUAUCAGUCACAACCACUAUGACCAUCUGGACUACAAUUCUGUCAUUGCUUUGAAUGAGCGAUUUGGUAAUGAGUUGAGAUGGUUUGUGCCUUUGGGUCUCCUUGACUGGAUGCAAAAAUGUGGCUGUGAGAAUGUGAUUGAGUUGGACUGGUGGGAGGAGAAUUGUGUCCCCGGACAUGAUAAGGUCACUUUUGUCUUUACACCUUCCCAGCACUGGUGUAAAAGGACUCUAAUGGAUGACAACAAGGUGCUAUGGGGCAGCUGGUCUGUCUUGGGGCCUUGGAAUCGAUUUUUUUUCGCAGGAGAUACUGGUUAUUGCCCUGCUUUUGAAGAGAUAGGAAAAAGAUUUGGACCUUUUGACCUUGCAGCUAUUCCCAUCGGAGCUUAUGAACCGAGGUGGUUUAUGAAAUACCAGCAUGUAGACCCAGAAGAAGCUGUAAGGAUUCACACUGAUGUCCAAACAAAGAAAUCUAUGGCAAUUCACUGGGGAACUUUUGCCUUAGCAAAUGAGCAUUACUUAGAGCCUCCAGUGAAGCUGAAUGAAGCUCUAGAGAGAUACGGACUUAACGCUGAAGAUUUUUUUGUCUUGAAGCAUGGAGAAUCAAGAUACCUAAAUAAUGAUGAUGAAAACUUUUAAUAAAUAAUUUCCUGAGGUGAAAAACCGAUAUUGAAGAUUCAUUUUUCUUUUUUCCAUUCUUCAGGACCUUCGGCAAGAUGUGAAUCAAGAUGUUAGGUUUAUGGUGAGUUAGCUUUGAGGUGUGUUGCCCUAAUACUAGCCAGCGUUGUUGUAGCCAUAUUCCCUGCUGCUGCACGCCGAAUUGAAAAUCCAUCUCUUACCUCUUCUCUAUGAAGCAAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-399.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -424.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 367.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......((((.(((.((..........)).)))))))(((........))).............((((((...(((..(((((........((.(((....)))..))......(((((((((((..(((((.............)))))..))...)))))))))))))).......(((......)))((((((((((..(((((((.((((((.....)))))).....(((((.((((((....(((((((.(((.(((((((((...(((..(((....(.(((((.((((((.....)))))).).....)))).)...))))))...))))....))))))))...))).))))..)))))))))))....(((((....))))).((((((.(..(((.((((.......))))..)))..).))).))).....)))))))))))))))))...)))..))))))..((((.((......((((((((((.(((((.((((((((..(.(((((((.......(((((.(((.........((((...(((((((((.((((...((((((((.((((.((...(((..(((((((.....))))))).)))...)))))).))))))))..(((..((.((((.....)))).)).))).....)))).........)))))))))...))))))).)))))....))))))).)..))).))))).))))).))))....((((((((...........)))))))).))))))...))))))....((((((.(((..((((((.....))))))))).))))))....(((.......)))..))))).)((((((.......((((((...(((((.(((...((((..((((..((((((.(((((((((.(((((.((((..(....)..)))))).(((((((.............)))))))..)))..)))))))))((((((((((((.((((..((((((((((((.((((...(((((((((..((((.......((......)).......)))).)))))))))((((......)))).....................)))).))))))))))))..(((((.((((((((..((((...............((((((...((((((((.............(((.....)))..)))))))).))))))..)))))))))))).)))))))))..)))).....)))))))).....(((((..(((.(((((....(((....)))...))))).)))..)))))..((((.((.(((((..........))))).))))))....)))))).))))..)))).)))..)))))..))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({....,||||(.(((.{{.........,||.|||||||,|,.|}},.,|{.{{,....,{,,...(((({,,,,{({..{{(((.....,,,((.(((....)))..}}...|..((((((((({(..(((((.............)))))..,,...)))))))))}}}},.......(((......)))((((((((((..(((((((.((((((.....)))))).....(((((.((((((...,(((((((.{((.({{,||{((||...({.(((....}}|,||,.((((((.....)))))).}.....,.,}|}|,,||||||.||)}},...|},|||||,...))),,)})..)))))))))))....{(((|....})))),{{((((.(..(((.((((.......))))..)))..).))).))).....))))))))))))))))).,})}}},))))}|.,{{{,,{,,,.{{{((({{{,{(({((({{.||||||{||||,|((({{,..,{,..((((({((........{(((((...(((((((((.((((...((((((((.((((.((.,.(({..(((((((.....))))))).})).,.)))))).))))))))..{((,,((.{(((,....}}}},)).))}.,...,,)),.}}}.,..)))))))))...))))))}.}))))}.}.|||||||,...})),))))).}}})),))),.{{{((((((((...........)))))))}.))))}}...}))}}},,..((((((.(({.,((((((.....))))))))).)))))),.}}}||,,,,,,,}}},,})))}.}||||||..,,...((((((...{((((.{((...{(((..((((,.{{{{{,,(((((((((.(((((.((((..(....)..)))))).(((((((,............)))))))..)))..)))))))))|((((((({(,,,((({..{{((((((((((.{(((..,(((((((((..({(((((.,,,}},,,,}||},......)),}})})))))))|(((......)))|,,...,}}....,,.,,,...)))|.))))))))))||(((((((.((((((((..((((...............((((((...((((((((.......,.....(((.....)))..)))))))).))))))..)))))))))))).))))))))).,)}))},.}.)))))))).....(((((..(((.(((((..,,(({....)})...))))).)))..))))),.((({,((.(((((..........))))).)))))).}..,,,},,.))))..)))).))),,)))))..)))))},)))))
Back