Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NAPEPLD_0001500
Sequence Length
1731 nt
GC Content
0.3963
UUCUUCACCAAAGGACAUGGAUGAAAAUGAAAGCAACCAGUCUCUGAUGACAAGCAGCCAAUAUCCUAAAGAAGCAGUAAGAAAACGUCAAAAUUCAGCACGGAAUUCCGGAGCAAGUGAUUCUUCUAGGUUUUCUAGGAAAAGCUUCAAACUGGAUUAUAGACUAGAAGAAGAUGUAACUAAAUCCAAGAAAGGAAAAGAUGGGAGAUUUGUGAAUCCGUGGCCAACAUGGAAAAACCCCUCUAUUCCAAAUGUUCUCAGAUGGCUGAUAAUGGAGAAAGAUCACAGCAGUGUUCCAAGUUCUAAAGAGGAACUAGACAAAGAACUCCCAGUGCUUAAGCCAUAUUUUAUCACUAACCCUGAAGAAGCUGGAGUGAGGGAAGCUGGCUUAAGAGUCACAUGGCUGGGACAUGCCACGGUAAUGGUGGAAAUGGAUGAGCUCAUAUUUCUCACGGAUCCCAUCUUUAGCUCUCGUGCUUCACCAUCGCAGUACAUGGGUCCAAAGCGAUUUCGUCGUUCCCCGUGCACAAUAAGUGAACUCCCUCCAAUAGAUGCGGUCCUUAUCAGUCACAACCACUAUGACCAUCUGGACUACAAUUCUGUCAUUGCUUUGAAUGAGCGAUUUGGUAAUGAGUUGAGAUGGUUUGUGCCUUUGGGUCUCCUUGACUGGAUGCAAAAAUGUGGCUGUGAGAAUGUGAUUGAGUUGGACUGGUGGGAGGAGAAUUGUGUCCCCGGACAUGAUAAGGUCACUUUUGUCUUUACACCUUCCCAGCACUGGUGUAAAAGGACUCUAAUGGAUGACAACAAGGUGCUAUGGGGCAGCUGGUCUGUCUUGGGGCCUUGGAAUCGAUUUUUUUUCGCAGGAGAUACUGGUUAUUGCCCUGCUUUUGAAGAGAUAGGAAAAAGAUUUGGACCUUUUGACCUUGCAGCUAUUCCCAUCGGAGCUUAUGAACCGAGGUGGUUUAUGAAAUACCAGCAUGUAGACCCAGAAGAAGCUGUAAGGAUUCACACUGAUGUCCAAACAAAGAAAUCUAUGGCAAUUCACUGGGGAACUUUUGCCUUAGCAAAUGAGCAUUACUUAGAGCCUCCAGUGAAGCUGAAUGAAGCUCUAGAGAGAUACGGACUUAACGCUGAAGAUUUUUUUGUCUUGAAGCAUGGAGAAUCAAGAUACCUAAAUAAUGAUGAUGAAAACUUUUAAUAAAUAAUUUCCUGAGGUGAAAAACCGAUAUUGAAGAUUCAUUUUUCUUUUUUCCAUUCUUCAGGACCUUCGGCAAGGUGAGUCAAGGCUCUCUACCUACCUAGAUGUUUUUCAGAGGCCUACAAAUACAAGUAUCUUUCUUAUAUGCACAUUCUAAUAAAUGAUGAAAUUCAGUCCAACAUGCUUAUUAUAAACAUAGCAAUUCUUGCUCUAUCAAAUUAGCUUAUAUGCCAAAUAUUAAAUAUGGUUUAUUUAGGUAAGCAUAAAAACAUAGGGGCUAUCAUUUUUAAAGACUUGAUUUUCUCUAUUGUGGUAAAAUAUAUAAAUACAUAUUUGCCAUUUUAAACAUUUACCAUUUUAACCAUUUUUAAGUGUACAGUUCUUUCGCAUUAAUGCACCCAUGACCACCAUUCACUUAAAUUUUUAAAAGAACAGUAUAUUCUUUUUUUCCUAGAGCCUUCAGAUGAGAGGGAACAGUAUAUUCUAUUGCACGUCUACAAUUCCCAAAAGACCUCUUACUUUGGGAGGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-460.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -492.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 334.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((.((..((((.(((.((..........)).))))))).)).)))..))(.(((....(((((((((((.((..((((((.(((...((((((((((.......(((((.(((..(((((((((((..(((((.............)))))..))...)))))))))......)))...(((......)))((((((((((..(((((((.((((((.....)))))).....(((((.((((((....(((((((.(((.(((((((((...(((..(((....(.(((((.((((((.....)))))).).....)))).)...))))))...))))....))))))))...))).))))..)))))))))))....(((((....))))).((((((.(..(((.((((.......))))..)))..).))).))).....))))))))))))))))).)))))))))))....((((.((......((((((((((.(((((.((((((((..(.(((((((.......(((((.(((.........((((...(((((((((.((((...((((((((.((((.((...(((..(((((((.....))))))).)))...)))))).))))))))..(((..((.((((.....)))).)).))).....)))).........)))))))))...))))))).)))))....))))))).)..))).))))).))))).))))....((((((((...........)))))))).))))))...))))))....((((((.(((..((((((.....))))))))).)))))))))).))).)))))).(((((((((((((.......((((...(((((((...((((((((((((((((((.((.(((((((((((((.(((((.((((..(....)..)))))).(((((((.............)))))))..)))..))))))))))..)))....)).)))))))............(((((.((((((((((..((((.......((......)).......)))).))))))))))(((((((...((...((((((((((.((((((..(((((((........(((((((((.((((((((..((((...............((((((...((((((((.............(((.....)))..)))))))).))))))..)))))))))))).))))))))))))))))....)))))).((((.((((....((......)).....))))))))..........)))))))))).....)).((((......)))).....))))))).......(((.(((........(((((...)))))......))).))).....)))))....(((((.((((((......((((((.........(((((((..((((............))))..))))))).((((((((.(((........)))))))))))........)))))).....)))))).)))))((((((.(((((((.(((....)))....(((.....)))...............))))))).))))))..)))))))))))....)))))))....))))..)))))).))))..)))..((((............))))))))).)))))))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..(((.((..((((.(((.((..........)).))))))).)).)))..))(.(((....(((((((({{(,((,,{(({,{,(((....,{{,((,(((....}}|,,||.,,{..((((((((({(..(((((.............)))))..,,...))))))))),,,,,..,,...(((......)))((((((((((..(((((((.((((((.....)))))).....(((((.((((((...,(((((((.{((.({{,||{((||...({.(((....}}|,||,.((((((.....)))))).}.....,.,}|}|,,||||||.||)}},...|},|||||,...))),,)})..)))))))))))....{(((|....})))),{{((((.(..(((.((((.......))))..)))..).))).))).....))))))))))))))))).|}}|}}|||||,{.,{{{,.,|||.|,,((({,,,,(({(((,,.||||||,|}}|,|{(({{,..,|,..((((({((........{(((((...(((((((((.((((...((((((((.((((.((.,.(({..(((((((.....))))))).})).,.)))))).))))))))..{((,,((.{(((,....}}}},)).))}.,...,,)),.}}}.,..)))))))))...))))))}.}))))}.}.|||||||{...})),))))).}}})),)))}.{{{((((((((...........)))))))}.))))}}...}))})},...((((((.(({..((((((.....))))))))).))))))|||,.}},..,,,}},(((({({((((((.......((((.{,(((((((...((((((((((({((((((.,{.(((((((((((((.(((((.((((..(....)..)))))).(((((((,............)))))))..)))..))))))))))..)))....}}.))))))}....,.....,.(((((.{(((((((((..({(((({.,,.}},,,,|||},......)),},)})))))))}{{{(((({..((...((((((((((.((((((.,(((((((........(((((((((.((((((((..((((...............((((((...((((((((.......,.....(((.....)))..)))))))).))))))..)))))))))))).))))))))))))))))....)))))).((((.((((....{{......)}.....))))))))..........)))))))))).....)).||||}......,{|{|,..,,}}}}}......,{{{.||,........((((,...}))))........,.))}.....)))))....,((((.((((((.,....((((({.........(((((((..((((..{,....,}..))))..))))))).|((((((({(((........)))))))))))........}))))).....)))))).))))|((((((.(((((((.(({....}))....,((.....}},...............))))))).)))))),.)))))))))))....))))))).,,,)))),,)))))).}))).,)))..((({............)))),}))).)))))))))))...)
Back