Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NAPEPLD_0002600
Sequence Length
1807 nt
GC Content
0.4200
AAUGUCAUUGAAAUGGAAAAUUUAAUAUGCUUACAUGCUGGCUGGGGAAAUAUGUUGUUUUGGAUUACAGGAGAUAAAGGAUUUUUUAAGGGCUUGGCAGUUAUGUUAAUAGGUAAAGCAAACAUCCUUCUUUCUUUCAUGUUUGUUUUGUUUGUUUGUUUGUUUGUGCAAUGGCGUGAUCUCAGCUCACCACAACCUCCACCUCCAGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGCAUUACAGGCAUGUGCCACCAUGCCUGGCUAAUUUUGUAUUUUUAGCAGAGAUGGGCUUUCUCCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCGAACUCCCGACCUGAGGUGAUCUGUCUGCCUCGGCCUUCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGUGUGAGCCACUGCGCCUGGCACAUCUUUCUUAUUUAGCAAGAAGUAAUACUGUAUUCUAAAAUUGUGCCUUGCAGGAAGAAAGUUUCAGCUAAUACAGACAUAAUAUUUUUAUAAGUUUAGAGAAAUUUUUAUUGGCUAACAAAUAGUACCUUGUGUUAUGUUUGAAUGCCUUUAUGUUCAACUCAGUAUUUUUCCCCCUUGUUUUUUUUAGUUCUUCACCAAAGGACAUGGAUGAAAAUGAAAGCAACCAGUCUCUGAUGACAAGCAGCCAAUAUCCUAAAGAAGCAGUAAGAAAACGUCAAAAUUCAGCACGGAAUUCCGGAGCAAGUGAUUCUUCUAGGUUUUCUAGGAAAAGCUUCAAACUGGAUUAUAGACUAGAAGAAGAUGUAACUAAAUCCAAGAAAGGAAAAGAUGGGAGAUUUGUGAAUCCGUGGCCAACAUGGAAAAACCCCUCUAUUCCAAAUGUUCUCAGAUGGCUGAUAAUGGAGAAAGAUCACAGCAGUGUUCCAAGUUCUAAAGAGGAACUAGACAAAGAACUCCCAGUGCUUAAGCCAUAUUUUAUCACUAACCCUGAAGAAGCUGGAGUGAGGGAAGCUGGCUUAAGAGUCACAUGGCUGGGACAUGCCACGGUAAUGGUGGAAAUGGAUGAGCUCAUAUUUCUCACGGAUCCCAUCUUUAGCUCUCGUGCUUCACCAUCGCAGUACAUGGGUCCAAAGCGAUUUCGUCGUUCCCCGUGCACAAUAAGUGAACUCCCUCCAAUAGAUGCGGUCCUUAUCAGUCACAACCACUAUGACCAUCUGGACUACAAUUCUGUCAUUGCUUUGAAUGAGCGAUUUGGUAAUGAGUUGAGAUGGUUUGUGCCUUUGGGUCUCCUUGACUGGAUGCAAAAAUGUGGCUGUGAGAAUGUGAUUGAGUUGGACUGGUGGGAGGAGAAUUGUGUCCCCGGACAUGAUAAGGUCACUUUUGUCUUUACACCUUCCCAGCACUGGUGUAAAAGGACUCUAAUGGAUGACAACAAGGUGCUAUGGGGCAGCUGGUCUGUCUUGGGGCCUUGGAAUCGAUUUUUUUUCGCAGGAGAUACUGGUUAUUGCCCUGCUUUUGAAGAGAUAGGAAAAAGAUUUGGACCUUUUGACCUUGCAGCUAUUCCCAUCGGAGCUUAUGAACCGAGGUGGUUUAUGAAAUACCAGCAUGUAGACCCAGAAGAAGCUGUAAGGAUUCACACUGAUGUCCAAACAAAGAAAUCUAUGGCAAUUCACUGGGGAACUUUUGCCUUAGCAAAUGAGCAUUACUUAGAGCCUCCAGUGAAGCUGAAUGAAGCUCUAGAGAGAUACGGACUUAACGCUGAAGAUUUUUUUGUCUUGAAGCAUGGAGAAUCAAGAUACCUAAAUAAUGAUGAUGAAAACUUUUAAUAAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-508.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -543.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 486.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((....((.............((((((.(((..(((((...(((((((((((((.....)))))..........(((((((((((..((((((.((...((((((((((((((((((.............))))))))))))))))))........((((....(((.((....)))))...))))((((.((..(((.(((.....(((((((((((.((((((((..(((((.((((((.....((((((((......))))))))(((((..........)))))((((..(((.(((.(((((((((((((.(....((.(((((((((....(((.((..(((..(((((((((((((...))).))))))......(((....))).(((((...((((((.........(((((.....(((...))).....)))))..)))))).)))))...(((((((((..((((.((....((((.....))))..)))))).)))))))))(((((((..((((((..((.....))..))))))..(((.(((((.((((................((.((((((((...((.....)).)))))))).)).)))).))))).)))....(((......)))....)))))))...........))))..)))..)).))).......((.(((....)))..)).(((..(((((((((((..(((((.............)))))..))...)))))))))......)))...(((......)))......))))).)))).))...).))))))))))))).))))))))))...)))...))))))))..))))))...(((((..((.((((.(((.(((((((((((((.....)))))).............(((((((((((((((..((((.(((((....((.....))....))))).))))..)))))))))...))).))).))))))))))....((.((((((((....((.(((((.........................)))))))....)))))))).)).((.((((((.....((((((...)))))).)))))).)).....)))).))..))))).......((((((...(((((((((.((((...((((((((.((((.((...(((..(((((((.....))))))).)))...)))))).))))))))..(((..((.((((.....)))).)).))).....)))).........)))))))))...))))))..)).)))))))))))..))).)))..))...)))).......(((((((((((...........)))))))..))))...(((.(((.....((((((.(((..((((((.....))))))))).))))))..))).)))........(((......))))).))))))..)))))))))))(..(((.(((((........)))))..)))..).....((((....)))).(((((((((.....))))))))).....))))))))...)))))....)))))))))(((((...((.((((.(((((((((((((((.((((...(((((((((..((((.......((......)).......)))).)))))))))((((......)))).....................)))).)))))))))))).)))..)))))).)))))......))....)))))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,(((((({...,((,.........,,.((((((.(((..(((((,..(((((((((((((.....}}|||,.,..,,...{{{{{,,((((,.((({((,{{{{,((((((((((((((((((.............)))))))))))))))))},,,,,{,.,,,|}},{{|||||,|||||||}},.,,.,,,{{.{{..{{{.{((|,,..{{{((((((({.{{((((((..(((((.((((((.,...((((((((......))))))))(((((..........))))),,(({.(((.(((.(((((((((((((.(....((.((((((((({..{((({((,.{{,..|{|||||||,,{{...,,|{||||||......(((,,..}}}.,||||}}}|||||,,{(({{(,,{{{{{.,||,{{,...,}|,,.|{||...,,|||}}|{|,,||{{.{((((((((..(({{.{,.,,.,,{{.....}}}}..}})))).))))))))|(((((((.,((({{{..,,...,})}..}}}|||{{({,.....,}}}}},..,,....{((((..((.((((((((...(,.....,,.)))))))).))..)))))}},..||.....(((......)))....))))))),}}}}.,,}..)))),.))),.)),}},....,,.((.(((....)))..))...,..((((((((({(..(((((.............)))))..,,...))))))))).......}}..,|{{.,,...))}.....,))))).)))).))..}).))))))))))))).))))))})))...)))...))))))))..))))))...{||||,.{(.{(((.{{,|{((((({((((((.....))))))...........,.{{{((((((((((((..((({.(((((...{({.....}}..}}))))).})))..)))))))))...))).})),)))))))))),,..({.((((((((.{{{({.(((((......,,....|||....,},,..)))))))||..)))))))).)).||.{{{(((,,,..{(((({...)))))).)))))),}}.....)))).)|.,|}||}.......((((((...(((((((((.((((...((((((((.((((.((.,.(({..(((((((.....))))))).})).,.)))))).))))))))..{((,,((.{(((,....}}}},)).))}.,...,,)),.}}}.,..)))))))))...))))))..)),))))))))))}{{|}}.})),,}},|.||||{{||...(((((((((((...........))))))},,)))).,.,,,}|,|}},..((((((.(({..((((((.....))))))))).))))))..,||,||{{{{{{||{((({.{{{,..,..,)))}})}}))}}}})))))|,.{||.|{{{|..,,..,,))}})},)}},,},{{|..{((,...}}}}}{((((((((|...,))))))))}.....))))))))...)))))....))))))))){||{{....,}},})))|.{(((((((((((.((((..,(((((((((..({(((({.,,.}},,.,}||},......)),},)})))))))|(((......)))|,,...,||.............)))).)))))))))))}{{{{{.,|,,...)..))))),..,}....})))))),,}.................
Back