Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NAPEPLD_0005000
Sequence Length
2271 nt
GC Content
0.4571
GUAGCCAGAUGCAGGACAAAUCGAGAAGAAUGCCUCCCUUUCCCUUAAGGAGACUUCUGGAAGCACCAUAAAAGGCUCGUAUCACAUUGUUCAAAGUGUCACCAACCUGGCCAUCCCUAGCUAGAAGGCUGAGAAAUGUCAUCAUUUAGCUGAUGCAUAGUUACCCUAAGUAAAACGGGUUCUGUUACUGAGAAGAAAAGGAAGAGAAGAUUUUUUUUUUUUCUAAAUACAUGACAGAUUAAAGAACACUAGAUUUUAUGGCAGGCAUCUUUUCGUCUUUACCACUGUGCUGCCGCUUUACCACAUAGAAUUUAACUACUCAAUUAUUCCCCAAGACUUUUCUAUUUUUAUUUAUUUAUGUUUAUUUAUUUAUUCUUAGACAAGCUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCAUGAUCACGGCUCACUACAGCCUUGACCUCCUGGGCUCAAGCAAUCCUCCUAUCUCAGCCCGCCACACCUGGCUAAUUUUUGCGUGUGUGUGUUUGUUUUUUUGUUUUUUUGUUUUUUUUUUUGUAGAGACAGAGUCUCACUAUGUUGCCCAGGGUGGUCUUGAACUCCUGGGCUCAAGUGAUCUGCCUGCCUUGGCCUCCCAACGUGUUGGGAUUACAGGUGUGAGCCCCUGUACCUGGCCAGUUUUAAUUUUUGUUAGCAGAGUUGGUGGGGAUCUCCACUGUUGACUUUUGUCUCUCUGUCUUCUGGUCAUUUUUGCUUCUAUUAUUUGACUCCUAGCAGGAGAUCUUUUAAAAAACAAUUAACUGUAUCCUAAUGAAGAGUGAUUAGGAGUUUAAGCUCUGGUUUUUUCAUUUAUUCAUUCCAUAAAUAUUGUGCACUCAUUGUGUACAGGCUGCUUUGUGUUAUUGACAAUGUGAAUCAUUACUGAUUAUAUUUCCCUUUUUUUGACUUGGCUUCCUGGGGGCACAGAGUCAAAUUUGUGACUCAGUUGGAUUGAGUACAAGCCUUGCCCUGUCAAACUUUCUUUUUUUCUGUCACCCAGGCUGCAGUGCAGUGGCACGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCUGGUUCAAGUGAUUCUCCCACUUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGCCGCCUGCCACCAUGCCUGGCUAUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAAAUGAUCCACCUGCCUCGGCCUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGUCACCAUGCCUGGCCCCUGUUAAACUUUCUACCUAGCAAUGUGGUUAGUCUUCCCAUCCCACUGUAUAGCAGUUUCAGGAUGAUGCUGCCUCUCUAACUUGGAGUGCUGAACAGGAAGUAAGAGUUGGCUUUACGGUAGGCAGCUGCCAGGCUAGCAUAAAUUCUGGCAUACCAGAAAAUCCCUUUGAUCCUUCCUAAAUGCUUGUCUUACUUUGUGCCAAAUGACUAAUGAUUUAAAGCAGUGGUUCUCAACCCUGCCUGUAUAUCAGAAACACCCACAGAACUUUUAAAAAUUAUCUAGAGAAACUGCCCCACCUGACAUUUUGAUUCAGUAGCCUCUGGUGUAGUUUAAAAAGCUCCACAGGGGAGCUCUUUCCUUUCGCUGCUGUGGCUGCAGCCUUGAGUAUGCUCAGGCUUCAGAAGAGGCUUGCCUCUAGUGUCCUCUGCUGUGGCAAGAAGAAUAUCUGGUUAGACCCCAAUGAGACCAAUGAAAUCACCAAUGCCAACUCCCGUCAGCAGAUCCGGAAGCUGAUCAAAGAUGGGCUGAUCAUCCGCAAGCCUGUGAUGGUCCAUUCCCCCGCUUGAUGCCGGAAAAACACCUUGGCCUGCCGGAAGGGCAGGCAUAUGGGCAUAGGUAAGCGGAAGGGUACAGCCAAUGCCCGAAUGCCAGAGAAGGUCACGUGGAUGAGGAGAAUGAGGAUUCUGCACCGGCUGCUCAGAAGAUACCGUGAAUCUAAGAAGAUUGAUCGCCGCAUGUAUCACAGCCUGUACCUGAAGGUGAAGAGGAAUGUGUUAAAAAACAAGCAGAUUCUCAUGGAACACAUCCACAAGCUGAAGGCAGACAAGGCCCGCAAGAAGCUCCUGGCUGAUCAGGCUGAGGCCCGCAGAUCUAAGACCAAGGAAGCACACAAGAGCUAUGAAGAGCACCUCCAGGCCAAGAAGGAGGAGAUCAUCAAGACUUUGUCCAAGGAGGAAGAGACCAAGAAAUAAAAGCUGCCCCUUUGUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-680.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -725.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 558.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((((.(((((.((..((.....)).))))).((((......)))).).).)))))..))((.(((((.(((..((...(((((......))))).......(((((........)))))..((((((((.(((.(((((......))))))))....((((..........))))(((((((.((...((((((((((((((...)))))))))))))).....)))))))))...........(((((((((((((.((((.(...................).)))))).......))))))))))).................((((((((.((((....((..((..((....))..))..))....)))).))).)))))..(((.....)))(((.((((.(((.((.....(((.((((......)))).)))))..))).)))).)))..........))))))))((((((((...((........))))))).))).......(((((((((((.((((((((((((...(.((((((((((.(((.((..(((((((((........)).))))))).)))))(((((((..(((((((((((((((....)))))..((((((........))))))...((((((......(((((((....((((((((((((....))))))...)))))).((((.(((((((((.(((...(((((((((........)).....)))))))((((((.......(((......))).(((((((........))))))).......(((((((.(((.((((...(((...((((((..((((((((.....)))))))).....))))))....))).(((((((.(((....))))))))))......(((((((.(((((((((.((((((((.((((((......))))))..((((((.((((((((((.((.....((((((...((((.((((((((...(((((..(((((((((((((.((....)))).)))))))....))))...)))))....((((.......))))(((((((((.((((.((((......)))).(((.((......))..)))...............((((.(.(((((((....(((((((.((((((((.(((...((.(...((....))...).)).))).)))).))))(((((......)))))...((((((((......)))))))).....(((((...........))))))))))))......)))))))).))))....(((((.(((...))).))))).......)))))))).))))))))))))).))))((((((((...(((((....))))))))))))).....((((((....))))))......))))))........)).))))))...)))).)).)))).................((((.((((...))))))))(((.....)))......((((((.........(((((((((((((...((((.....................)))).)))))).)))))))....((((((.....))))))..............))))))(((.(((((.(((....)))))))).))).(((((....))))).))))))((((((((((((.........(((((((............)))))..)).........)))))........))))))).))))))))))))))))))..((((((((.(((((..(((((((..((......))((.((.....)).)).......(((..(((((((.....)))))))....))))))))))..)))))..))).)))))))))...))).)))))))))))))..(((((((.(....((((((((.((((..(((...((....))...)))(.(((((....))))).)....(((((...((...((((........))))...))...)))))...........))))))))))))....).)))))))..))))))))))))..))))..)))))))....))))))....))))))))))..)))))))............(((........))).(((.((...(((((..........)))))...)).))))))))))))))..)))))))))))).))))))))))))).)))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.(((({.(,(({.{{..,(,,,,,|}.|||||,{{((,,,...}})),},,.)}}))..)}{{{(((({,(({..{{...(((((......))))).,,....(((((........)))))..(({((({{.(((.(((({......))))))))....((((..........)))){((((({.{{{,,(((((((((((({,...}))))))))))))).....,,})))))}.....,.....,{{{{||||{||{|||||}},,,,,|,.,,..,..,|}}}})))}||,......||||||}},,,.................((((((((.((((....((..((..((....))..))..))....)))).))).))))).}}}}}},...{(((((.{(((,(({,(......,,},|||}}},.}))))}})}|{,,,{|||{,,,||,..,,,,,,,.|||})))){(((((((...((........)),,)})})}),..,,,{(((((((((((.((((((((((((...{.(((((((((({(((.((..(((((((((........)).))))))).)))))|((((((..(((((((((((((({....})))),.((((((.,......))))))..,((((((......(((((((..(({((({{((((({....})))))...|||}},.|||,,{(({{(((({((,(({((..((...........{{(((({...))))).}}...,.............{{{{{((((((({({{{,,,|||||||{{....}|||||||,|||}|}}}...|{{,..((((((..((((((((.....)))))))).....))))))....,}}.{(((({{{(({....}))))}))}}.{((..(((((((.(((((((((.(((((((({((((,,...,,{||||||({(.,.}}}||||||||((,{{{,,..(((((,..,((((.((((((((...(((((..(((((((((((((.(,....}))).)))))))....))))...)))))....((((.......))))((((((((({((((.((((......)))}.(({.((,.....}}..))).......,|||....{(((.(.(((((((....(((((((,((((((((.(((...({.,...{{....},...),}}.))).)))).))))(((((......)))))...((((((((......)))))))),,....{{{{...........})))))))))))..}...))))))),.)))}.,..(((((.(({...})).))))).......)))))))).))))))))))))).))))||||||,,...|||||,,..}}}}}||||}|||,,...((((((....)))))).......,,}}}.........},))),))},.)))))))))),,.,......,,||.,...((((.((((...)))))))){{{...,,))}...,,,((((((...,,{,,.({(((((((((((...((({......,,,......,..,})))}}.)))))).)))))))}||,((((((.....))))))..............))))))(((.(((({{(((....)))))))).))).(((((....))))).)))),,((((((((((((....,,.,.{{(((((..,......}..)))))..),..}}.....)))))........))))))).)))))))))))))))))).))).,{{{{,(((((..(((((({..|{,,....||,(,((.....)},)).......{{,..(((((((.....)))))))..,.))))))))))..)))))}})))})))...,,))..)))}))))))),,|||,..(((((((.{....(((((((,{((((..,(((((.,.....|{{{||((,(((((....))))).}}}},||,,,}}}||.}}|||,,|{{{....))),...},,..||||,,.....}},.))))))))))))....).)))))))..|||},})))))}...,))..)))))))....)))))),...,)))))))))..))))))|.........},,{((.,......))}.{({.((.,.(((((..........)))))...}).))}}))))))))))..)))))))))))).)))))))))))},.)}}..)))))))
Back