Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0005900

Sequence Length

469 nt

GC Content

0.3859

AAUAACUUUAUUUUCCUUUGAAGAUCUUCUAGUUGAUAUGUUGGGGGUUCUUGCCAGCUACAGCAUCACUGUCAAGGAGUUGAAGCUUUUGUUCAGCAUGCUUCGAGGAGAAAGUGGAAUCUGGCCAAGACAUGCAGUAAAAUUAUUAUCAGUUCUUAAUCAGAUGCCACAGAGACACGGUCCUGAUACUUUUUUCAAUUUCCCUGGUUGUAGCGCUGCGGCAAUUGCCUUGCCUCCUAUUGCAAAGUGGCCUUAUCAGAAUGGCUUCACCUUAAACACUUGGUUUCGUAUGGAUCCAUUAAAUAAUAUUAAUGUUGAUAAGGAUAAACCUUAUCUUUAUUGUUUUCGUACUAGCAAAGGAGUUGGUUACUCUGCUCAUUUUGUUGGCAACUGUUUAAUAGUCACAUCAUUGAAGUCCAAAGGAAAAGGUUUUCAGCAUUGUGUGAAAUAUGAUUUUCAACCACGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-110.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -121.38

Frequency: 0.0000

Diversity: 126.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((...((((((((((..((.((((.(((((((.(((((((.(...((((((((.((((.....))))..(((((.(((.((..(((((((((.(((..(.(((.((((((((.((((((..((((..((.((((....))))..))..))))..)))))).))))...(((...))).(((........))).))))))).)..)))..)))).)))))..)).))).)))))...(((.(((((((...((..(((((.((((....((((.....))))....)))).)))))................(((((((.....)))))))....(((((........)))))..))...))))))).))).......)))))))).).)))))))))))....)))))))))))))))))))))))))(....(((((((................))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{.((((,..,(((((((((..((.((((.,{,((((.{(((((,((,..,|{|||||.,|||}..{,||||,,(((((.{((.((..(((((((((.(((..(.(((.((((((((.{(((((..((((..((.,(((....,})),,))..))))..)))))}.)))),{.(((...))),|((........)),.))))))).)..)))..)))).)))))..)).))}.)))))..,||,.||||(((....,,,{{{|||,.,{,,...{{{.,,,,||{,.{{{{|||.,{{{{({......,}}}}}..(((((((.....))))))),}))})}..}}}}}}}.|||,|||{{||.|},.,,},,)),},}}}})))))),|||{|,,,))))),,.,,,}..))))))))))))))))))))}}{....(((((((,{,......,}}},..))))))))