Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0006300
Sequence Length
1476 nt
GC Content
0.3963
AUCUUCUAGUUGAUAUGUUGGGGGUUCUUGCCAGCUACAGCAUCACUGUCAAGGAGUUGAAGCUUUUGUUCAGCAUGCUUCGAGGAGAAAGUGGAAUCUGGCCAAGACAUGCAGUAAAAUUAUUAUCAGUUCUUAAUCAGAUGCCACAGAGACACGGUCCUGAUACUUUUUUCAAUUUCCCUGGUUGUAGCGCUGCGGCAAUUGCCUUGCCUCCUAUUGCAAAGUGGCCUUAUCAGAAUGGCUUCACCUUAAACACUUGGUUUCGUAUGGAUCCAUUAAAUAAUAUUAAUGUUGAUAAGGAUAAACCUUAUCUUUAUUGUUUUCGUACUAGCAAAGGAGUUGGUUACUCUGCUCAUUUUGUUGGCAACUGUUUAAUAGUCACAUCAUUGAAGUCCAAAGGAAAAGGUUUUCAGCAUUGUGUGAAAUAUGAUUUUCAACCACGCAAGUGGUACAUGAUCAGCAUUGUCCACAUUUACAAUCGAUGGAGGAACAGUGAAAUUCGGUGUUAUGUUAAUGGACAACUGGUAUCUUAUGGUGAUAUGGCUUGGCAUGUUAACACAAAUGAUAGCUAUGACAAGUGCUUUCUUGGAUCAUCAGAAACUGCUGAUGCAAAUAGGGUAUUCUGUGGUCAACUUGGUGCCGUGUAUGUGUUCAGUGAAGCACUCAACCCAGCACAGAUAUUUGCAAUUCAUCAGUUAGGACCUGGAUAUAAGAGUACCUUCAAGUUUAAAUCUGAGAGUGAUAUUCAUUUGGCAGAACAUCAUAAACAGGUGUUAUAUGAUGGGAAACUUGCAAGUAGCAUUGCCUUUACAUAUAAUGCUAAGGCCACUGAUGCUCAGCUCUGCCUGGAAUCAUCACCAAAAGAGAAUGCAUCAAUUUUUGUGCAUUCCCCACAUGCUCUAAUGCUUCAGGAUGUGAAAGCGAUAGUAACACAUUCAAUUCAUAGUGCAAUUCAUUCAAUUGGAGGGAUUCAAGUGCUUUUUCCACUUUUUGCCCAAUUGGAUAAUAGGCAGCUCAAUGACAGUCAAGUGGAAACAACUGUCUGUGCUACUCUGUUGGCAUUCCUGGUUGAACUACUUAAAAGUUCAGUAGCCAUGCAAGAACAGAUGCUGGGUGGAAAAGGCUUUUUAGUCAUUGGCUACUUACUUGAAAAGUCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-389.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -417.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 313.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((.((((((((((((((.((((.((((.((.((....)))))))).)))).(((((((((((((.(((((......((((.((((((..((((..((.((((....))))..))..))))..)))))).))))....(((((((.((((.(((((((((.......(((((...((.((((((((....)))((((........)))).))))))).)))))..((((((((...........(((.(((....))).)))...........(((((..(((((((.....)))))))..)))))........(((((((((((((.((....)).)))).)))))))))..(((((...)))))........))))).)))..)))))))))..)))).)))))))......(((((....(((((....)))))....))))).((((((((.((((.......))))..)).))))))...))))).).)))))...)))))))(((((((....((((((.((((..(((((.(((.....((((..((((...((((((((.....(((.((((.(((...))).)))).)))((((((....(((.....(((((..(((.((((((((((((((((..(((((.......(((((((((((((((((((((((..(((.(((((..(((..((((...............((((.((((((...))))))..)))))).)))))..))))).)))..)))))))....))))))))).....(((((..(((...)))..)))))...((((((....((((...(((........)))..))))...))))))...)))))))...........((......))....(((((((...((....))..))))))).......))))).....((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))....((((((((...((((((...((....)).))))))...((...((((((.((((..(((..((((((.......)))))).)))..))))...)))))).))(((((((..((((((....)))).))..)))))))(((((.......)))))((((.....)))).))))))))((((.((((..........)))).....(((.....))).....(((((((((..((((...))))..)))))))))................)))).)).))))))))))))))..))).))))))))....)))))).....)))))))).)))).)))).....)))))))))))).).)))))..)))).))).)))))))).((((((....))))))...)))))).))))))..))))))...((((((((.......(((((...)))))......))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,,,{{((((((((((.(((((((((((((({,(({,{{{{.,{.{{,,..|||||,||{,((..(((({((((.(((..(.(((.((({((((.{(((((..((((..((.,(((....,})),,))..))))..)))))}.)))),{.(((...)))}|((........)),.})))))).)..)))..)))).|||}}..)).}}|,)}}}}...}},..|,{(((..........)))}.}{{{..........})},.{((((((.{(((((((((((((({{{{{..(((((((.....))))))).,})}}|........(((((((((((((.({....,).)))).)))))))))..{{({{...))))|((((,..((((({.((.........)).,)))))...})))}||....{(({{.,..(((((....)))))....})))}.((((((((.((((.......))))..)),})))))....,,}))))))).)))))))),....,,.......(((((,.((((..(((((.(((..,,.{(((..((((...((((((((.....(((.((((.(((...))).)))).)))((((((.,..(((.....(((((..(((.((((((((((((((((.............(((((((((({(((((((((((((..(((.(((((..(((..({{,...,||..,......((((.((((({...})))))..)))),,.,,)))..))))).)))..)))))))....))))))}{(((((((..........})))))))...((((((((..(((...((((((((........}}....{.((((((({,,.....,))))))))......(((.((,,((.....(((((((...((....))..)))))))....))))).)))....((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))..})))))).....)))..))),,)))).......))))))))))..((((((.((((..{((,{((((((.......)))))).}))..))))...)))))).(((((((,{{.,,(((({{{((({,,..{{,,.{{..,,{({.|||||{|||||{{{{{.....,,}|))))}.|,,....((((..........)))).....,{|}}}}}))),,...{{{{||||{..{,{|}},}))).})))))))}}..........,,,.)))))))}).))))))))))))))..))).))))))))....)))))).....)))))))).)))).))))..,,.)))))))))))).,.)))))))))))),,).)))))))).((((({....))))))...)))))}.)))))),,)}}))),,.{(((((((..,,...{|{({|..},,}).,,...))))))))
Back