Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0006500
Sequence Length
1919 nt
GC Content
0.3940
AUCUUCUAGUUGAUAUGUUGGGGGUUCUUGCCAGCUACAGCAUCACUGUCAAGGAGUUGAAGCUUUUGUUCAGCAUGCUUCGAGGAGAAAGUGGAAUCUGGCCAAGACAUGCAGUAAAAUUAUUAUCAGUUCUUAAUCAGAUGCCACAGAGACACGGUCCUGAUACUUUUUUCAAUUUCCCUGGUUGUAGCGCUGCGGCAAUUGCCUUGCCUCCUAUUGCAAAGUGGCCUUAUCAGAAUGGCUUCACCUUAAACACUUGGUUUCGUAUGGAUCCAUUAAAUAAUAUUAAUGUUGAUAAGGAUAAACCUUAUCUUUAUUGUUUUCGUACUAGCAAAGGAGUUGGUUACUCUGCUCAUUUUGUUGGCAACUGUUUAAUAGUCACAUCAUUGAAGUCCAAAGGAAAAGGUUUUCAGCAUUGUGUGAAAUAUGAUUUUCAACCACGCAAGUGGUACAUGAUCAGCAUUGUCCACAUUUACAAUCGAUGGAGGAACAGUGAAAUUCGGUGUUAUGUUAAUGGACAACUGGUAUCUUAUGGUGAUAUGGCUUGGCAUGUUAACACAAAUGAUAGCUAUGACAAGUGCUUUCUUGGAUCAUCAGAAACUGCUGAUGCAAAUAGGGUAUUCUGUGGUCAACUUGGUGCCGUGUAUGUGUUCAGUGAAGCACUCAACCCAGCACAGAUAUUUGCAAUUCAUCAGUUAGGACCUGGAUAUAAGAGUACCUUCAAGUUUAAAUCUGAGAGUGAUAUUCAUUUGGCAGAACAUCAUAAACAGGUGUUAUAUGAUGGGAAACUUGCAAGUAGCAUUGCCUUUACAUAUAAUGCUAAGGCCACUGAUGCUCAGCUCUGCCUGGAAUCAUCACCAAAAGAGAAUGCAUCAAUUUUUGUGCAUUCCCCACAUGCUCUAAUGCUUCAGGAUGUGAAAGCGAUAGUAACACAUUCAAUUCAUAGUGCAAUUCAUUCAAUUGGAGGGAUUCAAGUGCUUUUUCCACUUUUUGCCCAAUUGGAUAAUAGGCAGCUCAAUGACAGUCAAGUGGAAACAACUGUCUGUGCUACUCUGUUGGCAUUCCUGGUUGAACUACUUAAAAGUUCAGUAGCCAUGCAAGAACAGAUGCUGGGUGGAAAAGGCUUUUUAGUCAUUGGCUACUUACUUGAAAAGUCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAGAUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAGGAUCGAGGGGUCAAGGAAGAUGAACUUCAGAGUAUAUUAAAUUACCUACUUACGAUGCAUGAGGAUGAAAAUAUUCAUGAUGUGCUACAGUUACUGGUGGCUUUAAUGUCGGAACACCCAGCCUCAAUGAUACCAGCAUUUGAUCAAAGAAAUGGAAUAAGGGUGAUCUACAAAUUAUUGGCUUCUAAAAGUGAAAGUAUUUGGGUUCAAGCUUUGAAGGUUCUGGGAUACUUUCUGAAGCAUUUAGGUCACAAGAGAAAAGUUGAAAUUAUGCACACCCAUAGUCUUUUCACUCUUCUUGGAGAAAGGCUGAUGUUGCAUACAAACACUGUGACUGUCACCACAUACAACACACUUUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-497.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -531.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 516.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((.(((((.((.(((....)))((((.((((.((.((....)))))))).)))).....(((((...(((((((((((..((((.((((((..((((..((.((((....))))..))..))))..)))))).))))((.(((...)))))....((((.(((.(((((..((((((.((.((((.(((....)))((((........)))).(((((..((((((((((..(((((((((..((.(((....(((((((.((((((((((((((((((((..(((((((.....)))))))..)))))........(((((((((((((.((....)).)))).)))))))))..(((((...)))))((((...((((((.((.........)).))))))...))))(((((......)))))(((((....)))))....((....((((((((.((((.......))))..)).))))))....)).))))))).))))))))..............((((((.((((..(((((.(((.....((((..((((...((((((((.....(((.((((.(((...))).)))).)))((((((....(((.....(((((..(((.((((((((((((((((..(((((.......(((((((((((((((((((((((..(((.(((((..(((..((((...............((((.((((((...))))))..)))))).)))))..))))).)))..)))))))....))))))))).....(((((..(((...)))..)))))...((((((....((((...(((........)))..))))...))))))...)))))))...........((......))....(((((((...((....))..))))))).......))))).....((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))....((((((((...((((((...((....)).))))))...((...((((((.((((..(((..((((((.......)))))).)))..))))...)))))).))(((((((..((((((....)))).))..)))))))(((((.......)))))((((.....)))).))))))))((((.((((..........)))).....(((.....))).....(((((((((..((((...))))..)))))))))................)))).)).))))))))))))))..))).))))))))....)))))).....)))))))).)))).)))).....)))))))))))).).))))))))))))..(((((((....((((((....)))))).........(((((.(((.(((((((..(..((((((((.(((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)))...))))...........((((....)))).))))..)..))).))))))))))))......))))))).)))))..))))).))))..))))).))))).))))).((((.(((.((((....(((....)))...))))))).))))..)))).))))))))..))))).))).))))((((((((..........(((((.......((((((((((.(((((((...)))))....)).)))))))))).)))))...))))))))....((((((.....((((((......))))))))))))..)))))))))))....))))).((((((.........)))))).....)))))))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
,...,,,.((((.{{(({{((,{((,,,.||}((((.((((.((.((....|||||}}|.}||}.,,,,(((((.,,({{({((({((,,((((.{(((((..((((..((.,(((....,})),,))..))))..)))))}.)))){(.(((...)))}|{,..,,,,,{||,.||||}}|,|,{|||{,||}}.|||||..}}.}}}|}||||..{|||..((((({.,,,,,,{{,|}}|,{(((,,,..,...,|}},.(((((((.{((((((((((((({{{{{{..(((((((.....))))))).,))}}|........(((((((((((((.({....,).)))).)))))))))..{((({...})))|(((({.,((((({.((.........)).}))))}..,})))|||,,..,{{{|,,,.(((((....)))))....}|}}}.((((((((.((((.......))))..)),,)))))....,,}))))))).}})))))),..,,,,,......(((((,.((((..(((((.(((..,,.{(((..((((...((((((((.....(((.((((.(((...))).)))).))}((((((.,..(((.....(((((..(((.((((((((((((((((......,......(((((((((({(((((((((((((..(((.(((((..(((..({{,...,||..,......((((.((((({...})))))..)))),,.,,)))..))))).)))..)))))))....))))))}|(((((((..,....,..}))))))).,.((((((((..(((...((((((((........}}....{.((((((({,,.....,))))))))......(((.((,,((.....(((((((...((....))..)))))))....))))).)))....((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))..})))))).....)))..))),,)))).......})))))))))..((((((.((((..{((,{((((((.......)))))).})),.))))...)))))).(((((((,{{..,(((({{{((({,,..{{,,.{{..,,{({.|||||,||||||{{{{.....,,},}}}}}.|,...,.((((..........}))).....,{|}}}}}))},,...{{{{{|||{..{{{|}},}))).})))))))}}...........,,.)))))))}}.))))))))))))))..))).))))))))....)))))).....)))))))).)))).))))..,,.)))))))))))).,.)))))))))))}.,(((((((....((((((....)))))).........{(((,{(((.(((((((..(..((((((((.(((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)))...))))...........((((....)))).)))).,),.)))}})))))))))))......))))))),},,))),,})))|||||..,,)))})}}})})))))}}|,,|||||({({..,,{|||{{||},||||||||||,|||,.|||}|||{{.||,|..}}}}}},,,.,,||(((({{{,{,,.,..,},(((({.....,,{{{{(((({{,({,|||,.,.}}}}}}},.)).))})))))))}))))),,,,)))))))..,,|||,|{|,{..{,((((,,.,..}}||||||||},.,|||}}}})))),,}}))))},||||||,,....,..}))))),,,,.)))))}})}})..........,,
Back