Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0007200

Sequence Length

566 nt

GC Content

0.3922

AUCUUCUAGUUGAUAUGUUGGGGGUUCUUGCCAGCUACAGCAUCACUGUCAAGGAGUUGAAGCUUUUGUUCAGCAUGCUUCGAGGAGAAAGUGGAAUCUGGCCAAGACAUGCAGUAAAAUUAUUAUCAGUUCUUAAUCAGAUGCCACAGAGACACGGUCCUGAUACUUUUUUCAAUUUCCCUGGUUGUAGCGCUGCGGCAAUUGCCUUGCCUCCUAUUGCAAAGUGGCCUUAUCAGAAUGGCUUCACCUUAAACACUUGGUUUCGUAUGGAUCCAUUAAAUAAUAUUAAUGUUGAUAAGGAUAAACCUUAUCUUUAUUGUUUUCGUACUAGCAAAGGAGUUGGUUACUCUGCUCAUUUUGUUGGCAACUGUUUAAUAGUCACAUCAUUGAAGUCCAAAGGAAAAGGUUUUCAGCAUUGUGUGAAAUAUGAUUUUCAACCACGCAAGUGGUACAUGAUCAGCAUUGUCCACAUUUACAAUCGAUGGAGGAACAGUGAAAUUCGGUGUUAUGUUAAUGGACAACUGGUAUCUUAUGGUGAUAUGGCUUGGCAUGUUAACACAAAUGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-137.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -150.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 140.04

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........(((((((((((((((((....)))((((.((((.((.((....)))))))).)))).(((((((((((((.(((((......((((.((((((..((((..((.((((....))))..))..))))..)))))).))))....(((((((.((((.(((((((((.......(((((...((.((((((((....)))((((........)))).))))))).)))))..((((((((...........(((.(((....))).)))...........(((((..(((((((.....)))))))..)))))........(((((((((((((.((....)).)))).)))))))))..(((((...)))))........))))).)))..)))))))))..)))).)))))))......(((((....(((((....)))))....))))).((((((((.((((.......))))..)).))))))...))))).).)))))...))))))).(.(((((.......))))).))))))))))))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

({{..,,{((((.,{(((((,.(({...,|}}||||,|||}}|({((,,,,(((((.{((.((..(((((((((.(((..(.(((.((({((((.{(((((..((((..((.,(((....,})),,))..))))..)))))}.)))).{.(((...)))}|((........)),.})))))).)..)))..)))).)))))..)).))}.)))))..,),..}}}|(((..........))),.,{{{...,,,....}}},{{....|}}((((((((((((((({{{{{..(((((((.....))))))).,)))}|........(((((((((((((.({....,).)))).)))))))))..{{{{{...))))|((((,..((((({.((.........)).})))))...})))}||,,..{({{{.,..(((((....)))))....}}}}}.((((((((.((((.......))))..)),})))))....,,}))))))).})))))))))))))))(((.,.{{{{((((((......))))))},).}}...)))