Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0011600
Sequence Length
714 nt
GC Content
0.3880
GCAAUUGCCUUGCCUCCUAUUGCAAAGUGGCCUUAUCAGAAUGGCUUCACCUUAAACACUUGGUUUCGUAUGGAUCCAUUAAAUAAUAUUAAUGUUGAUAAGGAUAAACCUUAUCUUUAUUGUUUUCGUACUAGCAAAGGAGUUGGUUACUCUGCUCAUUUUGUUGGCAACUGUUUAAUAGUCACAUCAUUGAAGUCCAAAGGAAAAGGUUUUCAGCAUUGUGUGAAAUAUGAUUUUCAACCACGCAAGUGGUACAUGAUCAGCAUUGUCCACAUUUACAAUCGAUGGAGGAACAGUGAAAUUCGGUGUUAUGUUAAUGGACAACUGGUAUCUUAUGGUGAUAUGGCUUGGCAUGUUAACACAAAUGAUAGCUAUGACAAGUGCUUUCUUGGAUCAUCAGAAACUGCUGAUGCAAAUAGGGUAUUCUGUGGUCAACUUGGUGCCGUGUAUGUGUUCAGUGAAGCACUCAACCCAGCACAGAUAUUUGCAAUUCAUCAGUUAGGACCUGGAUAUAAGAGUACCUUCAAGUUUAAAUCUGAGAGUGAUAUUCAUUUGGCAGAACAUCAUAAACAGGUGUUAUAUGAUGGGAAACUUGCAAGUAGCAUUGCCUUUACAUAUAAUGCUAAGGCCACUGAUGCUCAGCUCUGCCUGGAAUCAUCACCAAAAGAGAAUGCAUCAAUUUUUGUGCAUUCCCCACAUGCUCUAAUGCUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-184.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -198.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....))))((.((((((...(((.(((....(((((((((.........(((.(((.(((..(((((((..((.((((.............(((((((.....))))))))))).))..))))))).))).)))..))).........)).)))))))..))).)))...)))))).((((...((((((.((.........)).))))))...))))(((((......)))))(((((....))))).....(((((..((((((((((..(((.((((.................))))))).))))....))))))))))).((((.(((((((((((((...(((..........)))..))))))....((((((((.((((((((((((......))))))((.(((.((((((..((.....))..)))))).))).)).)))))).))))))))....((((..((((((((((((((((((((..(((.(((((..(((..((((...............((((.((((((...))))))..)))))).)))))..))))).)))..)))))))....)))))))))((((((((((..(((...)))..)))))....))))).....)))).))))....))))))).))))((((((((........)))))))).......((......))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({.....}}}}({.,,,,,{||.{(({(((,,..,,{{{,{{{|,,{({,,...,.,{({((({{(,(((({..{((((({,,...,|||||..(((((((.....))))))),,))})}..,,,}},|{{(({{{{((((.{,....,}.))}),)))))}})),.}})|},))))})||,|||..,|||||.||,,.,,..,,)),,}}}||{{{||||{(|,,..{{{{|.,,.(((((....)))))....}||||,{{((((((,((({.....,,}}}}..}},,}}}}}....}||||||{|||,..,}})))}})))}|.((({.((((((({{({{,,{,{{{{{|,.......})}})))}},,...((((((((.((((((((((((......)))))}((.(((.((((((..((.....))..)))))).))).)),)))))).))))))))....{{{({,,{(,{(((((((((((((((..(((.(((((..(((..({{,...,||..,......((((.((((({...})))))..)))),,.,,)))..))))).)))..)))))))....))))))))}{{{{{{{{{{..{||...))).,))))),,,,}}))),...,}})).}}))....})))))).})))((((((({{,.....,))))))))..,,,,,||......))...))
Back