Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0013700

Sequence Length

708 nt

GC Content

0.4011

UGGUACAUGAUCAGCAUUGUCCACAUUUACAAUCGAUGGAGGAACAGUGAAAUUCGGUGUUAUGUUAAUGGACAACUGGUAUCUUAUGGUGAUAUGGCUUGGCAUGUUAACACAAAUGAUAGCUAUGACAAGUGCUUUCUUGGAUCAUCAGAAACUGCUGAUGCAAAUAGGGUAUUCUGUGGUCAACUUGGUGCCGUGUAUGUGUUCAGUGAAGCACUCAACCCAGCACAGAUAUUUGCAAUUCAUCAGUUAGGACCUGGAUAUAAGAGUACCUUCAAGUUUAAAUCUGAGAGUGAUAUUCAUUUGGCAGAACAUCAUAAACAGGUGUUAUAUGAUGGGAAACUUGCAAGUAGCAUUGCCUUUACAUAUAAUGCUAAGGCCACUGAUGCUCAGCUCUGCCUGGAAUCAUCACCAAAAGAGAAUGCAUCAAUUUUUGUGCAUUCCCCACAUGCUCUAAUGCUUCAGGAUGUGAAAGCGAUAGUAACACAUUCAAUUCAUAGUGCAAUUCAUUCAAUUGGAGGGAUUCAAGUGCUUUUUCCACUUUUUGCCCAAUUGGAUAAUAGGCAGCUCAAUGACAGUCAAGUGGAAACAACUGUCUGUGCUACUCUGUUGGCAUUCCUGGUUGAACUACUUAAAAGUUCAGUAGCCAUGCAAGAACAGAUGCUGGGUGGAAAAGGCUUUUUAGUCAUUGGCUACUUACUUGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-188.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -202.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 196.19

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.((..(((((..((((((((((..(((.((((.................))))))).))))....))))))))))).((((.(((((((((((((...(((..........)))..))))))....((((((((.((((((((((((......))))))((.(((.((((((..((.....))..)))))).))).)).)))))).))))))))....((((..((((((((((((((((((((..(((.(((((..(((..((((...............((((.((((((...))))))..)))))).)))))..))))).)))..)))))))....)))))))))((((((((((..(((...)))..)))))....))))).....)))).))))....))))))).))))((((((((........)))))))).......((......)).((((((.(((..((((..((((.((((..........(((((.(((.((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).))))))))))))))..))).))....((((((...((....)).)))))))))).)))).))))..))))))))).)).))))(((..((((..((((((((.(((........)))(((.((((((....)))))).))).)))))))).))))...)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.{{{{({{{{{{(((((({((({.,,..,,||}}..}},,}},||....))}|)}},,|||,.,|}}))}|}}}||,((,,.{{{{{{{||{|,|,|.|||||||.},,...,},|}||||||.,.((((((((.((((((((((((......)))))}((.(((.((((((..((.....))..)))))).))).)),)))))).)))))))),.,{(((({{,,,.,(((((((((((((((..(((.(((((..(((..({{,...,||..,......((((.((((({...})))))..)))),,.,,)))..))))).)))..)))))))....)))))))}|(((({(((((..(((...)))..)))))..,,||}}}},,,.,|||{||||....,,,,))}.,,|,((((((({,{.....,))))))))......{((.((,,((.....(((((((...((....))..)))))))....))))).))}.,,.((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).))))))))))),,,,})))||.,,..((((((...{(,...}).)))))),)})}},,{(((({.((({..{{(,{{(((((.......)))))).}}),,))))...}))))}}))}))))|||,,.,|||,,,,})))},,}))))|||,,,,...)))