Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0013900

Sequence Length

1110 nt

GC Content

0.3964

UGGUACAUGAUCAGCAUUGUCCACAUUUACAAUCGAUGGAGGAACAGUGAAAUUCGGUGUUAUGUUAAUGGACAACUGGUAUCUUAUGGUGAUAUGGCUUGGCAUGUUAACACAAAUGAUAGCUAUGACAAGUGCUUUCUUGGAUCAUCAGAAACUGCUGAUGCAAAUAGGGUAUUCUGUGGUCAACUUGGUGCCGUGUAUGUGUUCAGUGAAGCACUCAACCCAGCACAGAUAUUUGCAAUUCAUCAGUUAGGACCUGGAUAUAAGAGUACCUUCAAGUUUAAAUCUGAGAGUGAUAUUCAUUUGGCAGAACAUCAUAAACAGGUGUUAUAUGAUGGGAAACUUGCAAGUAGCAUUGCCUUUACAUAUAAUGCUAAGGCCACUGAUGCUCAGCUCUGCCUGGAAUCAUCACCAAAAGAGAAUGCAUCAAUUUUUGUGCAUUCCCCACAUGCUCUAAUGCUUCAGGAUGUGAAAGCGAUAGUAACACAUUCAAUUCAUAGUGCAAUUCAUUCAAUUGGAGGGAUUCAAGUGCUUUUUCCACUUUUUGCCCAAUUGGAUAAUAGGCAGCUCAAUGACAGUCAAGUGGAAACAACUGUCUGUGCUACUCUGUUGGCAUUCCUGGUUGAACUACUUAAAAGUUCAGUAGCCAUGCAAGAACAGAUGCUGGGUGGAAAAGGCUUUUUAGUCAUUGGCUACUUACUUGAAAAGUCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAGAUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-286.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -306.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 231.71

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((...((....((((((((.((((.......))))..)).))))))....))(((((..((((....)))).(((((((....((((((.((((..(((((.(((.....((((..((((...((((((((.....(((.((((.(((...))).)))).)))((((((....(((.....(((((..(((.((((((((((((((((..(((((.......(((((((((((((((((((((((..(((.(((((..(((..((((...............((((.((((((...))))))..)))))).)))))..))))).)))..)))))))....))))))))).....(((((..(((...)))..)))))...((((((....((((...(((........)))..))))...))))))...)))))))...........((......))....(((((((...((....))..))))))).......))))).....((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))....((((((((...((((((...((....)).))))))...((...((((((.((((..(((..((((((.......)))))).)))..))))...)))))).))(((((((..((((((....)))).))..)))))))(((((.......)))))((((.....)))).))))))))((((.((((..........)))).....(((.....))).....(((((((((..((((...))))..)))))))))................)))).)).))))))))))))))..))).))))))))....)))))).....)))))))).)))).)))).....)))))))))))).).)))))..)))).))).((((........)))).((....))))))).........)))))((.(((.....(((..((((.(((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)))...)))).))))))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({...,{(((((.(((((({(((,.,,..{{||}}..,,,,||.||....))}|)|}.,|||...,})))),(((((((....(((((,.((((..(((((.(((..,,.{(((..((((...((((((((.....(((.((((.(((...))).)))).)))((((((.,..(((.....(((((..(((.((((((((((((((((.............(((((((((({(((((((((((((..(((.(((((..(((..({{,...,||..,......((((.((((({...})))))..)))),,.,,)))..))))).)))..)))))))....))))))}{(((((((..........})))))))...((((((((..(((...((((((((........}}....{.((((((({,,.....,))))))))......(((.((,,((.....(((((((...((....))..)))))))....))))).)))....((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))..})))))).....)))..))),,)))).......))))))))))..((((((.((((..(((,{((((((.......)))))).}))..))))...)))))).(((((((,{{.,,(((({{{((({,,..{{,,.{{..,,{({.|||||{|||||{{{{{.....,,}|))))}.|,,....((((..........)))).....,{|}}}}}))),,...{{{{||||{..{,{|}},}))).})))))))}}..........,,,.)))))))}).))))))))))))))..))).))))))))....)))))).....)))))))).)))).))))..,,.)))))))))))).,.)))))..)))).))){(((({{..,((({{{,.,.}}}}))..,||,........}},,,||}|||,,,,..}}}}|||{.{((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)}}...,,))))))))),.,,