Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0016100
Sequence Length
720 nt
GC Content
0.3958
AACAUCAUAAACAGGUGUUAUAUGAUGGGAAACUUGCAAGUAGCAUUGCCUUUACAUAUAAUGCUAAGGCCACUGAUGCUCAGCUCUGCCUGGAAUCAUCACCAAAAGAGAAUGCAUCAAUUUUUGUGCAUUCCCCACAUGCUCUAAUGCUUCAGGAUGUGAAAGCGAUAGUAACACAUUCAAUUCAUAGUGCAAUUCAUUCAAUUGGAGGGAUUCAAGUGCUUUUUCCACUUUUUGCCCAAUUGGAUAAUAGGCAGCUCAAUGACAGUCAAGUGGAAACAACUGUCUGUGCUACUCUGUUGGCAUUCCUGGUUGAACUACUUAAAAGUUCAGUAGCCAUGCAAGAACAGAUGCUGGGUGGAAAAGGCUUUUUAGUCAUUGGCUACUUACUUGAAAAGUCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-175.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -189.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 207.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.............((((((((((((.(((.....(((.....)))...))).).)))))))))))...(((((((.((.(((((.((((((((........))......((((((((........))))))))......(((.(((.((.....(((((((...((....))..)))))))....))))).)))....((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))...))))))......((((((...((....)).))))))(((.((((((((((((((((((((((((((((.......))))))...))))........(((((((((((((((...(((((..((((.((..(..(((..(((((.......)))))))).)..)).))))))))).)))....((((..........)))).....(((.....))).....(((((((((..((((...))))..)))))))))..............)))))).)))))).........((((....))))(((((.......................))))).......)))).)))))..................)))))))))..)))((((((....)))))).....................(((((...))))).))))))).))))))).......((((....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.{(((.,,..,.||||||,||{{||(({.....,((,,,,,|||{{{|||{..|||,,,))),,}}}||,,{{|}||,|{{||,{{||{(((........)),...|.((((((({{{.....,)))))))),,....|{{,((((({{,,..(((((((...((....))..)))))))....}}}||,||,,,,.((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).))))))))))),,,,,)))},,....((((((...{(,...}).)))))){{(,(((((((((((((({{((((((((((((.......))))))...)))),{,.....((((((((((((,{(,,,((((({{((({,,..{{,,.{{..,,{{{.|||||,|||||{{{{{.....,,}}))))}.|,,....((((..........)))).....,{|}}}}}))),,...{{{{||||{..{,{|}},}))).}))))))}}}..........,,,.))))))},)))))..........{{|,|..|||{(((((.......,,......,...,...))))))}},...)}}}.}}}}}..................)))))))))..,,,((({{{....}}))))................,,.,,((({,...,,,}},)))))))}})))))),},,,,}|}.},}.})))}
Back