Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0018700
Sequence Length
2662 nt
GC Content
0.3918
UGCUACUCUGUUGGCAUUCCUGGUUGAACUACUUAAAAGUUCAGUAGCCAUGCAAGAACAGAUGCUGGGUGGAAAAGGCUUUUUAGUCAUUGGCUACUUACUUGAAAAGUCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAGAUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAGGAUCGAGGGGUCAAGGAAGAUGAACUUCAGAGUAUAUUAAAUUACCUACUUACGAUGCAUGAGGAUGAAAAUAUUCAUGAUGUGCUACAGUUACUGGUGGCUUUAAUGUCGGAACACCCAGCCUCAAUGAUACCAGCAUUUGAUCAAAGAAAUGGAAUAAGGGUGAUCUACAAAUUAUUGGCUUCUAAAAGUGAAAGUAUUUGGGUUCAAGCUUUGAAGGUUCUGGGAUACUUUCUGAAGCAUUUAGGUCACAAGAGAAAAGUUGAAAUUAUGCACACCCAUAGUCUUUUCACUCUUCUUGGAGAAAGGCUGAUGUUGCAUACAAACACUGUGACUGUCACCACAUACAACACACUUUAUGAGAUCUUGACAGAACAAGUAUGUACUCAGGUCGUACACAAACCACAUCCAGAGCCAGAUUCUACAGUGAAAAUUCAGAAUCCAAUGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-662.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -714.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 707.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......)))))....((((((((((.......))))))(((((...((((((......((((((((((....(((((((((((((((((......(((((.......)))))(((((.........))))).(((((.............((((.(((((....(((.((((......)))).)))....))))).))))...((((((.(((..((((((((....((((....)))).......(((((((...(.(((.((((((.((...........(((((((((((.....((..(((.((((.((.(((((((((((.((..(((((((....((((((....)))))).........(((((.(((.(((((((..(..((((((((.(((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)))...))))...........((((....)))).))))..)..))).))))))))))))......))))))).)))))((((((.((....)).)))))).((((((((.....((((((........((.((.....)).))........))))))(((((........))))).....(((((((((..(((((..((.((((....)))).))...)))))((((...(((((...((((((((((((.(((((.(.((((((.(((..(((((((((.(((.....((((((.((...((((((((...((((....))))))))))))..))))))))..)))..(((..((((((...((((..........))))......)))))).))).(((((.((....))))))).......((((((((.((((.(((..(((.((.......((((((....)))))).....(((((.....(((......))).....)))))......(((((......)))))(((.((((((((((((((...(((.........)))....)))..))))))))))).)))........)).)))..))).))))....)))))))))))))))))..........((((..........))))((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).)))))))).(((((........))))).(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....)))).))).)))))).).)))))))))((((((.(((((.((...(((((..................))))).....)).))))).))))))((((...................))))((((....))))(((((((.....)))))))......))))))))...)))))..))))))))))))))).))))))((((((...(((........)))......))))))........(((((((.............))))))))))))))).)))))).))).))......))))))))))).......)).)))))).))).)........(((((((((.(((((......))))).).))).))))))))))))((((((((((((..((((.(((((((...(((((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....((((((...(((((......)))))......((((....)))).....))))))))))))).)).......))))))).)).....))..))))).))))))).)))))))).......(((((((........))))))).(((((((.(((.(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))(((((.(((.....(((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...)))...............(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))..)))))..)))).)))....))))))))...............)))))))))))))......((((((........)))))).))).))))))...))))).......(((...((((((((((((((.......((((...))))..((((((((((...........)))))))....))).))))).))).))))))...)))..))))))))))))))...)))...((((....(((.((((...((((((......).)))))...)))).)))....)))).)))...)).)))))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))....((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........)))))))).(((((((.......)))))))))).))).)))))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......)))))....((((((((((.......))))))(((((...((((((.,,,,.(((((((({{....(((((((((((((((((...,..(((((.......||}}}(((((.........))))).{({{{{.{(((..........}}||.....,,(||.||||,.....||||{|||,..,|||||.}}}},|}||||||||{,..............|||({{{{|}||.......(((((((,,{({(({.((((((,({..........,({(((((({{(.,{{{{(,.{{(,(({({((.((((((((({{.({..(((((((....((((({....}))))).........{{{{,{(((.(((((((..{..((((((((.(((.{(((((((....(((..{{(({..(((((((...)))))))...............})).}).,))}.....)))))))|....}))...)))}...,.,,...,((((....}})).}}}}.,},.}})}})}})))}}}}}......))))))).}}}}}((((((.((....)}.)))))).((((((((.....((((((,{,.....((.((.....)},)),.......})))))(((((........))))).....(((((((((..(((((..((.((((....)))).)},..)))))(((({..(((((...((((((((((((.(((((.{.((((({.(((..((((((({{,,,|,....{|((({,{{,{.(((((((({,.((((....}||)}}))))}|,|}|||||||{.{{{{{(((,,{((((({{{(,,,........,.,}}|.,.,,,||}}}}.,}}.{{{((,{(...,}}}))))......,{{,,{{{{{{,{{,{{|||,,{,||.....,.((((((....))))))..,.}}}}}|}}|,|{{{,........((((.(((...))).)))),{,,,,,,}}},|(((.((((((((((((((.{{(((.........))).}}.)))..))))))))))).)))},...,})))))))}.,)))))))}},})))),},)))))))}}),.........((((..........))))((((((((.{.(((.{{.({{.......})}}}.)))}.)))))))).(((((........))))).{((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..))))}((((..(((((((...)))))))....)))).))).)))))).}.))))))))){{((((.{((({.((...{((({..................}}))).....)).))))).)))))}{,{{...................})))((((....))))(((((((.....)))))))......))))))))...)))))..))))))))))))))).))))))(((({{.,.(((........)))......}))))}....,,,.{((((((....,,.....,,))))))})))))))).,})))).}))})},}},.,)))))))))),.....,}))}))))))})}),)........{{{{{((((.(((((......))))).)}))).))))}))))))){((((({{((((,.{{{{.(((((((...(((({{({{,...((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))...,{{{{{{,,.(((((......)))))......((((....))))..,..}}}}}})}})))}.)).......))))}})|))}..|,,},,)}}}}}}})))}},,..............(((((((........))))))).(((((((.(({{(({......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))),||{{{(((..{..,,..}||})}},||,......{(((((.....}}}}},{((((({.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{{{,|,...),)}))))))))||}}||....}}},,..,....)))))))))))))......((((((.,,.....)))))).)))})),,,,..||}|||.......|||,..,{(((({{{(((((.....|.((({...)))),.{({(((((((...........)))))))...,}},,))))).))).))))))}},)}}..))))))))))))))}..,}}{{.((((.,{,(((.((((...((((((......)}}))))...)))).))).},.)))).))}...|).)))))((((((((.{.{{,.....{{.((((((((...)))))))).))))}.))))))))).....(((((((((.....))))))))),|..((((((((...........|{((.......),,,.,,{{{.,,,,,....,,,))}.}}........)))))))).{||((({.......)))))))))),))).)))))...))))...
Back