Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0019400
Sequence Length
511 nt
GC Content
0.3933
UGCUACUCUGUUGGCAUUCCUGGUUGAACUACUUAAAAGUUCAGUAGCCAUGCAAGAACAGAUGCUGGGUGGAAAAGGCUUUUUAGUCAUUGGCUACUUACUUGAAAAGUCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAGAUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-116.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -125.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 119.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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