Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0020200

Sequence Length

2417 nt

GC Content

0.3306

AAUAUGUUCUGUGAGGAAGAGUUUUUUUCUUCAAUUUUGCUAGCUGCUUUUUUGACAGUGCCAGGGAGCAUAUUUGACUAAUAGUGAGUAAUCAACAUGUAUAUUUUCUAAAUGACUAAAAGUCUUGAGUUCUACCUUUAAGGUAAAGGAAAUGUAUGCAAGGGUGUUACAAACUGGGGGAGCAACAUGGUAAAGCAGGGAAGCAAACGUGUCCUGUGGGUGAAAUUGGCCCACAGUAAUAUUCUGUAGGACUCAGCAAAGAGGUUAGUUUUGGUCCUCACCAAUCUUUAUUGUCUCCUACUCUAGUUUACACAUUGUUGUUAGUUAUUUGCAAUCAUUUUAGUUCGUGACCGUUUAUGUAGAAGUGUGAAAAUUCAUGAAGUGCUUAAGUCAAAUAUAUUGAGUUAUCCUUAUUAUGAGCAUGAAAAAUGUAGCUAAAUCAUAUGGGAGGUAAAAUUGGUAAGACAAUUUCAUCCCUUUUAAACUUAGAUUGUUUUAAACUGAUAUUCAGACUUCAGUUAGUGAAGAAUAGCGAGGAAAGAUGUGUUGUGUGAUGUGUGCUUCAGGAUUGAGUGAUAGGUGAUUCUUUACCCUAUGACUGAAAGGAUAGUGAUACUACAAAAUAGUAUCACUAGAUGAGGAAGAAAAGAUUUAUGUAGGAAGAUAAAUUUUUUGAUAUUUGAGUUUGAAUUAUCAGCUUUUAUGAAGAGCAUUUUUUUAAUAUUAUAGCAUUUUUAUCUGAAAUUGUAUUCUAGUAUAGCAUUGUCCAAUUAAAUUACAAUUCAAGCCUCAGGUGCAAUUUAAUAUUUUCUAGUAAAAAAAUACAGGUGGUAUUAAUUUUAAUAACGUAUUUAGCCUAGUAUUUUAUUUUGAUAAUAUGCAAUAUAUUAUUUCAACAUCUAUUCAAUAAGAAAAUAUGAUUUUUAAAAAUAUUCUGAGCUGGAAAAACCCAGUUUUUUCAUACUUAUGACACAUCUCACUUUCAAUUGCAAUAUUCCAGCAGCUCAAUGGCCACAUAGGGCUUCUGGCUACUGUAUGAGAUGGUGCAGCUUUAAGGUUUGGUUUCAAUUUUGGAGAGUCUGUUGUUUAAAUACCAUUGGUAAUAGGUACAUGGUGAUAGUAGUUGAAAAUUCUUGAAGCGAGUGUUCAGCAUAGACAUAGUGUUAUAUGAAGCUGUGAAAGCAUACUAUAUCAUCCAAGGAUAGAGUAUUUAUGGAGAAGAGAAGGCCAAGGAAAUAAUAUUUUAAGCAGUAUUUUACAUAUUUUUAAGCAGUAUUUUUACAUAUUUUAAACACUAUCACUUUUUAUUUCUAUGUCUAAGAUCUCUUCUUGUAUGUCAAUUUCUACAAAAAAUGAAAUGAAGCCAUUAUUUAUAACAUUUCAUUUCUUUAGCUAAUAGUAGAAUUAUUUAACUUGAAUUAUUUAUCUGUAAUUGUCUUAGAUCAGGCUUCAAAUAACAAGCUAUCACUCAAAGAAAUAGCUGAAAUUUUAGAUCUCUUAAAGUUAUAUUUUAAUAGCAAAGAAAACAAAUGUUUAUUUCAUAUUUAUUAGGGAUAGCAUAUGAAAAAUUCAUGUGUCCUUAUGCUAAAUCAGAAAUUAUACAAUUUGAUAUUCUGGAUGUUUCAAGCUAGAAUUUCUGUUUUCUUUCUUAGUCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAGAUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAGGAUCGAGGGGUCAAGGAAGAUGAACUUCAGAGUAUAUUAAAUUACCUACUUACGAUGCAUGAGGAUGAAAAUAUUCAUGAUGUGCUACAGUUACUGGUGGCUUUAAUGUCGGAACACCCAGCCUCAAUGAUACCAGCAUUUGAUCAAAGAAAUGGAAUAAGGGUGAUCUACAAAUUAUUGGCUUCUAAAAGUGAAAGUAUUUGGGUUCAAGCUUUGAAGGUUCUGGGAUACUUUCUGAAGCAUUUAGGUCACAAGAGAAAAGUUGAAAUUAUGCACACCCAUAGUCUUUUCACUCUUCUUGGAGAAAGGCUGAUGUUGCAUACAAACACUGUGACUGUCACCACAUACAACACACUUUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-554.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -605.21

Frequency: 0.0000

Diversity: 616.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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