Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0020300
Sequence Length
765 nt
GC Content
0.3869
UCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAGAUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAGGAUCGAGGGGUCAAGGAAGAUGAACUUCAGAGUAUAUUAAAUUACCUACUUACGAUGCAUGAGGAUGAAAAUAUUCAUGAUGUGCUACAGUUACUGGUGGCUUUAAUGUCGGAACACCCAGCCUCAAUGAUACCAGCAUUUGAUCAAAGAAAUGGAAUAAGGGUGAUCUACAAAUUAUUGGCUUCUAAAAGUGAAAGUAUUUGGGUUCAAGCUUUGAAGGUUCUGGGAUACUUUCUGAAGCAUUUAGGUCACAAGAGAAAAGUUGAAAUUAUGCACACCCAUAGUCUUUUCACUCUUCUUGGAGAAAGGCUGAUGUUGCAUACAAACACUGUGACUGUCACCACAUACAACACACUUUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-166.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -181.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 251.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.........)))))........((((..........)))).......)))))))).....(((((((((.(((((((((((.(((....)))..))).............((((....))))............))))))))(((((.......................)))))......(((........)))..........(((.((..(((((((....((((((....)))))).........(((((.(((.(((((((..(..((((((((.(((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)))...))))...........((((....)))).))))..)..))).))))))))))))......))))))).)))))((((((.((....)).))))))(((((..((((((((.((((......((((...((((..((((((............(((((........)))))........((((((((..........(((((.......((((((((((.(((((((...)))))....)).)))))))))).)))))...))))))))....((((((.....((((((......)))))))))))).((((....))))..)))))).)))))))).....))))))))))))...)))))........)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{{{(((((((.,...,,{.}||||,,,.,{{,{{,(,,,,,,{{{,||||,....,,}||||}||,,,,,((((((((((,,{{{{{{{{|||||}}||||||{{{{{.,,,,,,,{,,,((((,,..}||}........,{((,{,.|||{(((((.......,,.....,....,...)))))}}}}.,{{{..,{{,..,||,,.......,{.,..||||{(((((....((((({....}))))).........,{{{.,{{{.|||||||,.{..((((((((.(((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)))...))))...........((((....)))).}))).})},)))}))))}))))}}}......}}))))}....)))},}}))||}|},,}.)))),)})},)}}.,}}}}|{{{((({{,,..,{((.(({.,,{||,||{{{,,{|{,,|||}{{{{{...,,...)}}))},}},,)})))})),}}}},...,}.|||||...,|||{,,,((((,({(,.,|,.{{{|||||||{.}}.}},,)))))).)))))....,||||||,........{{{{....((((((.{,...((((((((,..((((....)))))))))))).})}))))))..,.},})))))))},..})).)}}}....,,)))))))))
Back