Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0020400
Sequence Length
2874 nt
GC Content
0.3946
UCAUCAAGAGUUCAUAUAACUAGAGCUGUCCUGGAGCAAUUUUUAUCUUUUGCAAAAUACCUUGAUGGUUUAUCUCAUGGAGCACCUUUGCUGAAGCAGCUUUGUGAUCACAUUUUAUUUAACCCAGCCAUCUGGAUACAUACACCUGCAAAGGUUCAGCUUUCCCUAUACACAUAUUUGUCUGCUGAAUUUAUUGGAACUGCUACCAUCUACACCACCAUACGCAGAGUAGGAACAGUAUUACAGCUAAUGCACACCUUAAAAUAUUACUACUGGGUUAUUAAUCCUGCUGACAGUAGUGGCAUUACACCUAAAGGAUUAGAUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAGGAUCGAGGGGUCAAGGAAGAUGAACUUCAGAGUAUAUUAAAUUACCUACUUACGAUGCAUGAGGAUGAAAAUAUUCAUGAUGUGCUACAGUUACUGGUGGCUUUAAUGUCGGAACACCCAGCCUCAAUGAUACCAGCAUUUGAUCAAAGAAAUGGAAUAAGGGUGAUCUACAAAUUAUUGGCUUCUAAAAGUGAAAGUAUUUGGGUUCAAGCUUUGAAGGUUCUGGGAUACUUUCUGAAGCAUUUAGGUCACAAGAGAAAAGUUGAAAUUAUGCACACCCAUAGUCUUUUCACUCUUCUUGGAGAAAGGCUGAUGUUGCAUACAAACACUGUGACUGUCACCACAUACAACACACUUUAUGAGAUCUUGACAGAACAAGUAUGUACUCAGGUCGUACACAAACCACAUCCAGAGCCAGAUUCUACAGUGAAAAUUCAGAAUCCAAUGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGUAAGUAAAACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-725.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -779.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 836.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.........)))))........((((..........)))).......))))))))(((......((((((.....(((((.(((((........(((((((((..........((((((((....))..(((((((...(.(((.((((((.((...........(((((((((((.....((..(((.((((.((.(((((((((((.((..(((((((....((((((....)))))).........(((((.(((.(((((((..(..((((((((.(((.((((((((....(((..(((((..(((((((...)))))))...............))).))..))).....))))))))....)))...))))...........((((....)))).))))..)..))).))))))))))))......))))))).)))))((((((.((....)).)))))).((((((((.....((((((........((.((.....)).))........))))))(((((........))))).....(((((((((..(((((..((.((((....)))).))...)))))((((...(((((...((((((((((((.(((((.(.((((((.(((..(((((((((.(((.....((((((.((...((((((((...((((....))))))))))))..))))))))..)))..(((..((((((...((((..........))))......)))))).))).(((((.((....))))))).......((((((((.((((.(((..(((.((.......((((((....)))))).....(((((.....(((......))).....)))))......(((((......)))))(((.((((((((((((((...(((.........)))....)))..))))))))))).)))........)).)))..))).))))....)))))))))))))))))..........((((..........))))((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).)))))))).(((((........))))).(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....)))).))).)))))).).)))))))))((((((.(((((.((...(((((..................))))).....)).))))).))))))((((...................))))((((....))))(((((((.....)))))))......))))))))...)))))..))))))))))))))).))))))((((((...(((........)))......))))))........(((((((.............))))))))))))))).)))))).))).))......))))))))))).......)).)))))).))).)........(((((((((.(((((......))))).).))).))))))))))))((((((((((((..((((.(((((((...(((((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....((((((...(((((......)))))......((((....)))).....))))))))))))).)).......))))))).)).....))..))))).)))))))................(((((((........))))))).(((((((.(((.(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))(((((.(((.....(((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...)))...............(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))..)))))..)))).)))....))))))))...............)))))))))))))......((((((........)))))).)))))).........(((.......)))...((((((((((((((.......((((...))))..((((((((((...........)))))))....))).))))).))).)))))).(((((((.....(..((((((.((((((((((((....(((.((((...((((((......).)))))...)))).)))....)))).((((((((....))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))....((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........)))))))).(((((((.......)))))))..((((.(((((((........))).))))...))))))))))....((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).))))))(((((((...(((....))).)))))))))))))))......((((((....((((......))))...))))))(((((.......)))))..............))))))..)))))))))))))))))))))).))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({((((.........|}}}}.....,,.((((..........)))).......)))))))){{{...,..{(((((.....(((((.(((((........(((((((((...,...{,{({{{{||||...,...{{(({((,.{({(((,((((((.{,...........{|{{{((({{{.,{{{{(,.{{({(({({((.({({(((({,{.({..{((((((....((((({....}})))).........,{{{,{(((.(((((({..{..(((({{{{.{{{,|(({{{{{....(({..{|{{{..(((((((...)))))))...............}}}.}}.,}}|,....}}}|||||,,,,|||...}}}}...,,{,,,,,((((,,,.}|||.}}}}.,},.}}))))}|}|||}}},......)}))))}.,,,}}((((((.((....}}.)))))).((((((((.....((((((,{,.....((.((.....)},)),.......})))))(((((........))))).....(((((((((..(((((..((.((((....)))).)},..)))))(((({..(((((...((((((((((((.(((((.{.((((({.(((..((((((({{,,,|,....{|((({,{{,{.(((((((({,.((((....}||)}}))))}|,|}|||||||{.{{{{{(((,,{((((({{{(,,,........,.,}}|.,.,,,||}}}}.,}}.{{{((,{(...,}}}))))......,{{,,{{{{{{,{{,{{|||,,{,||.....,.((((((....))))))..,.}}}}}|}}|,|{{{,........((((.(((...))).)))),{,,,,,,}}},|(((.((((((((((((((.{{(((.........))).}}.)))..))))))))))).)))},...,})))))))}.,)))))))}},})))),},)))))))}}),.........((((..........))))((((((((.{.(((.{{.({{.......})}}}.)))}.)))))))).(((((........))))).{((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..))))}((((..(((((((...)))))))....)))).))).)))))).}.))))))))){{((((.{((((.((...{((({..................}}))).....)).))))).)))))}{,{{...................})))((((....))))(((((((.....)))))))......))))))))...)))))..))))))))))))))).)))))){{{{{{.,.(((........)))..,...}}}}}|....,,,,|((((((....,,.....,,))))))}}))))})},,,}}}}.}))})},}}},})))))))}}},......}))}))))))}),},}..,.....{{{((((((.(((((......))))).),))).))))}})}))))|{{{{{{|||||}|||||,|||||||,,}|||{|||,|}...((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).)))))))){{{{(((,,({{.(((((......)))))......((((....)))),{{{{{{|||||||||||{,,...{{{{,,,||||{||{..{{.|{{|{{||{{{||,||,,..........,,..(((((((........))))))).(((((((.(({{(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))).|{({{(((..,..,...}||))}},||.......{(((((.....}}}}},{((((({.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{{{,|,...),)}))))))))|}}}||....}}}},.......)))))))))))))......((((((........)))))).}|},||{{{{{{(({(({..,{...|||{,.{{((((((((((((.....,.((({...}))),.{({(((((((...........)))))))...,}},.))))).))).))))))}|,(((,,{{{,..{,(({(((,(,,((((.((((.,,{(({,({({...{{||{|,,....)),)))).,,)))},))).,..)))).|||..,((....))||||||||.}}}}}}}....}}||||||||}}},)))))))})),,)})),)))),,.}}}},,,,,||||}},,})}}}}))))}}},,{{(((((..,.....,,,||||.......,,,....|||.}}}}},,..,|||||.|,.....,,,)))))|||,{{{(((((,..{,.{|||{{|{{(((({((({{{{...{{{{{{{|..,,...})))..))))....,{(((((.(..((.{(((((((((((((.{((((..((({...,.({,,(((((,,...)))))..)),,}}.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))}.))..).))))))|((((({...(((,,..||||||}||}}}}}}}}}},,.,,,||||||.,..||||,,,...)})),,,))})))|||{{.....,,))))).,,..,})}}}..,}}}}|||,,}}))))}}))))))))))))).)))))))))))))}
Back