Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0022100
Sequence Length
2231 nt
GC Content
0.3913
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-550.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -595.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 554.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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