Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0022200
Sequence Length
2829 nt
GC Content
0.3980
AUGGUCCCCGGCCAUCACAAAAAGAAAUUAUAUCACUGAGGGCAUUUAUGCUACUUUUUCUGAAACAGCUGAUACUAAAGGAUCGAGGGGUCAAGGAAGAUGAACUUCAGAGUAUAUUAAAUUACCUACUUACGAUGCAUGAGGAUGAAAAUAUUCAUGAUGUGCUACAGUUACUGGUGGCUUUAAUGUCGGAACACCCAGCCUCAAUGAUACCAGCAUUUGAUCAAAGAAAUGGAAUAAGGGUGAUCUACAAAUUAUUGGCUUCUAAAAGUGAAAGUAUUUGGGUUCAAGCUUUGAAGGUUCUGGGAUACUUUCUGAAGCAUUUAGGUCACAAGAGAAAAGUUGAAAUUAUGCACACCCAUAGUCUUUUCACUCUUCUUGGAGAAAGGCUGAUGUUGCAUACAAACACUGUGACUGUCACCACAUACAACACACUUUAUGAGAUCUUGACAGAACAAGUAUGUACUCAGGUCGUACACAAACCACAUCCAGAGCCAGAUUCUACAGUGAAAAUUCAGAAUCCAAUGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGUAAGUAAAACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUGGAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-728.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -783.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 607.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...))))))(.............((((((....((((.(((((.((((((((((((..........((((((((((((((((((((...((((.....)))).((((((......................((((((.((....)).)))))).((((((((.....((((((........((.((.....)).))........))))))(((((........))))).....(((((((((..(((((..((.((((....)))).))...)))))((((...(((((...((((((((((((.(((((.(.((((((.(((..(((((((((.(((.....((((((.((...((((((((...((((....))))))))))))..))))))))..)))..(((..((((((...((((..........))))......)))))).))).(((((.((....))))))).......((((((((.((((.(((..(((.((.......((((((....)))))).....(((((.....(((......))).....)))))......(((((......)))))(((.((((((((((((((...(((.........)))....)))..))))))))))).)))........)).)))..))).))))....)))))))))))))))))..........((((..........))))((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).)))))))).(((((........))))).(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....)))).))).)))))).).)))))))))((((((.(((((.((...(((((..................))))).....)).))))).))))))((((...................))))((((....))))(((((((.....)))))))......))))))))...)))))..))))))))))))))).)))))).))))))..))))).)))(((((((((....)))....))))))((((((.............))))))....((((((........))))))))))))))))))..........))))))))))))...........)))))))))..))))))((((((((..(((((..((((((((((.((((((.....((((...((((((.(((((...((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))(((((((..(((.(((((......)))))......((((....))))(((((((((((((.(((((.....((((...((((((((..((.(((((((((((((.((((..........))))(((((((........))))))).(((((((.(((.(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))(((((.(((.....(((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...)))...............(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))..)))))..)))).)))....))))))))...............)))))))))))))......((((((........)))))).....((((((((((((((.(((.....((((..((((((((((((.......((((...))))..((((((((((...........)))))))....))).))))).))).)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))...((....))..))).)).)))))))....)))))...))))).))))))))))..)))).))))...)))).....))))))))))....))))))))....((((((((...))))))))..............))).)))))))..((((((.((.....)))))))).(.((.((((((..(((.(((((((((((((((((.......((((((((.......))))..))))....(((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).)))))))(((((....(((((..((((((.(((........))).)))))))))))..)))))))..)).))))))).)))))))))....)))))))).)..((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))).)))))).)))))...))))))(((((....)))))))))..)))))))))))))))).)))))......((((((..((((((..((((....((.....(((((((((((..........))))))))))).....)).((((((((((((((..(((................(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))..)))).)))..)))))))...........))))..))))))..).))))))))))))).............)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((...))))))(.......,,.,{{((((((.(((({{,.((({({((((((((((((..........((((((((((((((((,(((...,,,{.,,..)))).({(((,.......,},,},,,,......((((({.((....}}.)))))).((((((((.....((((((,{,.....((.((.....)},)),.....,.})))))(((((........))))).....(((((((((..(((((..((.((((....)))).)},..)))))(((({..(((((...((((((((((((.(((((.{.((((({.(((..((((((({{,,,|,....{|((({,{{,{.(((((((({,.((((....}||)}}))))}|,|}|||||||{.{{{{{(((,,{((((({{{(,,,........,.,}}|.,.,,,||}}}}.,}}.{{{((,{(...,}}}))))......,{{,,{{{{{{,{{,{{|||,,{,||.....,.((((((....))))))..,.}}}}}|}}|,|{{{,........((((.(((...))).)))),{,,,,,,}}},|(((.((((((((((((((.{{(((.........))).}}.)))..))))))))))).)))},...,})))))))}.,)))))))}},})))),},)))))))}}),.........((((..........))))((((((((.{.(((.{{.({{.......})}}}.)))}.)))))))).(((((........))))).{((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..))))}((((..(((((((...)))))))....)))).))).)))))).}.))))))))){{((((.{((((.((...{((({..................}}))).....)).))))).)))))}{,{{...................})))((((....))))(((((((.....)))))))......))))))))...)))))..))))))))))))))).)))))){|||||,..({{...,,,..))}..,...||||||....))}}|{(((((....,,......|)))))},.,,||{{{(.,......))))))))))))))))))..........)))))))))))}.,||.......}}...}))),.)))))}||,|||||,.(((((..((((((((((.{(((((,..((((((...((((((.(((((...((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))(((((((..(((.(((((......)))))......((((....))))((((((((((((,{(((((.....((((...((((((((..((.(((((((((((((.,{{{..........,,,.(((((((........))))))).(((((((.(({,(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))).{{({{(((..,......}||))}},||.......{(((((.....}}}}},{((((({.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{{{,|,...),)}))))))))|}}}||....}}}},.......)))))))))))))......((((((........)))))).|{|.(((((((((((({{.,{(,,.,{({{.,{((((((((((((.....,.((({...}))),.{({(((((((...........)))))))...,}},.))))).))).)))))))}.(((..((({..((((.(((({..((((.(({{.,,(((,((.{,....,}),))}...,)).)))).})))).))))....)))).)))..,{{....))),))),)).)))))))....))))),,,))))).))))))))))..)))).))))...)))).....))))))))))....)))))))).,,,(,{(,,,....,}),))}}..............))).)))))))..{(((((.({.....)))))))).{.((.((((((.,(({.(((((((((((((((((,.,....((((((((.......))))..))))....{((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).))))))}(((((....(((({..{(((((.(({,......,})).)))))))))))..))))))),.,).))))))).)))))).}}.,,.)))))))).)..((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))).)))))).)))))...))))))(((({....))))))))},))))))))))))))))).))))),,,,,.{(((((..((((((..((({....({,({{,({(((({(((({{(,,,,.{,||||||||||}....,||.{{{{{{{{,|||{{,}|||}}}}},,}.,}.....(((((((((((((.(........).))).)))))))))).},}.})))),),},,})}))}}}},},......))))..))))))..).))))}.....,,,.............)
Back