Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0024300
Sequence Length
2326 nt
GC Content
0.3990
GAGAAAAGUUGAAAUUAUGCACACCCAUAGUCUUUUCACUCUUCUUGGAGAAAGGCUGAUGUUGCAUACAAACACUGUGACUGUCACCACAUACAACACACUUUAUGAGAUCUUGACAGAACAAGUAUGUACUCAGGUCGUACACAAACCACAUCCAGAGCCAGAUUCUACAGUGAAAAUUCAGAAUCCAAUGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGUAAGUAAAACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-595.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -643.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 442.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((..((((((((.(((.((((.(((((.((((((((((((((((.(((((.((((((((.((((((((((.(((((((((.....................((((......))))..(((((.......))))).....(((....((((.....))))...))).......((((((....))))))....)))))))))(((((.........((((.(((...))).))))......))))).((((.((((((((((((((...(((.........)))....)))..))))))))))).))))....))))))))))..)))).)))).)))))...)))))))((((((.......((((..........))))((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).)))))))).(((((........))))).(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....))))))))))......(((......)))....)))))))))))))).))))....))).......((..(((((((((((((.((((((((.((......((((............(((....(((......(((((((.....)))))))......)))..))).....((((((.((((.((..((((....)))).)).))).).))))))..))))..(((.((((((....)))))).)))........)).))))))))..)))))...((((((....))))))..((((((.......))))))...(((((((............(.(((((((((.(((((......))))).).))).))))).).((((((((((((((((..((((.(((((((...(((((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....((((((...(((((......)))))......((((....)))).....))))))))))))).)).......))))))).)).....))..))))).)))))))........))))....(((((((........))))))).)))))))(((((.........(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))))))).))))))))..)).)).))))))..))))))(((((.....)))))......(((......)))....(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))((.((((((...((((((((((((((((.((((((((..................))))))))((((((........)))))).((.(((((((.....(((.......))).((((.(((....................((((((((...(((((((...........)))))))((..(((...........)))..))..(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))..)))).))))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))((..((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........))))))))..))..))).))))..))))))).)))))))))).....((((((((.......))))..)))).....((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).))))))(((((((...(((....))).)))))))((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))...))))))))((((....))))))))))))....))))))(......(.((((.((.((((..(..((.((.(.((((....)))).).)).))..)..)))).)).)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(...............).(((((((.((((.(((((.((((((((((((((({.(((((.((((((((.((((((((({.(((((((((.........,,,.,,,|,{,{({{{,.,,..},,|,,|||,(,,.||,,|}}}......,||..,.,|||..,|||||}..,}}).....,.((((((....))))))....))))))))},{(({.,.......((((.(((...))).)))).|.,..}}}}},{(((.((((((((((((((.{{(((.........))).}}.)))..))))))))))).))))....})))))))))..))))}}))).)))))...)))))))((((((,......((((..........))))((((((((.{.(((.{{.({{.......))}}}.)))}.)))))))).(((((........))))).{((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..))))}{(((..(((((((...)))))))....))))))))))......(((......))}....)))))))))))))).))))....{,((((((.(((({,{(,,...,}}})))))..)))))).,,..(((((((((.{,,..((((((((((....})))(((((((.....))))))).....,|....}}......,(((({.{{{{,||,.((((....})))....|||,|.}|||||.,((({,{((..,(((((....)))))|{{{{{.....,...,{.{|||,,,.,|}||,||({{{{{...,)))))}||(({{{{..,,...}}}}}}........,{....||.}}}..}}},,.,)))}}(((((......))))}(((((..((((((((((.{(((((,..((((((...((((((.(((((...((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))(((((((..(((.(((((......)))))......((((....))))((((((((((((,{(((((.....((((...((((((((..((.(((((((((((((.,{{{..........,,,.(((((((........))))))).(((((((.(({,(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))).|{({{(((..,......}||)))},||.......{(((((.....}}}}},{((((({.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{{{,|,...},)}))))))))||}|||....}}}},.......)))))))))))))......((((((........)))))).|{|.(((((((((((({{.,{(,,.,{({{.,{((((((((((((.....,.((({...}))),.{({(((((((...........)))))))...,}},.))))).))).)))))))}.(((..((({..((((.(((({..((((.(({{.,,(((,((.{,....,}).))}...,)).)))).})))).))))....)))).)))...{{....))}}))),)).)))))))....))))),,,))))).))))))))))..)))).))))...)))).....))))))))))....)))))))).,,,(,((,,,....,}},)}}}..............))).)))))))..{(((((.({.....)))))))).{,((.((((((.,(({.(((((((((((((((((,,,....((((((((.......))))..))))....{((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).))))))}(((((....((({,..{(((((.({{,....,.,}}).))))))}))))..)))}))),.,).))))))).)))))).},.,,.)))))))).}..((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))).)))))).)))))...))))))(((({....)))))))),,))))))))))))))))).)))))...,||,||},},,},}))))))}}....)))))).,).)))))))))...))).))))
Back