Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0025600
Sequence Length
2386 nt
GC Content
0.4003
AUCUUGACAGAACAAGUAUGUACUCAGGUCGUACACAAACCACAUCCAGAGCCAGAUUCUACAGUGAAAAUUCAGAAUCCAAUGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGUAAGUAAAACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUGGAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-609.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -656.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 666.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((......))))..((((((..(((.........)))..(((((...(((((((((.((((....((((((((((....)))))).....(((((.....(((......))).....)))))......(((((......)))))(((.((((((((((((((...(((.........)))....)))..))))))))))).)))..((((((((.(.(((((.((...(((((((.((((..((....))..)))))))))))....)).))))).)((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).))))))))....)))))))).....))))......)))).))))))))).)))))...(((((......((((((((((((..(((((((...)))))))....)))).(((....(((.((..((.....((((((.(((((.((...(((((..................))))).....)).))))).))))))..)).)).)))....).))......))))))))......(((((((.....)))))))(((((((((((((..((((.((((......)))).((((....))))....(((((..(((((..(((...(((.((((((....)))))).)))..........((.((((.....)))).))((((((....))))))((((......))))......((.............)).)))..)))))..)))))(((((......)))))(((((..((((((((((.((((((.....((((...((((((.(((((...((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))(((((((..(((.(((((......)))))......((((....))))(((((((((((((.(((((.....((((...((((((((..((.(((((((((((((.((((..........))))(((((((........))))))).(((((((.(((.(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))(((((.(((.....(((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...)))...............(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))..)))))..)))).)))....))))))))...............)))))))))))))......((((((........)))))).....((((((((((((((.(((.....((((..((((((((((((.......((((...))))..((((((((((...........)))))))....))).))))).))).)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))...((....))..))).)).)))))))....)))))...))))).))))))))))..)))).))))...)))).....))))))))))....))))))))....((((((((...))))))))..............))).)))))))..((((((.((.....)))))))).(.((.((((((..(((.(((((((((((((((((.......((((((((.......))))..))))....(((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).)))))))(((((....(((((..((((((.(((........))).)))))))))))..)))))))..)).))))))).)))))))))....)))))))).)..((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))).)))))).)))))...))))))(((((....)))))))))..)))))))))))))))).)))))............(((..((((....))))..)))..(((((((((((.((((.....)))).)))))).....)))))..))))..))))))))).))))............(((((((((((((.(........).))).))))))))))...)))))...((((.....((((.......))))))))........((...(((.....))).))....)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((......))))..((((((..{({,{,.......{({{((((.{,((((,((({,(((.({,....,.((((((....)))))).,,,{({{{{.,.,,|||,........{{{{.|||,..}}}.}|||{({,,,,,|||}|{((.((((((((((((((.{{(((.........))).}}.)))..))))))))))).)))||,,.,,|)}.|}},,}|}||}}}{||{|||{(((({{(({{{{{{{{|,,,,,,||||.......,|,}}}}{(((((((.{.(((.,,,{||.......,||||,|}},.||||}}}|.((((({,......,,}}}.{((({.(((((..(((...((((....)))),)))..))))),.}))),((((..(((((((...)))))))....)))),}}}....|||,|||....,,},}|||||.,,,|}}||},,||||,.......{{{{{{.{{{{|,|||.....)),))))).,)))))).,}..{{{{{{{{{.,||..,{{{{{((((,,..}}}}(((((((.....))))))).....{{|{,,||..,,,..(((({.{{{,,||,.{(((,..,}}}}.,,.||{{(.,|||||..(((,..{{..,(((((....)))))|{|||{.....,...,{.{|||,,,.,|}||,||({{{{{...,)))))}||(({{{{..,,,,.},,,,},.......,{,...,|.}}}..}}}}}.,)))}}(((((......))))}(((((..((((((((((.{((((({,.((((((...((((((.(((((...((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))(((((((..(((.(((((......)))))......((((....))))((((((((((((,{(((((.....((((...((((((((..((.(((((((((((((.,{{,..........,,,.(((((((........))))))).(((((((.(({,(({......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))).|{({{(((..,......}||))}},||.......{(((((.....}}}}},{((((({.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{{{,|,...},)}))))))))||}|||....}}},,..,....)))))))))))))......((((((.,,....,)))))).|{{.(((((((((((({{.,{(,..,{({,.,{(((({({(((((.,...,.((({...)))),.|{{(((((((...........)))))))..,}},,,))))).))).)))))))}.(((..((({..((((.(((({..((((.((,{.,.(((,((.,.....,)).))}...,)).)))).})))).))))....)))).)))...{{....))}}}))})}.)))))))....))))),,}))))).))))))))))..)))).))))...)))).....))))))))))....)))))))}.,,{({((,,,....,}},}}||..............))).)))))))..{(((((.{{.....)))))))).{,{(.((((((.{{{{.((((((((((((((((({,,,,..((({((((.......))))..})))....{((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).))))))}(((((....((({,..{(((((.{{{,,..,,,,}}).}})))}})}})..)))}))),.,).))))))).)))))),},.,,.)))))))).}..((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))).)))))).)))))...))))))(((({....})))))))},))})))))))))))))).)))))...|||,,|,,||||,,||||}},,,,,})))))}.,|{||||||||},||,}}}}})))},}}}}||......)),|,,||||,.||||||}||{||}},,.,,,,.,,,,(((((((((((((.(........}.))).)))))))))).,,},,}))).}}}..}}}})))|,.|||..,,}))},},,,,,}}.}}}..{{{.....}}}.}}....)))))).
Back