Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0025700

Sequence Length

1416 nt

GC Content

0.3849

AUCUUGACAGAACAAGUAUGUACUCAGGUCGUACACAAACCACAUCCAGAGCCAGAUUCUACAGUGAAAAUUCAGAAUCCAAUGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-331.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -359.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 287.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((((((....(((((.((....)))))))....(((((....((((.((((((((..(((....))).))))))...)).))))....)))))......))))))))....((((.(((...))).)))).((((((....))))))((((((((((((((...(((.........)))....)))..)))))))))))...(((.....)))(((((..((((((..(..((((((.(((((((((.(((((.(((..(((.....(((((.....)))))............(((((((..((((((((...(((((((((.(((((........))))).(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....))))............(((......)))...))))))))))))).....................((..(((((((((((((.((((((((.((......((((............(((....(((......(((((((.....)))))))......)))..))).....((((((.((((.((..((((....)))).)).))).).))))))..))))..(((.((((((....)))))).)))........)).))))))))..)))))...((((((....))))))..((((((.......))))))...(((((((............(.(((((((((.(((((......))))).).))).))))).).((((((((((((((((..((((.(((((((...(((((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....((((((...(((((......)))))......((((....)))).....))))))))))))).)).......))))))).)).....))..))))).)))))))........))))....(((((((........))))))).)))))))(((((.........(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))))))).))))))))..))))))..)))))))....((((((.(((.((((..(((((((...((..((((...(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))....))))..))...)))))))....(((.(((......))).))))))).))).)))))).(((((...))))))))..)))..))))).))))....(((.......)))))))))))))).)..)))).)))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{(((..,,,.}},|{{((,((....}|}))))....(((((.,..((((.((((((((..{{(....}}}.))))))...)).))))....))))),{{,.,|||}}},.....((((.(((...))).)))),{{{{{,.,},))|||.((((((((((((((.{,(((.........))}.}}.)))..))))))))))).,,|((.....))}(((({..{{((((..{,.((((((.(((((((({.(((((.(((..(((.....(((((.....)))))..,,........(((((((..((((((((...{((((((((.(((((({........,||,(((({.(((((..(((...((((....)))).)))..))))),.)))),((((..(((((((...)))))))....))))........})))))}......},,.,.)})}}})))))),.....................((..(((((((((((((.((((((((.((......{{,,.,.{{.,.....(((.,..(((......(((((((.....)))))))......)))..)))}....((((((.((((.{{..((((....)))).}}.))).).))))))..}}}}..(({.{(((((....)))))).)))........)).))))))))..))))),..((((((....)))))){{((,,,,..}}}}.,,,,}|,..(((((((,.......,...(.(((((((((.(((((......))))).},))).))))).}.{{{(((((((((((((..((((.(((((((...(((((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....{(((({...(((((......)))))......((((....)))).....}}})))))))))).)).......))))))),)),....,)..)))))}))))))),.......,}}}....(((((((........))))))).))))))){{{{{,,.......((((({(..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))})))),))))))))..))})))..)))))))....((((((.(((.{{{{..(((((({.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},,(((.|,...}.}}}))))))){{,,((,.,,||},...},,.})),))).))).)))))}.(((((...))))))))..)))..))))).})))....(((.......)))))))})))))}.}..)))),}})))))..