Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0026100
Sequence Length
2109 nt
GC Content
0.3983
AUCUUGACAGAACAAGUAUGUACUCAGGUCGUACACAAACCACAUCCAGAGCCAGAUUCUACAGUGAAAAUUCAGAAUCCAAUGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGGUUCUAAGACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-536.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -576.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 533.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.............(((((...((((((...(((((...((((((((((.(((..(((.((.......((((((....)))))).....(((((.....(((......))).....)))))......(((((......)))))(((.((((((((((((((...(((.........)))....)))..))))))))))).)))........)).)))..))).)))).((((...(((((((.((((((((...(((((((..((((((..((((.((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).)))))))).(((((((............(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....))))........)))))))........((((((.(((((.((...(((((..................))))).....)).))))).)))))).....((((((.((((.(((.......((((....))))(((((((.....))))))).((.(((((.((((.....((((((.((((.((..((((....)))).)).))).).))))))((((((.......((((((...((((((......(((((...((((((((...((((((((((((((....))))))((((......)))).....((((((((.........(((((((.((.((.(((.((((...((......(((((....(((((.....)))))....))))))).)))).))).))..)).)))))))....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))(((((((..(((.(((((......)))))......((((....))))(((((((((((((.(((((.....((((...((((((((..((.(((((((((((((.((((..........))))(((((((........))))))).(((((((.(((.(((......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))(((((.(((.....(((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...)))...............(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))..)))))..)))).)))....))))))))...............)))))))))))))......((((((........)))))).....((((((((((((((.(((.....((((..((((((((((((.......((((...))))..((((((((((...........)))))))....))).))))).))).)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))...((....))..))).)).)))))))....)))))...))))).))))))))))..)))).))))...)))).....))))))))))....))))))))....((((((((...))))))))..............))).)))))))..((((((.((.....))))))))....(((((((.......)))))))))))))))..))))))))...)))).)))).....)))))....))))))....))))))..))))))...((((((...............)))))).))))..))))).)).....))).)))))))))).....))))..))))))...).))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))).))))))(..((((....((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.........,,..(((((...((((((...(((((...(((((((((({,((({(((.(({,.....((((((....)))))).{{,{({{{{.,.,}|||,........{{{{.|||,..}}}.}|||{({,,,..||}}}|||.((((((((((((((.{{(((.........))).}}.)))..))))))))))).}}}||,....})),},)}}),)}))),|||,|}}}(((((((.((((((((...((((((((,{{{,{(..({{{.{(((((((.{.(((.,,,{||.......}||||,|)),.}))))))}.((((({{........,||,(((({.(((((.,(((...((((....)))),)))..))))),,)))},((((..(((((((...)))))))....))))........}}}}}}}.....,}.|{{{|{.{{{||,||,..{{{{{.......,,,,,...,,,}}||}.....)).))))).}))))),.,,.{{{{{,,((((.{({...,,,,((((....))))(((((((.....))))))).{,.(((((.{(((,,...((((((.((((.{{..((((....)))).}}.))).).)))))){{{({{.......((((((..,((((((.((.,.{{(((.,.((((((((...((((((((((((((....))))))((((......)))).....((((((((...,..,.,({{{,,,,,({(({(((,,((({{.,,...}}}||,||,}}.|||||.,.,,|||||{,,.|||||||,|}}},|||{|}..,}})))}}|}....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).)))))))){{{{(((,,(((.(((((......)))))......((((....)))){(((((((((((,{(((((.....((((...((((((((..((.(((((((((((((.,{{,..........,,,.(((((((........))))))).(((((((.(({,(({......(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))).|{({{(((..,......}||))}},||.......{(((((.....}}}}},{((((({.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{{{,|,...),)}))))))))||}|||....}}},,.......)))))))))))))......((((((.,......)))))).|{{.(((((((((((({{.,{(,,.,{({,.,{((((((((((((.,...,.((({...)))),.|({(((((((...........)))))))...,}},.))))).))).)))))))}.(((..((({..((((.(((({..((((.((,{.,,(((,((.{.....,)).))}...,)).)))).})))).))))....)))).)))...{{....))}})))})).)))))))....))))),,,))))).))))))))))..)))).))))...)))).....))))))))))....)))))))}.,,{{,{(,,,....,}},}}}}.....,,,,....,))).}}))))),.{{{({{.{{.....}}}))}))}}},(((((((.....,.)))))))))))))))..))))))))...))))}})))...,.))))).}}.))))))....))))))..}}}})|,{.(((((({.{{......}}.,,}))))).)}))..})))).)))}}..))).))}})))))),,..,|}}},.}}}))))).},))))))))))))))))))))),,,))))))))))))..))))))))))).}))))){..{(((....((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....{(((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))..)))})
Back