Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0026900
Sequence Length
2027 nt
GC Content
0.3971
UGAUUCUUAAAGUGGUGGCAACUUUGUUAAAAAACUCUACACCAAGUGCAGAGCUGAUGGAAGUUCGUCGUUUAUUUUUAUCUGAUAUGAUAAAACUUUUCAGUAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGUAAGUAAAACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-516.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -556.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 379.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((...(((((.....(((......))).....)))))......(((((......)))))(((.((((((((((((((...(((.........)))....)))..))))))))))).))).....(((((((.....(((((((((.....(((((((.(((((((((.......((((..........))))((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).)))))))).(((((........))))).(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....)))))))))).......))))))))))((((((.(((((.((...(((((..................))))).....)).))))).))))))............((((((((((.((((((((.....((((((((((.....))))))).....((....)).......((((((((((...((((((((((...((((...(((.....))).)))).......(((((........(((((((.............)))))))((((((......((((.((.((.((((((((((((.........((..(((((((............(.(((((((((.(((((......))))).).))).))))).).((((((((((((((((..((((.(((((((...(((((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....((((((...(((((......)))))......((((....)))).....))))))))))))).)).......))))))).)).....))..))))).)))))))........))))....(((((((........))))))).))))))).))...........(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))...((((((..(......)..)))).)).(((...((((((.....))))))...)))...............(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))..(((((((....(..(((((.(((.(((.(((......))).))).))).)))))..)..)))))))))))))))))))))))(((........))).(((.......)))......))))......)))))))))))..)))).))))))))))))..))))..........((((((((..((.....))..)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))...((....))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))((..((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........))))))))..)))))..))))))))))))))).)))))))))))).....))))))).......((.((((.....(((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).)))))))...)))).)))))))))).((((....((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({{((((...{({((,,...{{{,.....,,,,,,,.|||},.,}}.,|||{(......})})){((.((((((((((((((.{,(((.,.......))}.},.)))..))))))))))).)}}|,{,,{((((((.....(((((((((.....(((((((((((((((((,......((((..........))))((((((((.{.(((.{{.({{.......))}}}.)))}.)))))))).(((((........))))).{((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..))))}{(((..(((((((...)))))))....))))))))},..,{{.{({......))}...}},..,})}}})))))))).....,,((((((.(((({,{(,.....})})))))..)))))).,,........((((((((((((((((((({{......(((((((.....))))))).....,|}...,,.......((((((((({..,((((((((((...(({{.,.{{(,,...}}}.,))).......(((((........{((((((....,,.....,,))))))|(((((({.{{{{((,,.,|}||}|(((({{{{{{|,,,......((..(((((((,.......,...{.(((((((({.(((((......))))).},))).))))).}.{{{(((((((((((((..((((.(((((((...(((((((({....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....{(((({...(((((......)))))......((((....)))).....}}})))))))))).)).......))))))),)),....,)..)))))}))))))),.......,,}}....(((((((........))))))).))))))).}}...........(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))),||||{(((..{......},,}}}|,{{,{{,...((((((.,,,.||||},{{{{{(,.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{((,{,,..,.}}})||||}}{{|,({,.,{{,,,...},,.})),))).))),)}}},,}|||||.}}))))))))))))}}{{{........}}}.(((.......)))......})}}.....,}))),,)))))..)))).))))))))))))}.})))..........((((((((..{(.....})..)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.,.,.(((.((........)).)))...})).)))).))))).))))....)))).)))...((....))((((((((.{.,{,..,,.{{.((((((((...)))))))).}})),.))))))))).....(((((((((.....))))))))){{..((((((((...........|{((.......},},.,,,{{.,,,,.....,}}))}.}}........)))))))),,))),},.))))))))))))))).)))))))))))).....)))))))}},....((.((((.....(((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).)))))))...)))).)))))))))).((((....((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....{(((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))..)))).
Back