Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0027600
Sequence Length
1603 nt
GC Content
0.3955
UAACAGCCGUGAAAAUAGAAGAUGCUUAUUGCAGUGUUCAGUGUGGCAGGAUUGGAUGUUUUCUCUUGGCUAUAUCAAUCCUAAAAAUUCUGAGGAACAGAAGAUUACCGAAAUGGUCUACAAUAUCUUCCGGAUUCUUUUGUAUCAUGCAAUAAAAUAUGAAUGGGGAGGCUGGAGAGUCUGGGUGGAUACCCUCUCAAUAGCCCAUUCCAAGGUCACUUAUGAAGCUCAUAAGGAAUACCUAGCCAAAAUGUAUGAGGAAUAUCAAAGACAAGAGGAGGAAAACAUUAAAAAGGGAAAGAAAGGGAAUGUGAGCACCAUCUCUGGUCUUUCAUCACAGACAACAGGAGCAAAAGGUGGAAUGGAAAUUCGAGAGAUAGAAGAUCUUUCACAAAGCCAGAGCCCAGAAAGUGAGACCGAUUACCCUGUCAGCACAGAUACUCGAGACUUACUCAUGUCAACAAAAGUGUCAGAUGAUAUUCUUGGAAAUUCAGAUAGACCAGGAAGUGGUGUACAUGUGGAAGUACAUGAUCUUUUAGUAGAUAUAAAAGCAGAGAAAGUGGAAGCAACAGAAGUAAAGCUCGAUGAUAUGGAUUUAUCACCGGAGACUUUAGUAGGUGGAGAGAAUGGUGCCCUUGUGGAGGUUGAAUCUCUGUUGGAUAAUGUAUAUAGUGCUGCUGUUGAGAAACUCCAGAACAAUGUACAUGGAAGUGUUGGUAUCAUUAAAAAAAAUGAAGAAAAGGAUAAUGGUCCAUUGAUAACAUUAGCAGAUGAGAAAGAAGACCUUCCCAAUAGUAGUACAUCAUUUCUCUUUGAUAAAAUACCCAAACAGGAGGAAAAACUACUUCCUGAACUUUCUAGCAAUCACAUUAUUCCAAAUAUUCAGGACACACAAGUACAUCUUGGUGUUAGUGAUGAUCUUGGAUUGCUUGCUCACAUGACCGGUAGCGUAGACUUAACUUGUACAUCCAGUAUAAUAGAAGAAAAAGAAUUCAAAAUCCAUACAACUUCAGAUGGAAUGAGCAGUAUUUCUGAAAGAGACUUAGCGUCAUCAACUAAGGGGCUGGAGUAUGCUGAAAUGACUGCUACAACUCUGGAAACUGAGUCUUCUAGUAGCAAAAUUGUACCAAAUAUUGAUGCAGGAAGUAUAAUUUCAGAUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-391.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -425.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 322.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((......(((.((((.....))).).))).(((((((((.....(((((((.(((((((((.......((((..........))))((((((((.(.(((.((.(((.......))))).)))).)))))))).(((((........))))).(((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..)))))((((..(((((((...)))))))....)))))))))).......))))))))))((((((.(((((.((...(((((..................))))).....)).))))).))))))............((((((((((.((((((((.....((((((((((.....))))))).....((....)).......((((((((((...((((((((((...((((...(((.....))).)))).......(((((........(((((((.............)))))))((((((......((((.((.((.((((((((((((.........((..(((((((............(.(((((((((.(((((......))))).).))).))))).).((((((((((((((((..((((.(((((((...(((((((((....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....((((((...(((((......)))))......((((....)))).....))))))))))))).)).......))))))).)).....))..))))).)))))))........))))....(((((((........))))))).))))))).))...........(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).)))))...((((((..(......)..)))).)).(((...((((((.....))))))...)))...............(((((.(.......)))))).(((((((((((((.(......(((((((.((.........)).))).))))...).))))).)))))).))..(((((((....(..(((((.(((.(((.(((......))).))).))).)))))..)..)))))))))))))))))))))))(((........))).(((.......)))......))))......)))))))))))..)))).))))))))))))..))))..........((((((((..((.....))..)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))...((....))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))((..((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........))))))))..)))))..))))))))))))))).))))))))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,,..(((,.....(((.{(((.....))).}.))).{((((((((.....(((((((((((((((((,......((((..........))))((((((((.{.(((.{{.({{.......))}}}.)))}.)))))))).(((((........))))).{((((.(((((..(((...((((....)))).)))..)))))..))))}{(((..(((((((...)))))))....))))))))},..,{{.{({......))}...}},..,})}}})))))))).....,,((((((.(((({,{(,.....})})))))..)))))).,,........((((((((((((((((((({{......(((((((.....))))))).....,|}...,,.......((((((((({..,((((((((((...(({{.,.{{(,,...}}}.,))).......(((((........{((((((....,,.....,,))))))|(((((({.{{{{((,,.,|}||}|(((({{{{{{|,,,......((..(((((((,.......,...{.(((((((({.(((((......))))).},))).))))).}.{{{(((((((((((((..((((.(((((((...(((((((({....((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))))))))....{(((({...(((((......)))))......((((....)))).....}}})))))))))).)).......))))))),)),....,)..)))))}))))))),.......,,}}....(((((((........))))))).))))))).}}...........(((((((..(((.(((((.((((.....)))))))))..)))..)).))))),||||{(((..{......},,}}}|,{{,{{,...((((((.,,,.||||},{{{{{(,.......,,|....(((((.{.......}))))).{{(((((((((((.,......(((((((.((.........)).)))}})))...}.))))),}))))).},.{((,{,,..,.}}})||||}}{{|,({,.,{{,,,...},,.})),))).))),)}}},,}|||||.}}))))))))))))}}{{{........}}}.(((.......)))......})}}.....,}))),,)))))..)))).))))))))))))}.})))..........((((((((..{(.....})..)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.,.,.(((.((........)).)))...})).)))).))))).))))....)))).)))...((....))((((((((.{.,{,..,,.{{.((((((((...)))))))).}})),.))))))))).....(((((((((.....))))))))){{..((((((((...........|{((.......},},.,,,{{.,,,,.....,}}))}.}}........)))))))),,))),},.))))))))))))))).)))))))))))))))...,,
Back