Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0028900

Sequence Length

1208 nt

GC Content

0.4205

AUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGGUUCUAAGACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUGGAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAGUUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-307.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -332.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 373.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((((..(((((((..((((((.(((((.(((((.((....((((..((((((((((((.......((((...))))..((((((((((...........)))))))....))).))))).))).)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))...((....))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))........((((((((...)))))))).................)).)))))...(((((((((.(((.......(((((((((..((((((....((((((...((((((((((((.....((((((((.....)))))))).....((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).))))))(((((((...(((....))).)))))))((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))...((((......((((((....))))))......))))((((....)))).(((((.((((..(..((.((.(.((((....)))).).)).))..)..))))))))))))))))....)))))........((((((((((((((..(((................(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))..)))).)))..)))))))...(((.....)))..........))))))....)))))).)).)))))))....))).))).)))))).......(((........)))......))))).)))))).)))......(((((((..(((((.............)))))......))))).))............................(((((.....))))).)))).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((((..(((((({..((((((.(((((.(((,..,,..||{,,.{{((((((((((((.....,.((({...}))),.{({(((((((...........)))))))...,}},.))))).))).))))))}|.(((..{(((..((((,(((((..((((.((,,.,.(((.((.,.....,)).)))...,)).)))).}}))),})))....)))).})}...((....))((((((((.{.{{...,,.{{.((((((((...)))))))).}})),.})))))))).....(((((((((.....)))))))))....((((((((.........,.|{({.......},,,...,,,.,,,,,.....||)}|.||........}))))))},{|((((((,{{(,.{{((((((((((((((({{({{,{({,.{{{{((((,,...||,}))))....,((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).))))))|((((({...(({,,..||||||}||}}||,|||||}}.},,||||||,,..||||},,...),))}}})),)))|||{|.....}}))))|,{||.{(((((..{{{{.((({...))))...}).}}.))))))||||||||..{((((....,.,(((({....}))))}|...,|||,.{(({....)))|{((,((.{({,.,||,|,,||,{,(({{..,.))}}.)}))},)}})}}))|,.,,{||{|{{((((({|,({......||.{{{(((({,{({((,||{{,||,,,,,.,,.,...(((((((((((((.(........}.))).)))))))))).}}).,)))).)}}..}))))))|,.|{,....,)))},.,}},}}.})}}}}},.....,,},{{{{(||.....,))))}))},}.)))},,}}}},(((........))).}}}))))))).)))))).))}....,}||(((((.,(((((.............)))))......))))).},.,..,,,.,...................(((((.....))))).,,,,.)))))