Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0029100
Sequence Length
1989 nt
GC Content
0.4274
AUACUGAAAGGUCUGACGAUGGCAAAGAAUCAGGAAAAGAAAUCCGAAAAAUCCAAACAACUACUACGACACAAGCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGGUUCUAAGACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUGGAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAGUUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAGGAGUGUUGUGGUGCCUGUAAAGAAACCACCUCCAGGUAGUUUAGCUGUAACCACUGUGGGAGCCACUACUGCUGGAAGUGGGCUGCCAACAGGCAGUACCUCUAAUAUAUUUGCUGCUACUGGAGCUACACCAAAAAGUAUGAUUAAUACAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAGCAUCACUGCAAAACUUGAAAGAGCGUUAGAAAAAGUUGCUCCUCUUCUUCGUGAAAUUUUUGUAGACUUUGCCCCAUUCCUAUCUCGUACACUUCUUGGCAGUCAUGGACAAGAGCUAUUGAUAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-530.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -568.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 454.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((.(((..((.....(((((((...((((((........((((..((((((((((((.......((((...))))..((((((((((...........)))))))....))).))))).))).)))))))).(((..((((..((((.(((((..((((.((.....(((.((........)).)))....)).)))).))))).))))....)))).)))...((....))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))....((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........))))))))(((((.((((((((((((...((((((.(((............((((((((.....))))))))........(((((((((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))((((((...((.((((....((((....(((((.....((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))))))))))).....)))))...))))....)))).))...))))))...(((....)))((((.((.((((..(..((.((.(.((((....)))).).)).))..)..)))).)).))))((((((((((((.....(((..........)))...)))))))))))).)))))))(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))))))))..........((((((((....((((....(((....((((((..........((((.(((......)))))))......((((((...(((........)))...))))))..))))))..)))....))))(((((..(((((.............)))))......)))))))..)))))).....................(((((.....))))).........))))))).......))))))))))....((((.(((..((((((((((((.(..(((((.........((((.(((...............(((((((((..(((((.((((..((((...(((((((.....)))))))))))..))))...................((((......(((((((.((((..........((........))..........)))).)))))))..))))..........((((....))))((((((((.....(((((((((((((..(((...............)))..)).((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((.(((((((.......((((.((((((((((...(((.(.((....)).).))).)))))..))))).)))).......))))))).))).....)))).)))))))..))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))).))).....))).))))((((((.(((((((((..(((((((................((((((......(((..((......)))))......))))))........))))))).))))))))).).))))).)))))....).))))))))))))))).)))).))))))....))))))).))..))).))..)))..(((((((((.(((...)))....)))).....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({{.({.{((,,({.....(((((((..,{,(((.......|||,,.,{(((({(((((((.....,.((({...}))),.{({(((((((...........)))))))...,}},.))))).))).))))))},.(((..((((..((((.(((((..((((.((,,.,.(((.((.,.....,)).)))...})).)))).})))).))))....)))).)))...((....))((((((((.{.,{...,,.{{.((((((((...)))))))).}})),.)))))))))..,..(((((((((,...,))))))))}....((((((((...........,(((.......),},.,,,{{.,,,,.....,,,))}.}}........)))))))),{{((.((((((((((((,,,(((((({((({{{((({,{{..{{{{((((,,...}},})))),....((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).)))))}(((((({...(((....}}}|}}))})}((((((((,.....((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....{(((((..((((.((({...))))...)).}}.))))))))))))))...{{{{....,.{(((({....)))))},....}}}},{(((....)))|,(({((.((((..(..((.((.(.((((....)))).).)).))..)..)))),))})))}||||((((|{({{,,{{{((.{{{......}},}}})))}}))))},},})}}...(((((((((((((.(........).))).)))))))))).))))))))).,,....,..(((((((,....((((.,..{((....((((((..........((({{(((......)))))))......{(((((...(((........)))...))))))..))))))..)))..,.))))(((((.,(((((.............)))))......)))))}}.,)))))).....................(((((.....)))))......,}}})))))},.,,..,}))))))))},|||{(((.(({..((((((((((((.(..(((((..,,.....|||{.,{,....,......,...{((((((((..(((((.({{{..((((...(((((((.....)))))))))))..}|||,{{....|{{..,.,....{{{{......(((((((.((((..........{{........))..........)))).)))))))..}}}}....,.....||||,,,,))}}((((((((.,...(((((((,{{(((..(((...............)))..}}|((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((,({{(({{..,,..,||||.(((({{((((..,({{{{..(,...,}}).,)).,))))))))))).)))),,|,,,.}}})))),)}).......,,.)))))))}.))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))),))).,,..}}},},.,((((((.((((((((,..(((((((...,.........,,.((((((......(((..((......)))))......)))))).,......))))))).})))))))).)})}))).)))))....).))))))))))))))).)))).,,))))))},))))))).}}..)}),}|..}||..{(((({{.{,{{{,||,.},,,,)}))},)})))}))
Back