Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0029300
Sequence Length
693 nt
GC Content
0.4257
GCUGUGCAGGGUCGGUCUAUCACCCAACAAGACCGAGAUCUCCGAGUUGAUUUAGGAUUUCGAGGAAUGCCAAUGACUGAGGAACAGCGACGCCAGUUUAGCCCAGGUCCACGGACUACAAUGUUUCGUAUUCCUGAGUUUAAAUGGUCUCCAAUGCACCAGCGGCUUCUCACUGAUUUACUAUUUGCAUUAGAAACUGAUGUACAUGUUUGGAGGAGCCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGGUUCUAAGACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-186.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..(((((((...........)))))))((..(((...........)))..))(((((((.....(..((((((.((.((((.((((....(((.((((...((((((......).)))))...)))).)))....)))).))....((....))((((((((.(.(((.....((.((((((((...)))))))).))))).))))))))).....(((((((((.....)))))))))....((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........)))))))).(((((((.......)))))))((((.((.((.((((.((.((((((((.((....((.((((.....(((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).)))))))...)))).)))).)))))))).)).)))).)).))))))..((((((....((((......))))...))))))(((((.......)))))......)).))...))))))..)))))))).........)))).)))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((..(((((((...........))))))}(({{{{{.......,}..})},|}}{(((({{..,..,..((((((,((.((((.((((.,,,(({,({((...{(((({......)},))))..,||||,|||,|,.}}}|.||{,..((....))((((((((.{.{{...,,.{{.((((((((...)))))))).}})),.})))))))).....(((((((((.....)))))))))....((((((((...........,(((.......),},.,,,{{.,,,,.....,,,))}.},........)))))))),({((((({..,,,.|||||{|(((({(({((,{{{{.{(,,,{{{{{(((,,...||.||||}....{((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).))))))|{{{|||,.,|{{||,,||||||}||}}}}.}}.}}}),),,||||||,,..||||}}}...),))}}})),)))|||{|.....}}))))),}}}}.)).}).,,))))))},}))))))).........)))).,,,))}}}{....,}
Back