Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0030200
Sequence Length
752 nt
GC Content
0.4109
CCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGGUUCUAAGACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUGGAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-196.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...(((((((((.....)))))))))((..((((((((...........((((.......)))).(((((.............))).))........))))))))..))((((((..((((..(((.((((.((((..((((((((((....((((((.......))))))....)))..)))).........))))))).)))))))..))))..))))))(((((.....)))))))))(...(((((((((((((.(((.(((.((((...)))).))).)))))))............((((((((((((((...((.((((....((((....(((((.....((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))))))))))).....)))))...))))....)))).))...)))))...((((....)))).))))).))))((((((..((((((..((((....((.....(((((((((((..........))))))))))).....)).((((((((((((((..(((................(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))..)))).)))..)))))))...........))))..))))))..).)))))............))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...(((((((((.....)))))))))((..((((((((...........,(((.......),},.,,{{{.,,,,.....,,,))}.},........))))))))..))((((((..((((..{(({((((.((((..{({((((({{,,,,(((({{...,,,,))))}}....}}}..))}}.....,,.,))})))).))))})),,))))..))))))(((((.....)))))))))(...(((((((((({{(.(({.(((.((({...}))).))).}))}}}|,,,,,.......((((((((((({({...((,((((,...(((,....||{||,|||,((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....{(((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))..,}}))))}...}|||,...}}))})),..}}})}...((((....))))}))))).)))),{({{(,.(({(((,.({{{.,,.|,|{||,{|{(((,((({{{{,,|,.{|||||||||||,....,||.|,,|||||||||{{|,|||,|||||,},,}.,,,,(((((((((((((.(........).))).)))))))))).,,}.})))),)}},.}},})}}}},},......))))..))))}).,},)}}}}............))))))))))
Back