Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0030400
Sequence Length
1287 nt
GC Content
0.4165
CCAUUCUACAAAGUCUGUAAUGGAUUUUGUCAAUAGCAAUGAAAAUAUUAUUUUUGUACAUAACACAAUUCACCUCAUUUCCCAAAUGGUAGACAACAUCAUCAUUGCUUGUGGAGGAAUUUUACCUUUGCUCUCUGCUGCUACAUCACCAACUGGUUCUAAGACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUGGAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAGUUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-324.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -347.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 226.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((.....))))))))...(((((((.((.((((((..........((((.......)))).(((((.............))).))..........(((((.((.((((((((..........((((((.((((((......(((((((((((((.......))))))...((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).))))))((((((..(((((....)))...))..)))))).........((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).))))))..(((((((.(.((((((....(((((....)))))((((.(((((.((((....)))).(((((.((((..(..((.((.(.((((....)))).).)).))..)..)))))))))((((((((((...((......)).((((((((((((((..(((................(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))..)))).)))..))))))).........((((....(((....((((((..........((((.(((......)))))))......((((((...(((........)))...))))))..))))))..)))....)))).((((.(((((((((((((((............(((.((((.(.((((((......................(((((.....)))))..(((.(((.....))).)))..(((((.............)))))))))))).)))).)))....(((((......(((((....................)))))))))).)))))))...((((...(((((((.....)))))))))))..((((.((.((.............)))).))))...))))))))))))..))))))))))..(((((.(((........)))...))))))))))...))))....))))))).))))))))))))))...))))))(((((((..(((...............)))..))).))))..))))))...........)))))))))).))))))))))).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,.{(((.....))))))))...(((((((.{(.((((((,.........,(((.......),},...,,,..,,,.....,}}))}.||..........{((((.{{.((((((((.......,..((((((.((((((..{,..{((((((((((((.......))))))........({(..((((((((.{(((,.,..,|||}.(((((..((((((.,((,,..(((((.((.((((({{(,,,(({((,,,.}||}}(((.((({...}))).))).|||{|||{{,,,.......,||||{|,{{({{|,||{(((((((.,.(((....}}}.}))))))}|||||{|......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).)))))),)}}))))}}}||||,|,.,.,(((({....)))))}|...,}}},.((((....)))).(((((.((((..(..((.((.(.((((....)))).}.)).))..)..)))))))))((((((((((...((......)).((((((((((((((..(((..,.......,.....(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))..)))).))}.,))))))).........((((.,..(((....((((((..........((({{(((......))))))}......{(((((...(((........)))...))))))..))))))..)))..,.)))).((((.(((((((((((((((............(((.((((.(.((((({......................(((((.....)))))..,,..{||.....}},.,,}|,(((((.............)))))))))))).)))).)))....(((((......(((((.,.,{{.......,,}.,..)))))))))).)))))))...((((...(((((((.....)))))))))))..((((.((.((..{,.....,,..)))).))))...))))))))))))..))))))))))..}}}},,}}},}}))).)).))))).,)),.)))))})))))....)))))))),}})))))))))),..))))))(((((((..(((...............)))..))},))))..))))))...........)))))))),,.))))))))))).}})))))))
Back