Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0031700

Sequence Length

1406 nt

GC Content

0.4331

ACGGAAUUGGAAAAUAUUGAAGUGACACAAGGCAUGUCAGCUGAGACAGCAGUAACUUUCCUCAGCCGGCUGAUGGCUAUGGUUGAUGUACUUGUGUUUGCAAGCUCUCUAAAUUUUAGUGAGAUUGAAGCUGAGAAAAACAUGUCUUCUGGAGGUUUAAUGCGACAGUGCCUAAGAUUAGUUUGUUGUGUUGCUGUGAGAAACUGUUUAGAAUGUCGGCAAAGACAGAGAGACAGGGGAAAUAAAUCUUCCCAUGGAAGCAGUAAACCUCAGGAAGUUCCUCAAAGUGUGACUGCUACAGCAGCUUCGAAGACUCCAUUGGAAAAUGUUCCAGGUAACCUUUCUCCUAUUAAGGAUCCGGAUAGACUUCUUCAGGAUGUUGAUAUCAAUCGCCUUCGUGCUGUUGUCUUUCGGGAUGUGGAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAGUUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAGGAGUGUUGUGGUGCCUGUAAAGAAACCACCUCCAGGUAGUUUAGCUGUAACCACUGUGGGAGCCACUACUGCUGGAAGUGGGCUGCCAACAGGCAGUACCUCUAAUAUAUUUGCUGCUACUGGAGCUACACCAAAAAGUAUGAUUAAUACAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-382.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -406.97

Frequency: 0.0000

Diversity: 307.20

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((....((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))......))))..))))).(((.(((.((((...)))).))).))).))))))......)))))))).))..).))))))(((((((...(((....))).)))))))((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....((((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))...((((......((((((....))))))......)))).(((....)))((((.((.((((..(..((.((.(.((((....)))).).)).))..)..)))).)).))))((((((((((((.....(((..........)))...))))))))))))(((.(((((((((((((((((.(........).))).))))))))))...))))))).((((..(((((((((((....((((....(((....((((((..........((((.(((......)))))))......((((((...(((........)))...))))))..))))))..)))....))))(((((..(((((.............)))))......)))))))..)))))).....................(((((.....)))))......)))..))))....)))))))))(((((...(((((.((((((((((((((.(((.((((.((.(((.....)))))))................(((((((((..(((((.((((..((((...(((((((.....)))))))))))..))))...................((((......(((((((.((((..........((........))..........)))).)))))))..))))..........((((....))))((((((((.....(((((((((((((..(((...............)))..)).((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((.(((((((.......((((.((((((((((...(((.(.((....)).).))).)))))..))))).)))).......))))))).))).....)))).)))))))..))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))).)))...)).))).)))))).))))))))..)))))((((((...)))....)))...((((((......(((..((......)))))......))))))....)))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((((((....((((((.(..((.((((((((((((((.(((((..((((.....((..(((((.....)))))..))..,,.,))))..))))).(({.(((.((({...}))).))).})).)))))}.....,)))))))).))..).)))))}(((((((.,,(({....}}|,||}}}}}((((((((......((((((....((((......))))...))))))(((((.......))))).....{(((((..((((.((((...))))...)).)).))))))))))))))...,,||,,,...,(((({..,,|}}}|||,...{{{{{((((....)))|{((,((,({{(,,(..((,((.(,(({{....}}}}.,.}}.))..|,.}|||,||.}||}(((((((({{((...,.{{(.,,,.,,...}||,|,}})}})))}}}}.,}.,...(((((((((((((.(........).))).)))))))))).,,},))))),}}}}..},,|||({{({....((((.,..{((....((((((..........((({{(((......))))))}......{(((((...(((........)))...))))))..))))))..))}....)))){(({{.|(({((.............))))).....,)))}}}},})))))).....................{{{||.,,,,)))}),,,.,,})).}),,},...))))))))),{{{,...(((((,((((((((((((((.(((.(({{.((.(((.....)))))}}................{((((((((..(((((.({{{..((((...(((((((.....)))))))))))..}|||,{{....|{{..,.,....{{{{......(((((((.((((..........{{........))..........)))).)))))))..}}}}....,.....||||,,,,))}}((((((((.,...(((((((,{{(((..(((...............)))..}}|((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((,({{(({{..,,..,||||.(((({{((((..,({{{{..(,...,}}).,)).,))))))))))).)))),,|,,,.}}})))),)}).......,,.)))))))}.))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))),)}}...)).))).))))))}})))))))).))))){{((({...)))}...,}}...((((((......(((..((......)))))......))))))....,}}}.,