Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0033900
Sequence Length
704 nt
GC Content
0.4219
GAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAGUUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-154.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -167.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 186.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((......)).((((((((((((((..(((................(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))..)))).)))..)))))))((((((..(((((....(((....((((((..........((((.(((......)))))))......((((((...(((........)))...))))))..))))))..)))....)))).)..).)))))((((((......................(((((((((..(((...................(((((.....)))))......(((.....)))..(((((((((.............)))))))))..((((((.((.((..(((((......(((((....................)))))))))).....((((..((((...(((((((.....)))))))))))..))))..((((.(((.........((((......(((((((.((((..........((........))..........)))).)))))))..)))).........))))))))).)))))))).)))))))).))))...))))))(((...............))).....((((.((((((((.........)).))))))..))))....))).))((.....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({.,((......}}.((((((((((((((..{((..{.......,,....(((((((((((((.(........).))).)))))))))).)))..}))).))}..)))))))((((((..{((((....(((....((((((..........((({{(((......))))))}......{(((((...(((........)))...))))))..))))))..)))..,.)))).}..}.)))}}((((((,..,,,......},..,,,,((((.{.(((({,,.....................(((((.....)))))......{||.,,..},,..||{{(((((.............)))))))))}}|,|||},|}}||},,||||||,..,(((((,{..,,.......,,,.,.{||}},,,,))},,{{({,...||||...(((((((.....)))))))}}}}..||||{{{,,,,||{..,,,....|{((..,...(((((((.((((..........{{........}}..........)))).)))))))..}}}}....,,,..,}})}}}})}}))}})})}}}||},,}}))}}.,,}|||}}(((...............)))..,,.((((.((((({((.........)).))))))..)))).}},))),}}{|....,))
Back