Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0034100
Sequence Length
1114 nt
GC Content
0.4309
GAUGAUAGCAAACAAGCACAGUUCUUAGCUCUGGCUGUUGUUUACUUCAUUUCGGUUCUGAUGGUUUCCAAGUAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAGUUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAGGAGUGUUGUGGUGCCUGUAAAGAAACCACCUCCAGGUAGUUUAGCUGUAACCACUGUGGGAGCCACUACUGCUGGAAGUGGGCUGCCAACAGGCAGUACCUCUAAUAUAUUUGCUGCUACUGGAGCUACACCAAAAAGUAUGAUUAAUACAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAGCAUCACUGCAAAACUUGAAAGAGCGUUAGAAAAAGUUGCUCCUCUUCUUCGUGAAAUUUUUGUAGACUUUGCCCCAUUCCUAUCUCGUACACUUCUUGGCAGUCAUGGACAAGAGCUAUUGAUAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-290.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -309.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 245.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((......))...)))(((..(..(((((.(((((((..((.(((((((((((((((((.(........).))).))))))))))...))))))((((.((((((((((((((....((((....(((....((((((..........((((.(((......)))))))......((((((...(((........)))...))))))..))))))..)))....))))(((((..(((((.............)))))......)))))))..)))))).....................(((((.....))))).(((((....((...((((((..........((((((((((.(((..((((((((((((.(..(((((.........((((.(((...............(((((((((..(((((.((((..((((...(((((((.....)))))))))))..))))...................((((......(((((((.((((..........((........))..........)))).)))))))..))))..........((((....))))((((((((.....(((((((((((((..(((...............)))..)).((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((.(((((((.......((((.((((((((((...(((.(.((....)).).))).)))))..))))).)))).......))))))).))).....)))).)))))))..))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))).))).....))).))))((((((.(((((((((..(((((((................((((((......(((..((......)))))......))))))........))))))).))))))))).).))))).)))))....).))))))))))))))).))))...))))))))))))...)).....))))).......))))))..)))).))))))).)))))..)....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({.,.((......}}.{{|||(((,,(((({{((,{{({{,,..,{.,,,.(((((((((((((.(........).))).)))))))))).,}),}))}|,||.{{|||||||(({({,...((((.,..(((....((((((..........((({{(((......)))))))......{(((((...(((........)))...))))))..))))))..)))..,.)))){({,{.}|||{(,,...........}}}})....,,}||||.|.{||||}}.....................(((((.....)))))..{{,.,,|.{{,.|||,{{|,.,,{{,...,,,,,,,{,,}|||,}||||||{||||{}|,,|||{|,}}({{{{{(((({(({....,,.....,...{((((((((..(((((.({{{..((((...(((((((.....)))))))))))..}|||,{{....|{{..,.,....{{{{......(((((((.((((..........{{........))..........)))).)))))))..}}}}....,.....||||,,,,))}}((((((((.,...(((((((,{{(((..(((...............)))..}}|((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((,({{(({{..,,..,||||.(((({{((((..,({{{{..(,...,}}).,)).,))))))))))).)))),,|,,,.}}})))),)}).......,,.)))))))}.))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))),)}}.....|||.,...((((((.((((((((,..(((((((...,.........,,.((((((......(((..((......)))))......)))))).,......))))))).})))))))).)})}))).}}}}),...|,}}}}}}}}}}}},}}.}))}...)))})))}}))))))))}}}}{||||,.{,,...||||||.,|,,,.)),,)))})),)),.))}}},))
Back