Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0034200
Sequence Length
632 nt
GC Content
0.4225
UAUCGUGACAUAUUAGAACCCCAGAGAGAGACUACAAGAACUGGAAGCCAACCAGGUAGAAACAUCAGGCAAGAAAUAAAUUCACCAACAAGUACAGUUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-127.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -138.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(..((((((.((..((........((((((.(((..((((.......((((....(((....((((((..........((((.(((......)))))))......((((((...(((........)))...))))))..))))))..)))....)))).((((.(((((((((((((((............(((.((((.(.((((((......................(((((.....)))))..(((.(((.....))).)))..(((((.............)))))))))))).)))).)))....(((((......(((((....................)))))))))).)))))))...((((...(((((((.....)))))))))))..((((.((.((.............)))).))))...))))))))))))....))))..))).)...)))))........))..)))))))).).))..))(((.((((...((.((((((....(..(((.((((..(((((((..(((...............)))..))).))))................)))))))..)....)))))).))...))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.({.,....,,|,.}},,..{{(((.((((((....,{,((((({(({...((((....(((....((((((..........((({{(((......))))))}......{(((((...(((........)))...))))))..))))))..)))..,.)))){(({(.{((((({{{{{,..,....,,,,}.....,,||||.{.{{||||}.....................(((((.....)))))..,,..{||.,,..},,.,|||,{{(((..........,..))))))}||,||{}}||,|}|{||,{((({{{,..{(((((,{..,,.......,,,...{||,},,,,))},|||(||...{|||...(((((((.....)))))))}}}}..|{||,{(.||,||{..,......||||.,,,..(((((((.((((..........,,.,......}},.........)))).)))))))..})))...,{{...,}))}}}}))}))}}))))},,......,}}}.||}|||}}|||..,,,.,,,.....,}}).,),.((((.((((({((.........)).))))))..)))))))))).,,,)))))...)
Back