Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0034500
Sequence Length
1348 nt
GC Content
0.4266
UUGUGGUCAUACCAUCUAUCCCUCAUCCAAGUUUGAACCAUGGAUUCCUUGCCAAGUUAAUUCCUGAGCAGAGCUUUGGCCACUCAUUUUACAAAGAAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAGGAGUGUUGUGGUGCCUGUAAAGAAACCACCUCCAGGUAGUUUAGCUGUAACCACUGUGGGAGCCACUACUGCUGGAAGUGGGCUGCCAACAGGCAGUACCUCUAAUAUAUUUGCUGCUACUGGAGCUACACCAAAAAGUAUGAUUAAUACAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAGCAUCACUGCAAAACUUGAAAGAGCGUUAGAAAAAGUUGCUCCUCUUCUUCGUGAAAUUUUUGUAGACUUUGCCCCAUUCCUAUCUCGUACACUUCUUGGCAGUCAUGGACAAGAGCUAUUGAUAGAAGGCCUUGUUUGUAUGAAGUCCAGCACAUCUGUGGUUGAGCUUGUUAUGCUGCUUUGUUCUCAGGAAUGGCAAAACUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGACUUGCAUUUAUUGAGCUCAUCAAUGAAGGAAGAUUACUGUGCCAUGCUAUGAAGGACCAUAUAGUCCGUGUUGCAAAUGAAGCUGAGUUUAUUUUGAACAGACAAAGAGCCGAGGAUGUACAUAAACAUGCAGAGUUUGAGUCACAGUGUGCCCAAUAUGCUGCUGAUAGAAGAGAGGAAGAAAAGAUGUGUGACCAUCUUAUCAGUGCUGCUAAACAUCGAGAUCAUGUAACAGCAAAUCAGCUGAAACAGAAGAUUCUCAAUAUUCUCACAAAUAAACAUGGUGCUUGGGGAGCAGUUUCUCAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-359.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -385.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 314.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((.((((.((((((.(((((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((((.............)))))......))))).))............................(((((.....))))).(((((....((...((((((..........((((((((((.(((..((((((((((((.(..(((((.........((((.(((...............(((((((((..(((((.((((..((((...(((((((.....)))))))))))..))))...................((((......(((((((.((((..........((........))..........)))).)))))))..))))..........((((....))))((((((((.....(((((((((((((..(((...............)))..)).((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((.(((((((.......((((.((((((((((...(((.(.((....)).).))).)))))..))))).)))).......))))))).))).....)))).)))))))..))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))).))).....))).))))((((((.(((((((((..(((((((................((((((......(((..((......)))))......))))))........))))))).))))))))).).))))).)))))....).))))))))))))))).))))...))))))))))))...)).....))))).........))))))))(((((((((((.(((.((....)).)))))))))..)))))..........)))))))))))))))))....(((.(((((((.(((...((((((......(((((....)))))(((..(((.(.((((((((.....))))))))).)))....)))))))))....))).((((......)))).((((..(((((((......)))))))..))))))))))))))...(.((((......)))).).........(((((((((((.....))))))).)))).)).))).))).....)))))))))))))).((((.((.((((((.....((((((((((((..((((......))))....((((...........)))).........))))))).)))))..))))))..)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((({,((((.(((((({((((.(,....,||,|}|}|...{(((((.,....{{{{(((({(({((,,{(({{{{,....,,.,,.||,......(((((.{(((({{{{{,,,......,.........(((((.....)))))..,,...,,.(({,,{{{{{{..........((((((((((.(({..((((((((((((.(..(((((..,,.,,,.|||{.{{,....,......,...{((((((((..(((((.({{{..((((...(((((((.....)))))))))))..}|||,{{....|{{..,.,....{{{{......(((((((.((((..........{{........))..........)))).)))))))..}}}}....,.....||||,,,,))}}((((((((.,...(((((((,{{(((..(((...............)))..}}|((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((,({{(({{..,,..,||||.(((({{((((..,({{{{..(,...,}}).,)).,))))))))))).)))),,|,,,.}}})))),)}).......,,.)))))))}.))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))),)}}.,,..}|},},.,((((((.((((((((,..(((((((...,.........,,.((((((......(((..((......)))))......)))))).,......))))))).})))))))).)}}}))).)}}))....}.))))))))))))})).))))...)))))))}})))}}},,.,,.,||||,.{{{...{{{{|||{,.,,,||{{||||,|{{.|,,,,,)}.)))}})))))},,,))}}}.}}}|}..,,,)))))))|||},,.,,.|||}|||||{,,|||}|}||||||,...{{(({{(,,..}}}|((((..(((.(.((((((((.....))))))))).)))....))))}}}}}.},.}},.((((......)))).((((.{((({{((,,...,)))}})),,))))|||,,}|||||..{.((((......)))).),},})}}..|||{(((((((.....))))))),)))),}}.)})})),.,,..)))))))))))))).((((.((.((((((.....((((((((((((..((((......))))....{(({.,,,.......}))).........))))))).)))))..))))))..)).))))
Back