Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0035600
Sequence Length
721 nt
GC Content
0.4397
AAACACCUGCUGCAUUUCCAGACACCAUAAAAGAAAAAGAAACACCAACUCCUGGUGAAGAUAUUCAGGUAGAAAGUUCAAUUCCCCAUACAGAUUCAGGAAUUGGAGAGGAGCAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAGGAGUGUUGUGGUGCCUGUAAAGAAACCACCUCCAGGUAGUUUAGCUGUAACCACUGUGGGAGCCACUACUGCUGGAAGUGGGCUGCCAACAGGCAGUACCUCUAAUAUAUUUGCUGCUACUGGAGCUACACCAAAAAGUAUGAUUAAUACAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-187.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -200.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((......))).....................(((((.....)))))........))))).)....((((.............(((((.((((((((((((((.(((.((((.((.(((.....)))))))................(((((((((..(((((.((((..((((...(((((((.....)))))))))))..))))...................((((......(((((((.((((..........((........))..........)))).)))))))..))))..........((((....))))((((((((.....(((((((((((((..(((...............)))..)).((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((.(((((((.......((((.((((((((((...(((.(.((....)).).))).)))))..))))).)))).......))))))).))).....)))).)))))))..))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))).)))...)).))).)))))).))))))))..)))))((((((...)))....)))...((((((......(((..((......)))))......))))))......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{((((((......}}}.,,.,................(((((.....))))).......,)}}}}.}....{{{{.,,,.........{{(((,((((((((((((((.(((.(({{.((.(((.....)))))}}................{((((((((..(((((.({{{..((((...(((((((.....)))))))))))..}|||,{{....|{{..,.,....{{{{......(((((((.((((..........{{........))..........)))).)))))))..}}}}....,.....||||,,,,))}}((((((((.,...(((((((,{{(((..(((...............)))..}}|((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((,({{(({{..,,..,||||.(((({{((((..,({{{{..(,...,}}).,)).,))))))))))).)))),,|,,,.}}})))),)}).......,,.)))))))}.))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))),)}}...)).))).)))))))))))))))).)))))||{(({...)))}....,,.,.((((((......(((..((......)))))......))))))......,}}}
Back