Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0036000
Sequence Length
608 nt
GC Content
0.4457
CAAGUGGCUAGCAUCCUGAAUGGGGCAGAAUUAGAAACAAGUACAGGCCCUGAUGCCAUGAGUGAACUCUUAUCCACUUUGUCAUCCGAAGUGAAGAAAUCACAAGAGAGCUUAACUGAAAAUCCUAGUGAAACGUUGAAGCCUGCAACAUCCAUAUCUAGCAUUAGUCAAACCAAAGGCAUCAAUGUGAAGGAAAUACUGAAAAGUCUUGUGGCUGCUCCAGUUGAAAUAGCAGAAUGUGGCCCUGAACCUAUCCCAUACCCAGAUCCAGCAUUGAAGAGAGAAACACAAGCUAUUCUUCCUAUGCAGUUUCAUUCCUUUGACAGGAGUGUUGUGGUGCCUGUAAAGAAACCACCUCCAGGUAGUUUAGCUGUAACCACUGUGGGAGCCACUACUGCUGGAAGUGGGCUGCCAACAGGCAGUACCUCUAAUAUAUUUGCUGCUACUGGAGCUACACCAAAAAGUAUGAUUAAUACAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-165.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 93.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((.(.((((((....)))((((((((((((........(((((((((..(((((.((((..((((...(((((((.....)))))))))))..))))...................((((......(((((((.((((..........((........))..........)))).)))))))..))))..........((((....))))((((((((.....(((((((((((((..(((...............)))..)).((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((.(((((((.......((((.((((((((((...(((.(.((....)).).))).)))))..))))).)))).......))))))).))).....)))).)))))))..))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))).)))................))))))))))))..))).))))))).)(..........((((((......(((..((......)))))......)))))).........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((.(.((((({....))}((((((((((((...{(...(((((((((..(((((.({{{..((((...(((((((.....)))))))))))..}|||,{{....|{{..,.,....{{{{......(((((((.((((..........{{........))..........)))).)))))))..}}}}....,.....||||,,,,))}}((((((((.,...(((((((,{{(((..(((...............)))..}}|((((.((((((((.........)).))))))..)))).....(((((((.....)))))))..(((,({{(({{..,,..,||||.(((({{((((..,({{{{..(,...,}}).,)).,))))))))))).)))),,|,,,.}}})))),)}).......,,.)))))))}.))))))))..((((.....((((.....))))....)))).)))))..)))))).))}................))))))))))))..))).))))))).)(.......{{.((((((......(((..((......)))))......)))))),}.......)
Back