Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0036300
Sequence Length
410 nt
GC Content
0.4463
GAGUGUUGUGGUGCCUGUAAAGAAACCACCUCCAGGUAGUUUAGCUGUAACCACUGUGGGAGCCACUACUGCUGGAAGUGGGCUGCCAACAGGCAGUACCUCUAAUAUAUUUGCUGCUACUGGAGCUACACCAAAAAGUAUGAUUAAUACAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAGCAUCACUGCAAAACUUGAAAGAGCGUUAGAAAAAGUUGCUCCUCUUCUUCGUGAAAUUUUUGUAGACUUUGCCCCAUUCCUAUCUCGUACACUUCUUGGCAGUCAUGGACAAGAGCUAUUGAUAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-101.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -111.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 72.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((((((((.......((((.((((((((((...(((.(.((....)).).))).)))))..))))).))))((((((....))))))...............(((.(....).)))...........((((.....)))).)))))))))..(((...((((......))))..)))..((((((.(((((((((..(((((((................((((((......(((..((......)))))......))))))........))))))).))))))))).).)))))........((((((((.....(((.....)))......))).)))))))..)))))((.(((.......((((((.((....))..))))))........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..,{(((((((((.......((((.((((((((((..,({{,(.,({,..,)}).})).,)))))}))))).))))((((((....))))))...............(((.(....).)))...........((((.....)))).)))))))))|.(((...{(({......,}}|.,}}}.,((((((.((((((((,..(((((((...,.........,,.((((((......(((..((......)))))......)))))).,......))))))).})))))))).)})}))).|...|,.{((((({{.....{{{.....))}......}}}}}))))}}..)))))((.(({,{,,...{(((((.{{....}}..)))))).,..,)}.}})))
Back