Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0036700

Sequence Length

778 nt

GC Content

0.3368

CCCUUCUUAAGCAGUGAUCUUAUCAAAAGGAGCAUUAGAUGCUUCAGUGCCACAAAUUUACGCUCAGAUAGUUCACUCCAAACUAUGUCUUAAAUGAUGAAAACCAAAAAUAUUACAAUGUAGCUAUAAAAAGAUAAGUUUUUCACCCCUAAGUUUGCAUUGUUUUAUCAGCAUCAUUUUAUCGAAAAAUUUUUUCAUUUCUUGAUGUUUUUUAUUUAUACCCCAUUUGUAGUAUGUAGUUUUGUUAGAUUAAUGUAAGUAAAUCAAUUAGAUUUCAAUGCAACAUCUGUUAUAUAAAAUUAUGUUCAUUAGCAUACUUACUAAUGGCCAAAUGAUUAAUUGUCAAAUUCGGUUUUGAAAAUCUGAUGAGUAAUUCUUUCAAAAUCAGAUAGUAAUGGUGUAAUUAAAAUUUUUUUAAAUAAAUUUAUGUUUAAGGCUAAAAAUUAUUAUUUUGGGAACAGGUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAGCAUCACUGCAAAACUUGAAAGAGCGUUAGAAAAAGUUGCUCCUCUUCUUCGUGAAAUUUUUGUAGACUUUGCCCCAUUCCUAUCUCGUACACUUCUUGGCAGUCAUGGACAAGAGCUAUUGAUAGAAGGCCUUGUUUGUAUGAAGUCCAGCACAUCUGUGGUUGAGCUUGUUAUGCUGCUUUGUUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-153.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -171.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 190.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((...)))...(((........((((.(((((.(.(.(((.((..((((((.....((((((..((((((.......))))))(((((((((.(((((........(((..(((((((((((.......((........)).......)).)))))))))..))).(((((((....((.(((((...)))))))....)))))))(((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((((...((((...(((((.....)))))...))))..)))))....))))))))..........)))))).))).)))))...............(((((......)))))..((((((((((.......))))...))))))......))))))).)))))..............))))))))))))))..(((((....)))))((((..(((.(((.((....)).))))))..))))..........(((.(((((((((..(((((((................((((((......(((..((......)))))......))))))........))))))).))))))))).))).))))))..........((((......(((((((.........(((((...(((...(((.((((..(((...((((((.((....))..)))))).))).))))))))))...))))))))))))...))))....))))))))))).).).))))).))))....))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

........{{{({{(({....,,|...,({(((((...}}||}}}{.{((((,,....{(((,,,,,(((({{.......}}}}}}((({{(((({((({{........(((..(((((((((((.......((........)).......))}}})))))))..))).{((((((....{{.(((({...}))))}}....))))))},{(((.((((((((((({.((((((((((((((((((((((...((((...(((((.....)))))...))))..)))))....)))))))),.........)))))),,)).))))).....{{{{.....)}}},,.,.{{{{||||{,,{{{(({,,,......}))))}})))}}}}......))))))}.})}}|....,,,,,,,,..,}},)))))))))}..{{{{{....}}}}}((((..(((.(((.((....)).))))))..)))}.,.....{{{(((.((((((((,..(((((((...,.........,,.((((((......(((..((......)))))......)))))).,......))))))).})))))))).))),))),},.,}|,,{{({{{{.....{{{..,,,}}}......}}}|||}}}||,...,,.}}}}}}}}}}...,,..})))}.}{{{(((((((.(((.{{....)).)))))))))}}}}}}||{{.{||{|{...,))))))),))})...,})))}))),,.......