Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0037000
Sequence Length
2451 nt
GC Content
0.4406
GUGCCGUGGAUUCAGGGUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCUUCUAGUUUUGUGAAUGGUGCUACUAGCAAAAACCUUCCAGCUGUACAAACUGUUGCUCCAAUGCCAGAAGAUUCAGCUGAAAAUAUGAGCAUCACUGCAAAACUUGAAAGAGCGUUAGAAAAAGUUGCUCCUCUUCUUCGUGAAAUUUUUGUAGACUUUGCCCCAUUCCUAUCUCGUACACUUCUUGGCAGUCAUGGACAAGAGCUAUUGAUAGAAGGCCUUGUUUGUAUGAAGUCCAGCACAUCUGUGGUUGAGCUUGUUAUGCUGCUUUGUUCUCAGGAAUGGCAAAACUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGACUUGCAUUUAUUGAGCUCAUCAAUGAAGGAAGAUUACUGUGCCAUGCUAUGAAGGACCAUAUAGUCCGUGUUGCAAAUGAAGCUGAGUUUAUUUUGAACAGACAAAGAGCCGAGGAUGUACAUAAACAUGCAGAGUUUGAGUCACAGUGUGCCCAAUAUGCUGCUGAUAGAAGAGAGGAAGAAAAGAUGUGUGACCAUCUUAUCAGUGCUGCUAAACAUCGAGAUCAUGUAACAGCAAAUCAGCUGAAACAGAAGAUUCUCAAUAUUCUCACAAAUAAACAUGGUGCUUGGGGAGCAGUUUCUCAUAGCCAAUUGCAUGAUUUCUGGCGUUUGGAUUACUGGGAAGAUGAUCUUCGUCGAAGGAGACGAUUUGUUCGCAAUGCAUUUGGCUCCACUCAUGCUGAAGCAUUGCUGAAAGCUGCAAUAGAAUAUGGCACGGAAGAAGAUGUAGUAAAGUCAAAGAAAACAUUCAGAAGUCAAGCAAUAGUGAACCAAAAUGCAGAGACAGAACUUAUGCUGGAAGGAGACGAUGAUGCAGUCAGUCUGCUACAGGAGAAAGAAAUUGACAACCUUGCAGGCCCAGUGGUUCUCAGCACCCCUGCCCAGCUCAUCGCUCCCGUGGUGGUGGCCAAGGGGACUCUCUCCAUCACCACGACAGAAAUCUACUUCGAGGUAGAUGAGGAUGAUUCUGCCUUCAAGAAGAUCGACACGAAAGUUCUUGCAUACACUGAGGGACUUCACGGAAAAUGGAUGUUCAGCGAGAUACGAGCUGUAUUUUCAAGACGUUACCUUCUACAAAACACUGCUUUGGAAGUAUUUAUGGCAAACCGAACCUCAGUUAUGUUUAAUUUCCCUGAUCAAGCAACAGUAAAAAAAGUUGUCUAUAGCUUGCCUCGGGUUGGAGUAGGGACCAGCUAUGGUCUGCCACAAGCCAGGAGGAUAUCAUUGGCCACUCCUCGACAGCUUUAUAAAUCUUCCAAUAUGACUCAGCGCUGGCAAAGAAGGGAAAUUUCAAACUUCGAAUAUUUGAUGUUCCUUAAUACUAUUGCAGGACGGACAUAUAAUGAUCUGAACCAAUAUCCAGUGUUUCCGUGGGUGUUAACCAACUAUGAAUCAGAAGAGUUGGACCUGACUCUUCCAGGAAACUUCAGGGAUCUAUCAAAGCCAAUUGGUGCUUUGAACCCCAAGAGAGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAGGAACUAAUUCCAGAGUUCUACUACCUACCAGAGAUGUUUGUCAACAGUAAUGGAUAUAAUCUUGGAGUCAGAGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUGGCCCUAGAAAGUGAAUUUGUUUCUUGCCAACUUCAUCAGUGGAUCGACCUUAUAUUUGGCUAUAAGCAGCGAGGACCAGAAGCAGUUCGUGCUCUGAAUGUUUUUCACUACUUGACUUAUGAAGGCUCUGUGAACCUGGAUAGUAUCACUGAUCCUGUGCUCAGGGAGGCCAUGGAGGCACAGAUACAGAACUUUGGACAGACGCCAUCUCAGUUGCUUAUUGAGCCACAUCCGCCUCGGAGCUCUGCCAUGCACCUGUGUUUCCUUCCACAGAGUCCGCUCAUGUUUAAAGAUCAGAUGCAACAGGAUGUGAUAAUGGUGCUGAAGUUUCCUUCAAAUUCUCCAGUAACCCAUGUGGCAGCCAACACUCUGCCCCACUUGACCAUCCCCGCAGUGGUGACAGUGACUUGCAGCCGACUCUUUGCAGUGAAUAGAUGGCACAACACAGUAGGCCUCAGAGGAGCUCCAGGAUACUCCUUGGAUCAAGCCCACCAUCUUCCCAUUGAAAUGGAUCCAUUAAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-685.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -733.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 578.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((((....)))..((((((((.(((((((((((((((..(((((((................((((((......(((..((......)))))......))))))........))))))).))))))))).....(((((...........)))))...(((.....))).......((((((((((..............(((((.((((((((......(((((((.(((.((....)).))))))))))(((((((((.((((((....)).)))).)))..))))))..(((((((.(((...((((((......(((((....)))))(((..(((.(.((((((((.....))))))))).)))....)))))))))....))).((((......)))).((((..(((((((......)))))))..))))))))))).)))))))))))))........)))))))))).(((((((((((.....))))))).)))))))))))))))))).((((((......))))))..........((((((.((((((((((((((((((......))))....((((...........))))............((((...((((((.....))))))..)))).)))))))))))).)).)))))).(((.((((((((((..(((.(((.((((((..((.....))(((((((.((((((.........)))))))))))))(((..((((((.......................))))))....))).(((...(.((((.((((((((...(((((((........(((((.(((((((....((((..((((.((((((.((.((((((((.(....).)))......)))))......(((((....(((........))).)))))...))))))))))))(((((((((((...((((....)))))))))))))))......((((.(((.((((((((..........)))))))).))).))))((.(((.(((((.((((((((.((((((((((.((...(((((((.(.((((..........))))).)))))))..)).)))..((((((((......))...)))))).......((....))...))))))))))))...((((((((((.(((((...(((((......))).))...)))))..)))))..)))))..((((((....))))))(((.((((...(((((((((((((.(((((((((((((.(((((....(((((((..((((.(((((((((.(((.((((.(.(..((((..((.((((....)))).))((((((((...)))).))))(((((((...))).)))).......((((...((((((.((((.((((.((((((.(........).))))))...))))...)))))))))).....))))...(((((((........))))))).......))))..).).)))).)))..)))))..)))).)))))))))))....)))))........(((..((.(((.((((((((.....(((((((((........((((...((((.....))))..........((((..(((...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))....)))).....(((((((......)))))))(((..((((((........))))))..)))...))))))))).))))....)))))))).))).))..))).))).)))........).)))))).))))))....)))))))..)))))))...........)))))))))))))((((.(((((.((((...(((((.........))))).)))).))).....)).))))..((((.......(((......))))))).))))....))))).))))))).......))))))))))))))).)))))..)))((((..((....))..))))..((((((.((((...((((((.((((((...((((((((.....(((.((((.((...((((((.....)))))).....((((...))))))))))))).....)))))))).)))))).((((((.(((((.((......((((.((.(....).)).)))).(((((((((.((.............)).)))))..))))..(((((........))))).(((((.(((((.......))))).).)))))).)).))).)))))).(((.((......)).)))..........))))))....))))..)))))).)))))).))).))).....)))))))))).)))..)))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,....((((((((((((....}}|,.((((((({{(((((((((((((({..(((((((..,,.........,,.((((((......(((..((......)))))......)))))).,......))))))).})))))))).,,..(((((...........))))).|,{{{.....}},.......((((((((((....,...,,{...(((((.((((((((...,,,(((((((.(((.((....}).)))))))))}{{|||{{((.((((((....})}}))).})},.,}}})),.(((((((.(((,{.((((({....,,{{{{{....)))}|(({.,(((.(.((((((((.....))))))))).)))....))))))))).},.))}.((((......)))).((((.,((({{((,,...,)))}})),,))))))))))).))))))))))))),,,.....)))))))))).(((((((((((.....))))))).)))))))))))))))))).{(((((......)}}}}}..,{(({...((((((.((((((((((((({((((......))))....{(({.,,,.......}))}............{(((...((((((,...,))))))..)))}.}))))))))))).)).))))))..}))||((((((((..,.(((((......))))}..,,{(((((((((.((((((.........))))))))))))).,},.{(((({{..,,...|,{|,||.,,,..|{|},.,,...,}}..........((((.{(((((((...(((((((..,,,{,.(((((.(,(((((....((((..((((.((((((.((.((((((((.{....,.}}..,,...)))))......(((((....(((.,......))).)))))...))))))))))))(((((((((((...((((....)))))))))))))))......{(((,(({.{{{||||(,.,,,...,,}}})))}}.}}}.}|||({.((({(({({{(({(((((.(((((((.,{.,,..{({{,,{{{(,(({(,{,,,,,,,,,.}})))))))))..}},))}..,{|||,........{|,|.||||}}..,,,,.||,...}}}..))))))))))))...{{{{{(((((.(((((.,.((,,{......})}.)).,.)))))..)))))..)))}},,((((((....)))))|(((.((((...(((((((((((((.((((((,(({,,,.(((((....(((((((..{(((.(((((((((.(((,{{{(((((,.,.(((((.........})))).})))))}....,|,}}},.({.(((((((...))).))))..}},,,|{||,,,{{((((.{{((,{{{,.{|{{{{.{......,,|,||||}}...}))),},))}}))))}},,,.(((.....(((((((,.....,.)))))))..))}..}}}.,((,({{....}))).)))))..)))).)))))))))))....))))).....,,.(((..((.(((.((((((((.....({(((((((........(((({{.((((,....}}}}..|||,..,{({,...,,,...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..)))))))),..,))})}}}.,|||||{{,.....,))}|},(((..((((((........))))))..)))...,))))))))))}))....)))))))).))).))..))),)||.,.,..,.,},,).)))))).))))))}...,))))))..)))))))}......,,,,}}))))))))),}||||.,|{{{.({((...{{{{{,,.....,.))))).)))).}}),.,..}}})))),.||||....,{.(({....,.})),)),.))))....))))).},)))))..,.,,,))))))))))))))}.))))((((({.(((.{{.(((((({...})},}}}},|.|,||}.}||||||.{(((((...((((((((.....(((.((((.((...((((((.....)))))).....((((...))))))))))))).....)))))))).)))))}.((((((.(((({.{{......((((.((.(....).)).)))).(((((((((.((.,,......,,..}).))))}..)))),.(((((........))))).(((((.(((((.......))))).).))))}).)).))).)))))),}}}}}}},.,,}},{||,|..,...},.})))}}...||}||{{||||}...,))))))),..,)}}}..))))))))}}......)))}})))}.....,
Back