Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0037600
Sequence Length
656 nt
GC Content
0.4146
CAUCACUGCAAAACUUGAAAGAGCGUUAGAAAAAGUUGCUCCUCUUCUUCGUGAAAUUUUUGUAGACUUUGCCCCAUUCCUAUCUCGUACACUUCUUGGCAGUCAUGGACAAGAGCUAUUGAUAGAAGGCCUUGUUUGUAUGAAGUCCAGCACAUCUGUGGUUGAGCUUGUUAUGCUGCUUUGUUCUCAGGAAUGGCAAAACUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGACUUGCAUUUAUUGAGCUCAUCAAUGAAGGAAGAUUACUGUGCCAUGCUAUGAAGGACCAUAUAGUCCGUGUUGCAAAUGAAGCUGAGUUUAUUUUGAACAGACAAAGAGCCGAGGAUGUACAUAAACAUGCAGAGUUUGAGUCACAGUGUGCCCAAUAUGCUGCUGAUAGAAGAGAGGAAGAAAAGAUGUGUGACCAUCUUAUCAGUGCUGCUAAACAUCGAGAUCAUGUAACAGCAAAUCAGCUGAAACAGAAGAUUCUCAAUAUUCUCACAAAUAAACAUGGUGCUUGGGGAGCAGUUUCUCAUAGCCAAUUGCAUGAUUUCUGGCGUUUGGAUUACUGGGAAGAUGAUCUUCGUCGAAGGAGACGAUUUGUUCGCAAUGCAUUUGGCUCCACUCAUGCUGAAGCAUUGCUGAAAGCUGCAAUAGAAUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-171.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -184.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))((...........(((((((.(.....((..((((((.((((............((((((((((..............(((((.((((((((......(((((((.(((.((....)).))))))))))(((((((((.((((((....)).)))).)))..))))))..(((((((.(((...((((((......(((((....)))))(((..(((.(.((((((((.....))))))))).)))....)))))))))....))).((((......)))).((((..(((((((......)))))))..))))))))))).)))))))))))))........)))))))))).(((((((((((.....))))))).)))).))))))))))..))......).))))((((((.((((((.(.((((((.((((((((((((((((((......))))....((((...........))))............((((...((((((.....))))))..)))).)))))))))))).)).))))))).)))))).))))))....(((((......)))))....((((((((((.((((((.........))))))))))))).))).)))...........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....,|((...,{,.....{{{{{{,.,...,,{|,|((((({{((((............((((((((((........,{{...(((((.((((((((...,,,(((((((.(((.((....}).)))))))))}{{{||{(((.((((((....})}}))).))},.,}}})),.(((((((.(((,{.((((({....,,{{{{{....)))}|(({.,(((.(.((((((((.....))))))))).)))....))))))))).},.))}.((((......)))).((((.,((({{((,,...,)))}})),,))))))))))).)))))))))))))},,.....)))))))))).(((((((((((.....))))))).)))).)))))))))).,......,,,.}||,((((((.((((((.,.((((((.((((((((((((({((((......))))....{(({.,,........})))............{(((...((((((,...,))))))..)))}.}))))))))))).)).)))))),.)))))).)))))).,,.(((((......)))))....{{{(((((((.((((((.........))))))))))))).)),.}}),,,........))
Back