Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0038800
Sequence Length
672 nt
GC Content
0.4167
GCCUUGUUUGUAUGAAGUCCAGCACAUCUGUGGUUGAGCUUGUUAUGCUGCUUUGUUCUCAGGAAUGGCAAAACUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGACUUGCAUUUAUUGAGCUCAUCAAUGAAGGAAGAUUACUGUGCCAUGCUAUGAAGGACCAUAUAGUCCGUGUUGCAAAUGAAGCUGAGUUUAUUUUGAACAGACAAAGAGCCGAGGAUGUACAUAAACAUGCAGAGUUUGAGUCACAGUGUGCCCAAUAUGCUGCUGAUAGAAGAGAGGAAGAAAAGAUGUGUGACCAUCUUAUCAGUGCUGCUAAACAUCGAGAUCAUGUAACAGCAAAUCAGCUGAAACAGAAGAUUCUCAAUAUUCUCACAAAUAAACAUGGUGCUUGGGGAGCAGUUUCUCAUAGCCAAUUGCAUGAUUUCUGGCGUUUGGAUUACUGGGAAGAUGAUCUUCGUCGAAGGAGACGAUUUGUUCGCAAUGCAUUUGGCUCCACUCAUGCUGAAGCAUUGCUGAAAGCUGCAAUAGAAUAUGGCACGGAAGAAGAUGUAGUAAAGUCAAAGAAAACAUUCAGAAGUCAAGCAAUAGUGAACCAAAAUGCAGAGACAGAACUUAUGCUGGAAGGAGACGAUGAUGCAGUCAGUCUGCUACAGGAGAAAGAAAUUGACAACCUUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-166.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -179.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((.((.......(((((.((((((((((((((.....(((.(((((((.(((...((((((......(((((....)))))(((..(((.(.((((((((.....))))))))).)))....)))))))))....))).((((......)))).((((..(((((((......)))))))..))))))))))))))...(.((((......)))).).)))))))).))))))))))).......((.(((((((...............(((((......))))))))))))))...........((((((.(((..((((......))))..)))...)).))))..........)).))))))).)))((..((....((((((((.....((.(((((.((((((((((.((((((((((((....)).))))))(((((......)))))....((((((((((.((((((.........))))))))))))).))).((((((.......................))))))...........))))..)))))))))).)))))......(((....((((((......))).)))))).((.(((((((......))).)))).))...))....))))))))....))..))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((,(((({{....(((((((..(((((((((.((((((,,.,.((((.((.((((...((((((.......)))))))))).)).)))).|(((.(.((((((((.....))))))))).)))....((((((((({(({{...((((......)))).((((.{((({{((,,...,)))}})),})))}{{{...{{{{,..(.((((......)))).).}.))))..|||{(((((({.....}}}))}){|},,...,,,..................{{.((((((.{(((({.,.((((((.((((((((((((({((((......))))....{({,,{,,.......}}}}............{(((...{(((((,...,)))))}..)))}.}))))))))))).)).)))))),.}))))}.)))))).}).(((((......))))).,,.|||(((((((.((((((.........))))))))))))).}},..,,}},))))..}))))))))).....(((........}))...,,,..,.,)}....,.))))),....).)))),....,}}}}..,,,,.....))))))).,.,,||,,|.}}}}}),),))(({{...{((.........,,.....))).))))
Back