Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0039500
Sequence Length
610 nt
GC Content
0.4131
GAAUGGCAAAACUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGACUUGCAUUUAUUGAGCUCAUCAAUGAAGGAAGAUUACUGUGCCAUGCUAUGAAGGACCAUAUAGUCCGUGUUGCAAAUGAAGCUGAGUUUAUUUUGAACAGACAAAGAGCCGAGGAUGUACAUAAACAUGCAGAGUUUGAGUCACAGUGUGCCCAAUAUGCUGCUGAUAGAAGAGAGGAAGAAAAGAUGUGUGACCAUCUUAUCAGUGCUGCUAAACAUCGAGAUCAUGUAACAGCAAAUCAGCUGAAACAGAAGAUUCUCAAUAUUCUCACAAAUAAACAUGGUGCUUGGGGAGCAGUUUCUCAUAGCCAAUUGCAUGAUUUCUGGCGUUUGGAUUACUGGGAAGAUGAUCUUCGUCGAAGGAGACGAUUUGUUCGCAAUGCAUUUGGCUCCACUCAUGCUGAAGCAUUGCUGAAAGCUGCAAUAGAAUAUGGCACGGAAGAAGAUGUAGUAAAGUCAAAGAAAACAUUCAGAAGUCAAGCAAUAGUGAACCAAAAUGCAGAGACAGAACUUAUGCUGGAAGGAGACGAUGAUGCAGUCAGUCUGCUACAGGAGAAAGAAAUUGACAACCUUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -156.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 124.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.......)))))).......((((((.(((.(.((((((((.....))))))))).)))....((((((((((((((...((((......)))).((((..(((((((......)))))))..))))(((...(((((..(.((((......)))).).).))))..))).(((((((.....)))))))((......))...................((.((((((.((((((.(.((((((.((((((((((((((((((......))))....((((...........))))............((((...((((((.....))))))..)))).)))))))))))).)).))))))).)))))).)))))).)).(((((......)))))....((((((((((.((((((.........))))))))))))).))).......))))..))))))))))................(((((.(((....)))....(((..(((..............)))...)))....(((.(.(((..((.(((((((......))).)))).)).))).)..)))...)))))...)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{(((.,....,}|}}}}.......|(({{{.(((.(.((((((((.....))))))))}.}}}....((((((((((((((...((((......)))).((((.{((({{((,,...,)))}})),})))}{{{...{({({..(.((((......)))).).}.})))..|||{(((((((.....})))))){|,,,...,..,.................{{.((((((.((((((.,.((((((.((((((((((((({((((......))))....{(({.,,........})))............{(((...((((((,...,))))))..)))}.}))))))))))).)).)))))),.)))))).)))))).}}.(((((......))))).,,.|||(((((((.((((((.........))))))))))))).}},..,,,},))))..)))))))))).....{{{........|||,..{{,....})}....(((..(({....{,...,,...}))...},}....{({.(.(((..((.(((((((......))).)))).)).))).)..}}}...}))})...}))))).
Back