Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0043800
Sequence Length
711 nt
GC Content
0.4177
GUUCUUGCAUACACUGAGGGACUUCACGGAAAAUGGAUGUUCAGCGAGAUACGAGCUGUAUUUUCAAGACGUUACCUUCUACAAAACACUGCUUUGGAAGUAUUUAUGGCAAACCGAACCUCAGUUAUGUUUAAUUUCCCUGAUCAAGCAACAGUAAAAAAAGUUGUCUAUAGCUUGCCUCGGGUUGGAGUAGGGACCAGCUAUGGUCUGCCACAAGCCAGGAGGAUAUCAUUGGCCACUCCUCGACAGCUUUAUAAAUCUUCCAAUAUGACUCAGCGCUGGCAAAGAAGGGAAAUUUCAAACUUCGAAUAUUUGAUGUUCCUUAAUACUAUUGCAGGACGGACAUAUAAUGAUCUGAACCAAUAUCCAGUGUUUCCGUGGGUGUUAACCAACUAUGAAUCAGAAGAGUUGGACCUGACUCUUCCAGGAAACUUCAGGGAUCUAUCAAAGCCAAUUGGUGCUUUGAACCCCAAGAGAGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-173.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -188.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((((.((((((((((.((...(((((((.(.((((..........))))).)))))))..)).)))..((((((((......))...)))))).......((....))...))))))))))))...((((((((((.(((((...(((((......))).))...)))))..)))))..)))))..((((((....))))))...((((((((((((((.............)))))....(((((....(((((((..((((.(((((((((.(((.((((.(.(..((((..((.((((....)))).))((((((((...)))).))))(((((((...))).)))).......((((...((((((.((((.((((.((((((.(........).))))))...))))...)))))))))).....))))...(((((((........))))))).......))))..).).)))).)))..)))))..)))).)))))))))))....)))))..................................................))))))))).......))))((((.((...((((..(((...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))....)))).....(((((((......)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((((.(((((((.,{.,,..{({{,,{{{(,(({(,{,.,,,,,,,.}})))))))))..}}}))}..,{|||,........{|,|.|||}}}...,,,.||,...}}}..))))))))))))...((((((((((.(((((.,.((,,{......)),.))...)))))..)))))..))))).,((((((....)))))).,.((((((((((((({.......,.....,}},.....(((((....(((((((..((((.(((((((((.(((,{{{(((((,.,.(((((.........})))).})))))}....,|,}}},.({.(((((((...))).))))..}},,,|,||,,,({((((.({((,{{{,.{{{{{{.,......,,|,||||}}...}))),,,))}}))))}},,..(((.,...(((((((,.....,.)))))))..))}..}}}.,((,({{....}))),)))))..)))).)))))))))))....))))).............{{{{{....,}}}}.....................})))))))))).......))))((((.((...{(((,,(({...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..)))))}})....)))),....{((((((......)))))))))))))
Back