Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0043900
Sequence Length
864 nt
GC Content
0.4155
GUUCUUGCAUACACUGAGGGACUUCACGGAAAAUGGAUGUUCAGCGAGAUACGAGCUGUAUUUUCAAGACGUUACCUUCUACAAAACACUGCUUUGGAAGUAUUUAUGGCAAACCGAACCUCAGUUAUGUUUAAUUUCCCUGAUCAAGCAACAGUAAAAAAAGUUGUCUAUAGCUUGCCUCGGGUUGGAGUAGGGACCAGCUAUGGUCUGCCACAAGCCAGGAGGAUAUCAUUGGCCACUCCUCGACAGCUUUAUAAAUCUUCCAAUAUGACUCAGCGCUGGCAAAGAAGGGAAAUUUCAAACUUCGAAUAUUUGAUGUUCCUUAAUACUAUUGCAGGACGGACAUAUAAUGAUCUGAACCAAUAUCCAGUGUUUCCGUGGGUGUUAACCAACUAUGAAUCAGAAGAGUUGGACCUGACUCUUCCAGGAAACUUCAGGGAUCUAUCAAAGCCAAUUGGUGCUUUGAACCCCAAGAGAGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAGGAACUAAUUCCAGAGUUCUACUACCUACCAGAGAUGUUUGUCAACAGUAAUGGAUAUAAUCUUGGAGUCAGAGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-216.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -235.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 220.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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