Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0044700
Sequence Length
490 nt
GC Content
0.4102
GAGGAUAUCAUUGGCCACUCCUCGACAGCUUUAUAAAUCUUCCAAUAUGACUCAGCGCUGGCAAAGAAGGGAAAUUUCAAACUUCGAAUAUUUGAUGUUCCUUAAUACUAUUGCAGGACGGACAUAUAAUGAUCUGAACCAAUAUCCAGUGUUUCCGUGGGUGUUAACCAACUAUGAAUCAGAAGAGUUGGACCUGACUCUUCCAGGAAACUUCAGGGAUCUAUCAAAGCCAAUUGGUGCUUUGAACCCCAAGAGAGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-112.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -122.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..............)))((.....(((((....(((((((..((((.(((((((((.(((.((((.(.(..((((..((.((((....)))).))((((((((...)))).))))(((((((...))).)))).......((((...((((((.((((.((((.((((((.(........).))))))...))))...)))))))))).....))))...(((((((........))))))).......))))..).).)))).)))..)))))..)))).)))))))))))....)))))....................................(((((.....((((((((((.(((((((........)))....((.....(((...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))....)).)))).))))))...)))).....)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..............)))((..{{,(((((....(((((((..((((.(((((((((.(((,{{{(((((,.,.(((((..,......})))).})))))}....,|,}}},.({.(((((((...))).))))..}},,,|,||,,,({((((.({((,{{{,.{{{{{{.,......,,|,||||}}...}))),,,))}}))))}},,..(((.,...(((((((,.....,.)))))))..))}..}}}.,({,({{....}))),)))))..)))).)))))))))))....))))).............,,{{,....,,}}}....,,,..,,{{{.......,,((((({.((((,,,..{,....|||,...,{{....,,,...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..)))))))),...))})))).}))))),|}}},...,}})})))..))
Back